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邵卫

作品数:2 被引量:2H指数:1
供职机构:南京医科大学公共卫生学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金江苏高校优势学科建设工程项目更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇前列腺
  • 1篇前列腺癌
  • 1篇腺癌
  • 1篇甲基化
  • 1篇复发
  • 1篇癌复发
  • 1篇GSTP1
  • 1篇GWAS

机构

  • 2篇南京医科大学

作者

  • 2篇储海燕
  • 2篇马高祥
  • 2篇张正东
  • 2篇王美林
  • 2篇邵卫

传媒

  • 1篇科学技术与工...
  • 1篇中国肿瘤外科...

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2016
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
GSTP1基因表达及甲基化与前列腺癌复发风险研究被引量:2
2016年
目的探究谷胱苷肽S转移酶P1(glutathione S transferase pi,GSTP1)基因表达及甲基化水平与前列腺癌复发风险的关系。方法利用癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,分析前列腺癌组织中GSTP1基因表达及甲基化水平,采用t检验、单因素及多因素logistic回归探讨GSTP1基因与前列腺癌复发的关联性。结果前列腺癌GSTP1基因表达量与前列腺癌的复发显著相关,校正后的相对危险度(odds ratio,OR)为0.63,P=0.039;此外,相对于非复发组,GSTP1基因启动子区有5个CpG位点在复发组中均呈现高甲基化状态,且能显著增加前列腺癌复发风险。结论 GSTP1基因表达与前列腺癌复发显著相关,可能是通过GSTP1启动子区CpG位点的高甲基化进而减低GSTP1基因的表达,从而影响前列腺癌的复发。
邵卫葛雨秋马高祥储海燕王美林张正东
关键词:前列腺癌复发GSTP1甲基化
基于IMPUTE2的全基因组关联性研究的基因型填补
2018年
多数全基因组关联性研究(GWAS)采用不同的分型芯片,导致遗传变异位点的数目及选择准则不同。基因型填补可以依据已有的基因分型数据,对未分型的位点进行填补。在应用IMPUTE2软件对基因型和表型数据库(db Ga P)中胃癌GWAS数据进行全基因组填补,以详细介绍全基因组填补的原理和过程。以第九号染色体为例,使用1000 Genome Project模板介绍全基因组填补的过程,包括填补前的质量控制、Pre-phasing、填补过程、填补的质量评估及填补后的关联性分析。第九号染色体在填补前有21 033个位点;而在填补后有1 630 406个SNP;其中INFO>0.3的SNP位点有817 494个;而填补质量较高(INFO>0.5)的位点数目有584 755个。IMPUTE2软件可以快速准确的对未分型的基因型进行填补,从而可以将多个GWAS数据整合到相同的位点数和密度上,再进行联合分析可以提高检验的把握度以便发现新的遗传易感性位点。
辛俊逸葛雨秋邵卫杜牧龙马高祥储海燕王美林张正东
关键词:GWAS
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