彭俊平
- 作品数：38 被引量：73H指数：5
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院病原生物学研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 结核分枝杆菌耐吡嗪酰胺分子机制研究被引量：13
- 2007年
- 吡嗪酰胺(PZA)是结核病短程化疗中的一线抗结核药物,由吡嗪酰胺酶转换成为活性形式吡嗪酸而生效。吡嗪酰胺酶由pncA基因编码,pncA基因突变会导致该酶活性丧失,与PZA耐药性产生有关。为了进一步明确PZA耐药性产生的基因学基础和PZA耐药株的pncA基因突变率,对中国100株结核分枝杆菌临床分离株进行了DNA序列测定,其中85株为PZA耐药株,15株为PZA敏感株。PZA耐药株有27%(23/85)发生了pncA基因突变,从而导致吡嗪酰胺酶基本氨基酸序列的改变,突变分布在pncA基因开读框架17-546位的核苷酸。其中有一株突变位于pncA基因的调节区域-11位处。同时发现20%(3/15)pncA敏感株也发生了pncA基因突变。敏感株发生突变可能是由于PZA敏感性实验不准确或存在其它耐药机制。实验表明,pncA基因突变是PZA耐药的主要机制之一,中国PZA耐药临床分离株尚存在其它耐药分子机制。
- 姜英彭俊平杨帆余黎王玉琳金奇
- 关键词：结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药DNA序列分析
- 志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群基因组组成与进化分析被引量：1
- 2005年
- 利用比较基因组杂交法(comparativegenomichybridization,CGH)对志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析,结果显示,该亚群基因组的“共有骨架”包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs.比对K12基因组,该亚群所有菌株基因组共同缺失ORFs为199个,主要涉及外膜蛋白编码基因和O-抗原合成相关基因,而属于亚群特异性的ORFs主要以噬菌体基因和未知功能ORFs为主,一些参与铁离子代谢、运输和Ⅱ型分泌系统基因在大多数的鲍氏菌株中存在.以比较基因组杂交法得到的进化分析显示:鲍氏亚群18个血清型代表菌株可分为4组,其中13型与其他菌株有较大的差异.这种分组结果与某些代谢相关的基因分布情况存在对应关系.通过对该亚群“共有骨架”、缺失基因和株特异基因,以及进化分类等方面的分析,以期探索该亚群基因组的进化规律,并为志贺氏菌属鲍氏亚群的致病机理、疫苗研制和药物开发等方面的研究提供重要线索.
- 张笑冰王璟彭俊平杨娥宾文杨剑董杰孙立连徐星晔金奇
- 关键词：比较基因组杂交比较基因组进化分析志贺氏菌亚群
- 红色毛癣菌孢子期与萌芽期基因表达比较分析被引量：3
- 2007年
- 红色毛癣菌(Trichophyton rubrum)是最常见和流行范围最广的一种浅部感染真菌,它的孢子萌发是和致病密切相关且非常重要的发育过程.为研究出芽时生理、生化以及细胞学方面的改变,从红色毛癣菌cDNA文库中选取了3364条有明确功能注释的表达序列标签(ESTs)制备了cDNA芯片,对孢子期及萌芽期进行了基因表达变化的研究.数据分析表明,孢子萌发过程中有335个基因表达上调,主要是翻译、修饰蛋白及结构蛋白.细胞壁和细胞膜组分大量合成,暗示它们是细胞形态发生的基础.二组分信号转导系统的组成部分表达上调,推测它可能在红色毛癣菌孢子萌发过程中起着重要作用.各种代谢途径表达旺盛,特别是参与糖酵解和氧化磷酸化的基因基本都上调,说明在氧气和葡萄糖充足的环境下,孢子主要通过有氧呼吸获得能量.本研究对了解红色毛癣菌孢子萌发过程中基因表达的变化及其信号转导和代谢特点提供了重要线索,对其他浅部真菌的研究也具有重要意义.
- 杨莉王玲玲彭俊平于录刘涛冷文川杨剑陈立宏张文亮张骞齐义鹏金奇
- 关键词：孢子CDNA芯片基因表达
- 一种新型冠状病毒SARS-CoV-2检测和分子分型方法及试剂盒
- 本发明提供了一种新型冠状病毒SARS‑CoV‑2检测和分子分型方法及试剂盒。该方法利用一步法多重RT‑PCR与HRM分析联用，同时实现SARS‑CoV‑2的检测和分型。本发明的检测方法，包括以下步骤：1)样本核酸提取；2...
- 彭俊平修乐山孙立莹
- 文献传递
- 核酸检测技术应用于淋球菌耐药监测:机遇与挑战被引量：1
- 2019年
- 淋球菌感染所致淋病是最常见的性传播疾病之一。随着抗菌药物的不合理使用以及淋球菌的不断变异,淋球菌的耐药问题在全球范围内已经十分严重。目前,伴有多重耐药的菌株快速增多,临床亟需淋球菌药物敏感性检测快速准确的方法,以为淋病的有效防治提供支撑。近年来,核酸检测方法因基耗时短,自动化等优点为淋球菌及耐药监测领域提供了新的手段和机遇,今后有望取代培养法成为淋球菌药物敏感性检测的首选方法。其中,全基因组测序技术可提供全面的耐药信息,可进行进化分析,在耐药监测领域显示出了更高效的性能以及广阔的应用前景。但是,核酸检测方法在淋球菌耐药检测方面仍面临着交叉反应、依赖设备等重重挑战。总之,核酸检测方法在淋球菌耐药监测相关领域已经取得一定的进展,但仍面临重大挑战,我们应该克服现有的挑战并且不断开发可用于淋球菌药物敏感性检测的新型核酸检测技术。
- 李雅梅彭俊平
- 关键词：耐药核酸检测技术
- 一种对淋球菌耐药基因进行多重快速测序的方法
- 本发明属于分子生物学检测技术领域，涉及一种对细菌的耐药基因进行多重测序的方法，特别涉及一种使用纳米孔测序技术对淋病奈瑟菌的耐药基因进行快速测序的方法。同时，本发明还涉及一种检测淋球菌耐药基因的试剂盒，该试剂盒中包含SEQ...
- 张驰彭俊平
- 文献传递
- CRISPR/Cas核酸检测技术的研究进展
- 2023年
- CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)技术作为强大的基因编辑及基因调控工具,在生命科学研究、生物技术产业、基因治疗等领域得到了广泛的发展与应用.近些年来,基于Cas蛋白(CRISPRassociated protein)特异性及非特异性的核酸切割活性,CRISPR技术在核酸检测领域展现了其简单快速、高效特异的特点,以及在即时检测(point-of-care testing,POCT)领域的应用潜能,可满足临床早期治疗及床旁监护所需的快速诊断需求.根据Cas酶的不同活性(顺式切割活性和反式切割活性),本文将基于Cas酶的核酸检测技术分为两大类,分别为CRISPR/Cas9系统和CRISPR/Cas12,Cas13,Cas14系统,并阐述了它们各自的工作原理.此外,本文还详细综述了CRISPR/Cas系统与多信号传感器的联合应用,总结了CRISPR/Cas核酸检测技术所存在的缺陷及面临的挑战,并对其未来的发展进行了展望.
- 赵子渊彭俊平
- 关键词：核酸检测
- 一种淋病奈瑟菌耐药位点多重检测方法及试剂盒
- 本发明属于分子生物学检测技术领域，涉及一种耐药位点的检测方法，特别涉及一种多重检测淋病奈瑟菌耐药位点的方法及其试剂盒。该发明所提供的用于多重检测淋病奈瑟菌耐药位点的专用引物，是选取与二联用药(头孢曲松和阿奇霉素)耐药相关...
- 彭俊平修乐山
- 文献传递
- DNA微阵列在抗生素作用机制研究方面的应用
- 科学技术的迅猛发展促使生命科学研究正由结构基因组时代逐渐转向功能基因组时代.功能基因组学研究引进了全局性实验方法以利用结构基因组学所提供的海量信息来研究基因的功能，它以高通量、大范围试验的方法学与对结果的统计学分析相结合...
- 彭俊平
- 基因芯片技术在病毒学研究中的应用现状被引量：8
- 2003年
- 彭俊平金奇
- 关键词：基因芯片病毒学致病机制
