刘俊杰
- 作品数：72 被引量：710H指数：14
- 供职机构：中国科学院东北地理与农业生态研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院战略性先导科技专项中国科学院“百人计划”更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程环境科学与工程更多>>
- 自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性研究进展被引量：8
- 2011年
- 过去的20多年,伴随着分子生物学技术在环境微生物研究中的应用,环境中细菌和真菌群落基因多样性及与其生存环境间的关系逐渐被揭示,但对于地球上广泛存在且数量巨大的生命体-噬菌体基因多样性研究还很少。本文以编码T4型噬菌体主要壳蛋白基因g23为目标,综述了近年来T4型噬菌体在海洋、湖泊和稻田中基因多样性的研究进展。研究结果表明T4型噬菌体g23基因分布与其生存环境关系很大,许多g23基因按获取环境不同划分为几个新类群。同时文中也指出了针对环境中T4型噬菌体g23基因研究应该注意的几点问题及未来的研究发展趋势。
- 王光华刘俊杰Makoto Kimura
- 关键词：噬菌体稻田
- 一株枯草芽孢杆菌噬菌体Bac-S的生物学特性及全基因组序列分析
- 2024年
- 【目的】枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)施用于土壤可促进植物生长,但针对土壤中枯草芽孢杆菌噬菌体的研究鲜有报道,因此从土壤中分离出枯草芽孢杆菌噬菌体,并深入研究其生物学特性及基因组特征,不仅有助于枯草芽孢杆菌的实际应用,还能丰富枯草芽孢杆菌噬菌体相关生物信息库。【方法】以枯草芽孢杆菌SM13为宿主,从土壤中分离培养出一株噬菌体Bac-S,对其进行生物学特性测定、全基因组序列特征、基因功能注释和系统发育分析。【结果】透射电镜显示,噬菌体Bac-S头部直径约为43 nm,尾部极短无法测量;该噬菌体的最佳感染复数(multiplicity of infection,MOI)为0.1;一步生长曲线显示,潜伏期约为10 min,裂解量为30 PFU/cell;宿主谱广泛,能实现跨属侵染;测序结果显示其基因组长度为150019 bp,G+C含量为42.6%;该噬菌体共有237个开放阅读框(open reading frames,ORFs),BLASTn比对显示该噬菌体与NCBI数据库中其他芽孢杆菌噬菌体相似性较高。【结论】从土壤中分离出了一株具有潜伏期短、宿主谱广泛、耐受高温、不耐紫外光照射的特征枯草芽孢杆菌噬菌体,拓宽了对枯草芽孢杆菌噬菌体的认知。
- 赵欣卓王鑫淼王丽艳吴楠李喜梅于镇华荆瑞勇刘俊杰
- 关键词：枯草芽孢杆菌噬菌体生物学特性基因组
- 一种巨大芽孢杆菌
- 本发明公开了一种巨大芽孢杆菌，所述巨大芽孢杆菌的16S rDNA序列长度为1430bp，所述巨大芽孢杆菌的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示；本发明分离纯化出的巨大芽孢杆菌是一种兼具分泌IAA能力、解磷能力和ACC脱...
- 王光华于镇华刘俊杰金剑刘晓冰
- 大气CO_(2)浓度和温度升高对玉米农田黑土碳库及细菌群落的影响
- 2024年
- 为研究气候变化对东北农田黑土碳库和相关微生物组特征的影响,本文以东北春玉米连作的黑土为研究对象,利用原位开顶式气候室(OTC)模拟长期大气CO_(2)浓度和温度升高,利用土壤物理分级技术将土壤有机碳(SOC)分组为颗粒(POC)和矿质结合有机碳(MOC),并通过16S rRNA高通量测序分析土壤细菌微生物群落结构,探讨气候变化影响黑土碳库稳定性的微生物作用机制。结果表明,与CK相比,连续12年大气CO_(2)浓度和温度升高没有改变SOC总量,但影响其周转率。温度升高显著增加了细颗粒有机碳(fPOC)的含量,CO_(2)和温度同时升高降低了MOC含量。CO_(2)浓度升高并未影响fPOC和MOC含量。温度或CO_(2)浓度升高显著改变了细菌群落结构,温度升高增加苔藓杆菌属(Bryobacter)的相对丰度,CO_(2)浓度升高增加了革兰氏阴性菌硝化螺旋菌属(Nitrospirae)的丰度。长期大气CO_(2)浓度和温度同时升高增加硝化螺旋菌属(Nitrospirae)的丰度,该菌属丰度的增加可能会进一步影响SOC稳定性。
- 司马鑫琪李彦生于镇华刘俊杰顾海东刘居东王光华吴俊江苗淑杰乔云发金剑
- 关键词：土壤有机碳微生物群落
- 一种用于在秸秆堆腐水分调控的喷洒结构
- 本发明提供一种用于在秸秆堆腐水分调控的喷洒结构，涉及秸秆堆腐技术领域，包括：秸秆支撑组件；所述密封组件安装在秸秆支撑组件上；所述水分调控组件安装在秸秆支撑组件上；所述喷洒组件安装在水分调控组件的顶部；所述吸水组件安装在秸...
- 陈雪丽刘俊杰 李伟群 万书明 王晓军 赵月 张亦弛 张磊 常本超
- 一种新的噬菌体基因多样性分子标记基因phoH研究进展
- 2017年
- 噬菌体作为结构最简单的生命体,不仅在调节寄主群落结构、遗传物质的水平移动方面作用巨大,同时也被证明在元素生物地球化学循环中具有非常重要的地位。尽管噬菌体的重要性越来越引起研究者的关注,但遗憾的是目前对于噬菌体基因多样性的研究还存在很大的局限性,发现并验证一种适合于研究噬菌体基因多样性的分子标记基因是环境病毒生态学研究的热点之一。介绍了一种新的分子标记基因-噬菌体辅助代谢磷酸盐调节基因pho H,并综述了近年来利用该基因揭示海洋海水、稻田田面水和沙漠石下生物中噬菌体基因多样性的研究进展。结果表明,噬菌体pho H基因分布与其生存环境关系密切,按获取环境不同pho H基因被划分为多个类群。最后对噬菌体pho H基因未来研究方向给予展望。
- 李想孙岩王新珍刘俊杰王光华
- 关键词：噬菌体多样性稻田
- 芽孢杆菌在农业生产中的应用被引量：42
- 2019年
- 芽孢杆菌是一类好氧或兼性厌氧,能产生抗逆性芽孢的革兰氏阳性细菌。具有种类多,遗传稳定性强,耐高温和抗逆性强等特性。芽孢杆菌是一类重要的资源微生物,包含许多具有特殊功能的菌株,可用于防治植物病虫害,溶解土壤中难溶的含磷化合物等,在工业、农业及医学等科学领域有着十分广泛的应用价值。本文介绍了芽孢杆菌的主要种类、作用机制和不同芽孢杆菌的功能,分析了目前芽孢杆菌应用在农业生产中所存在的问题及今后研究发展的趋势。
- 崔晓徐艳霞徐艳霞刘俊杰郭兆奎
- 关键词：促生解磷
- 以消除寄主DNA污染用于水体环境病毒宏基因组解析的方法
- 以消除寄主DNA污染用于水体环境病毒宏基因组解析的方法，本发明属于生物技术领域，它为了解决水体环境病毒宏基因组研究中病毒浓缩液中存在少量的寄主细胞，影响测序结果的问题。水体环境病毒宏基因组解析的方法：一、水样经纱布过滤，...
- 王光华孙岩王新珍刘俊杰
- 东北旱田土壤中Anabaena伴生细菌的分离与鉴定被引量：3
- 2020年
- [背景]鱼腥藻(Anabaena)在农田土壤中广泛分布,具有固碳和固氮功能。明确伴生细菌与蓝细菌的关系,对提高农田土壤中Anabaena的功能具有重要意义。[目的]从东北不同旱田土壤中分离Anabaena sp.PCC7120的伴生细菌,初步鉴定伴生细菌的分类归属,推测伴生细菌的功能,为明确旱田土壤蓝细菌与伴生细菌的关系提供数据支撑。[方法]采用平板分离、PCR-DGGE、克隆测序技术测定并分析不同旱田土壤中伴生细菌的16S rRNA基因序列,确定伴生细菌的分类地位。[结果]PCR-DGGE图谱显示东北旱田14个土样中分离获得Anabaena sp.PCC7120伴生细菌数量和种类不同;PCR-克隆测序获得伴生细菌的16S rRNA基因序列37条,可鉴定到种水平的菌株36条,主要归为鞘氨醇盒菌属(Sphingopyxis)、贪噬菌属(Variovorax)、黄杆菌属(Flavobacterium)和红球菌属(Rhodococcus)等,推测这些伴生细菌具有适应寡营养、富集微量元素、清除毒素等功效。[结论]东北旱田不同土壤中Anabaena sp.PCC7120伴生细菌种类和数量各异,这些伴生细菌主要隶属于Sphingopyxis、Variovorax、Flavobacterium和Rhodococcus等属。
- 荆瑞勇王丽艳孙强刘俊杰刘居东金剑刘晓冰王光华
- 关键词：蓝细菌伴生细菌
- 多核铜槲皮素配合物对DNA的作用研究被引量：1
- 2018年
- 应用紫外光谱、凝胶电泳法实验探究了3种多核铜槲皮素配合物与DNA的作用形式及对DNA的裂解能力。结果显示,3种配合物对DNA的作用效果强于槲皮素,配合物通过插入、静电、剪切多种形式与DNA作用,具有高效的DNA断裂活性。
- 王继群魏然茹宋月刘俊杰程秀珍李婧
- 关键词：槲皮素金属配合物紫外吸收
