马晓萌
- 作品数：12 被引量：50H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目国家肉羊产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联被引量：6
- 2016年
- 【目的】基于前期绵羊肉用性状GWAS研究结果,旨在探讨RIPK2基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响,找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记,同时对GWAS结果进行验证。【方法】在343只乌珠穆沁绵羊试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成池DNA,设计引物对RIPK2基因外显子及其上下游1 000bp的调控区进行PCR扩增,PCR产物检测为目的条带后测序。使用DNAMAN和Chromas2软件对测序峰图进行分析,采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点及前期GWAS得到的SNP位点进行基因型分型。使用Haploview软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用SPSS（22.0）软件进行RIPK2基因SNP位点与生长性状间的关联分析。【结果】共发现了4个多态位点,A5536G的同义突变rs01位于第四外显子内,在该位点检测到三种基因型,AA基因型频率为0.42,AG基因型频率为0.45,GG基因型频率为0.13,优势等位基因为A,其频率为0.65;在第七外显子上检测到T8952C错义突变rs02,在该突变位点检测到3种基因型,其中TT基因型频率为0.82,TC基因型频率为0.16,CC基因型频率为0.02,T为优势等位基因,基因频率为0.9;在第十外显子检测到T2836C的突变rs05,在该位点检测到两种基因型TT和CC,没有检测到杂合子基因型,TT基因型频率为0.25,CC基因型频率为0.75;上游调控区发现一个G5181C的突变rs30,有3种基因型,其中GC基因型频率为0.50,CC基因型频率为0.18,GG基因型频率为0.32,G为优势等位基因,其频率为0.58;GWAS得到的SNP位点是T4456C,在本研究中被命名为rs34,在该位点有3种基因型,其中TT基因型频率为0.49,TC基因型频率为0.37,CC基因型频率为0.14,优势等位基因T的频率为0.68。χ^2适合性检验发现,除rs34位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0.05）。rs02位点处于低度多态（PIC〈0.25）,
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- 关键词：生长性状多态性
- 畜牧业新常态下肉羊生产回顾与展望被引量：3
- 2015年
- 2014年,中央经济工作会议宣布我国经济从高速增长转为中高速增长的经济新常态。农业是国民经济的重要组成部分,其特殊的战略意义决定了农业在国民经济中永恒的基础地位。畜牧业作为农业的重要支柱,也将全面步入新常态发展阶段。本文根据最新的畜牧业统计资料,综述2013年肉羊生产形势,并对进入畜牧业新常态下肉羊生产作出预测与展望。
- 张莉马晓萌杜立新
- 关键词：肉羊生产
- 肌细胞增强因子2B基因在人和动物中的研究进展（英文）
- 2016年
- 肌细胞增强因子2B(MEF2B)基因属于肌细胞增强因子2(MEF2)基因家族成员,广泛表达于人和动物的肌肉和神经组织中,在肌肉生成、神经系统发育和分化、肝脏纤维化等方面具有重要的作用,作者从MEF2B基因的结构、组织分布、生物学功能及研究进展等方面对该基因进行了综述。
- 马晓萌张莉杜立新
- 关键词：生物学功能
- 一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法
- 本发明公开了一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法。本发明提供的方法包括如下步骤：检测待测绵羊的基因组DNA中rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型...
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- 文献传递
- 一种基于rs417014745 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法
- 本发明公开了一种基于rs417014745 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法。本发明提供的方法包括如下步骤：检测待测绵羊的基因组DNA中rs417014745 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型...
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- 绵羊CLPG和MSTN基因多态性及其与生长性状的关联分析被引量：10
- 2016年
- 试验旨在探究CLPG(Callipyge)与MSTN(Myostatin)基因作为绵羊生长性状候选基因的可能性,调查与绵羊生长性状相关的分子遗传标记。本试验以133只澳洲白羊×杜泊羊×湖羊杂交绵羊为研究对象,利用PCR产物直接测序及PCR-RFLP技术检测CLPG与MSTN基因的单核苷酸多态性,然后通过SPSS 22.0软件GLM统计模型分析多态位点不同基因型及聚合基因型与绵羊生长性状的关联性。测序结果表明,CLPG基因STS序列232bp处检测到C→T突变位点C1,MSTN基因3′UTR区检测到G→A突变位点M1。PCR-RFLP分析显示,C1位点表现为2种基因型:CC和CT;M1位点表现为2种基因型:GG和GA。关联分析表明,C1位点与绵羊背膘厚和眼肌面积显著或极显著相关(P<0.05;P<0.01),M1位点与绵羊体重、管围、背膘厚和眼肌面积显著或极显著相关(P<0.05;P<0.01)。聚合基因型对体重、背膘厚和眼肌面积影响极显著(P<0.01)。研究揭示CLPG与MSTN基因多态性及其聚合基因型对绵羊生长性状具有显著影响,C1和M1位点可以考虑作为绵羊生长性状的有效遗传标记。
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- 关键词：MSTN基因多态性生长性状
- 一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法
- 本发明公开了一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法。本发明提供的方法包括如下步骤：检测待测绵羊的基因组DNA中rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型...
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- 文献传递
- 绵羊季节性繁殖相关基因TSHR外显子多态性研究被引量：6
- 2016年
- 旨在研究乌珠穆沁羊与湖羊这两种具有不同繁殖性能和发情周期绵羊的促甲状腺激素受体（Thyroid stimulating hormone receptor,TSHR）基因外显子区遗传变异特性及其构建的单倍型在品种间的分布和对mRNA和蛋白质二级结构的影响,为进一步揭示其对TSHR表达调控的影响及表型效应奠定基础。本研究采用直接测序的方法对中国蒙古系2个绵羊品种共172个个体TSHR基因的遗传变异情况进行分析。共发现了6个突变位点,独立性卡方检验发现SNP1、SNP3、SNP4和SNP5 4个多态位点的基因型在两个绵羊群体间的分布存在极显著差异（P〈0.01）,其中SNP5为错义突变,其余为同义突变;对这4个位点进行连锁不平衡分析发现,SNP3和SNP4两个位点完全连锁,其余位点两两之间存在不同程度连锁关系;生物信息学分析发现不同的单倍型使TSHR基因的mRNA二级结构发生改变,SNP5使受体蛋白的二级结构发生改变。结果提示：（1）TSHR基因外显子区存在4个在两个绵羊品种中具有潜在生物学功能和表型效应的突变位点,可组成H1～H6共6种单倍型,其中H1（CGCC）和H4（TTTG）分别在乌珠穆沁羊和湖羊群体中为优势单倍型,这可能与这两种绵羊不同的发情周期有关。（2）外显子区SNP5位点突变影响mRNA和蛋白质二级结构的稳定性,可能是具有潜在表型效应的重要功能位点。
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- 关键词：绵羊季节性繁殖
- 肌细胞增强因子2B基因在人和动物中的研究进展被引量：1
- 2015年
- 肌细胞增强因子2B(MEF2B)基因属于肌细胞增强因子2(MEF2)基因家族成员,广泛表达于人和动物的肌肉和神经组织中,在肌肉生成、神经系统发育和分化、肝脏纤维化等方面具有重要的作用,作者从MEF2B基因的结构、组织分布、生物学功能及研究进展等方面对该基因进行了综述。
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- 关键词：生物学功能
- TXNRD1基因多态性与乌珠穆沁绵羊生长性状的关联分析被引量：24
- 2016年
- 本研究旨在探讨TXNRD1多态性与乌珠穆沁绵羊生长性状之间的关联性,以期找到与乌珠穆沁绵羊生长有关的分子标记。采用DNA混池测序技术筛选TXNRD1基因外显子突变位点,并采用质谱分型技术检测343头乌珠穆沁绵羊群体突变位点的基因型,并对其单个SNP及多个SNPs位点之间的组合基因型与生长性状之间进行关联分析。结果发现：在该基因第1外显子处发现1个C→T的错义突变（RS10）;在第10外显子发现1个A→C同义突变（RS17）;在第12外显子处发现1个T→C同义突变（RS18）。χ-2适合性检验表明,3个位点均处于HardyWeinberg平衡状态（P〉0.05）。连锁不平衡和单倍型分析表明：RS10-RS17,RS10-RS18两个位点之间可能存在强连锁,RS17-RS18之间弱连锁。CAT是优势单倍型,其频率为0.356。关联分析发现,每个位点的3种基因型的个体在4月龄体重和胸围上均有显著差异（P〈0.05）。RS10位点3种基因型的个体在6月龄体重、体高、胸围及胸宽上差异显著（P〈0.05）,RS17位点3种基因型的个体在6月龄体高上差异显著（P〈0.05）,RS18位点上3种基因型的个体在6月龄体重、体高、体斜长和胸围上有显著性差异（P〈0.05）。组合基因型关联分析发现,不同多态位点之间的组合基因型在乌珠穆沁绵羊不同生长性状之间差异显著（P〈0.05）。综上所述,可以将TXNRD1基因的多态性位点作为分子标记,在乌珠穆沁绵羊的选育中进行探索和尝试。
- 马晓萌轩俊丽王慧华袁泽湖吴明明朱才业刘瑞凿魏彩虹赵福平张莉杜立新
- 关键词：多态性生长性状
