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红色毛癣菌不同生长阶段的基因表达谱分析被引量：3: 2011年; 红色毛癣菌是最重要的浅表感染真菌.目前对红色毛癣菌分子和遗传学方面的研究还比较有限.应用cDNA芯片技术对红色毛癣菌不同生长阶段的基因表达谱进行了分析,获得了2044个在不同生长阶段差异表达的基因.聚类分析表明,这些基因可以分为3种不同的表达模式.本研究验证了先前的结论,即在红色毛癣菌中存在预储存的mRNA.对不同生长状态下转录谱和基因功能分析表明,糖酵解过程中的一些重要的酶具有相似的表达模式,说明在红色毛癣菌的生长过程中,这些酶可能具有共同的调控模式.同时,在红色毛癣菌生长过程中,一些参与诸如小GTPase调控、cAMP依赖的调控途径以及MAPK信号传导途径的基因表达也发生了变化.尽管这些基因和相关的调控途径在红色毛癣菌中的具体生物学功能还不清楚,但它们可能在其生长过程中起了调控作用.; 徐星晔刘涛冷文川董杰薛颖杨汉春金奇; 关键词：红色毛癣菌基因表达谱 CDNA 芯片

氟胞嘧啶作用后的红色毛癣菌表达谱特征分析被引量：2: 2009年; 红色毛癣菌是最常见的人类浅部真菌病病原体之一,可引起皮肤和指甲慢性感染.为研究抗真菌药物作用下特异表达的基因,用cDNA芯片技术分析了5-氟胞嘧啶作用下的红色毛癣菌表达谱.从红色毛癣菌表达序列标签文库中挑选基因制备cDNA芯片,测定5-氟胞嘧啶的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC),进行芯片杂交和数据分析,选取有代表性的7个基因用实时定量反转录多聚酶链反应技术(real-time reverser transcription polymerase chain reaction,Real-timeRT-PCR)进行验证.数据分析表明,有474个基因发生了差异性表达,196个基因表达上调,278个基因表达下调.核酸代谢途径中的CDC21,核酸转录因子E2F1,RNA代谢途径中的SGN1,RIM4和NOP1等基因出现明显下调表达.其他参与了信号转导、分子伴侣活性、离子转运、次级代谢途径、氨基酸转运、脂质转运和潜在耐药机制等作用途径的基因表达也发生相应改变.所选基因的Real-timeRT-PCR结果验证了芯片结果的可信性.本研究得到了第1个5-氟胞嘧啶作用下的红色毛癣菌表达谱,为进一步研究5-氟胞嘧啶的药物作用机制和耐药机理提供了有价值的信息.; 赵蓉宾文刁有江杨剑刘涛彭俊平金奇; 关键词：5-氟胞嘧啶

金黄色葡萄球菌滤液中凝固酶组分分析: 2007年; 目的对金黄色葡萄球菌滤液制剂中凝固酶进行纯化,并对其性质及作用进行分析。方法用分子筛层析等方法纯化凝固酶,用HPLC、光谱等方法对其进行纯度和性质分析。用双向免疫扩散试验和T淋巴细胞增殖试验检测其生物学特性。结果经纯化的凝固酶纯度达97%以上,相对分子质量约为350000,含17种氨基酸,主要紫外吸收峰出现在260nm左右,α-螺旋含量占27.3%,组分中含糖约18.1%,T淋巴细胞增殖试验和双向免疫扩散法证明纯化的凝固酶具有生物学活性。结论金黄色葡萄球菌滤液中凝固酶为一类糖与蛋白复合物,具有抗原活性,可能在金黄色葡萄球菌滤液的功效中发挥作用。; 张骞林琳刘涛盛军; 关键词：金黄色葡萄球菌滤液凝固酶生物学活性

红色毛癣菌孢子期与萌芽期基因表达比较分析被引量：3: 2007年; 红色毛癣菌(Trichophyton rubrum)是最常见和流行范围最广的一种浅部感染真菌,它的孢子萌发是和致病密切相关且非常重要的发育过程.为研究出芽时生理、生化以及细胞学方面的改变,从红色毛癣菌cDNA文库中选取了3364条有明确功能注释的表达序列标签(ESTs)制备了cDNA芯片,对孢子期及萌芽期进行了基因表达变化的研究.数据分析表明,孢子萌发过程中有335个基因表达上调,主要是翻译、修饰蛋白及结构蛋白.细胞壁和细胞膜组分大量合成,暗示它们是细胞形态发生的基础.二组分信号转导系统的组成部分表达上调,推测它可能在红色毛癣菌孢子萌发过程中起着重要作用.各种代谢途径表达旺盛,特别是参与糖酵解和氧化磷酸化的基因基本都上调,说明在氧气和葡萄糖充足的环境下,孢子主要通过有氧呼吸获得能量.本研究对了解红色毛癣菌孢子萌发过程中基因表达的变化及其信号转导和代谢特点提供了重要线索,对其他浅部真菌的研究也具有重要意义.; 杨莉王玲玲彭俊平于录刘涛冷文川杨剑陈立宏张文亮张骞齐义鹏金奇; 关键词：孢子 CDNA芯片基因表达

红色毛癣菌孢子中预存储mRNA的功能: 2007年; 目的分析红色毛癣菌(Trichophyton rubrum)孢子中预存储mRNA的功能。方法通过分析560个孢子中预存储基因与NR和GO数据库中其他线性真菌基因的同源性,对这些基因的功能以及可能参与的生理过程进行探讨。结果在孢子中的560个基因中,有177个与烟曲霉、构巢曲霉、粗糙链孢菌和红色毛癣菌4类线性真菌基因有同源性,并发现一些可能参与孢子萌发的重要基因及相关的调控途径。结论为进一步研究红色毛癣菌孢子中预存储基因的作用以及孢子萌发的机理提供了依据。; 张骞刘涛盛军王玲玲; 关键词：红色毛癣菌孢子

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刘涛