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赵福平

作品数：62 被引量：285H指数：11
供职机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域：农业科学生物学经济管理更多>>

合作作者

文献类型

  • 48篇期刊文章
  • 9篇专利
  • 5篇会议论文

领域

  • 44篇农业科学
  • 8篇生物学
  • 1篇经济管理

主题

  • 29篇基因
  • 23篇绵羊
  • 14篇基因组
  • 8篇多态
  • 7篇生长性状
  • 7篇全基因
  • 6篇多态性
  • 6篇育种
  • 6篇肉羊
  • 6篇全基因组
  • 4篇信号
  • 4篇性状
  • 4篇引物
  • 4篇特异引物
  • 4篇位点
  • 4篇近交
  • 4篇基因多态性
  • 4篇基因组DNA
  • 4篇候选基因
  • 4篇SNP位点

机构

  • 62篇中国农业科学...
  • 8篇全国畜牧总站
  • 8篇庆阳市农业科...
  • 6篇中国农业大学
  • 3篇青岛农业大学
  • 3篇扬州大学
  • 2篇甘肃农业大学
  • 2篇吉林农业大学
  • 2篇四川农业大学
  • 2篇宁波三生生物...
  • 1篇河北科技师范...
  • 1篇北京农业职业...
  • 1篇湖南农业大学
  • 1篇内蒙古农牧业...
  • 1篇南京农业大学
  • 1篇北京交通大学
  • 1篇中国农业科学...
  • 1篇中国农业科学...
  • 1篇德州市畜牧兽...
  • 1篇重庆市畜牧科...

作者

  • 62篇赵福平
  • 39篇杜立新
  • 33篇魏彩虹
  • 33篇张莉
  • 17篇王立贤
  • 13篇王慧华
  • 11篇朱才业
  • 10篇吴明明
  • 9篇王立刚
  • 9篇马晓萌
  • 9篇轩俊丽
  • 9篇袁泽湖
  • 7篇刘欣
  • 7篇高红梅
  • 6篇颜华
  • 6篇陆健
  • 5篇张淑珍
  • 5篇王光凯
  • 5篇陈华
  • 4篇刘刚

传媒

  • 18篇畜牧兽医学报
  • 11篇中国畜牧兽医
  • 6篇中国农业科学
  • 4篇中国畜牧业
  • 3篇遗传
  • 2篇中国畜牧杂志
  • 2篇第十七次全国...
  • 1篇畜牧与兽医
  • 1篇动物营养学报
  • 1篇家畜生态学报
  • 1篇中国草食动物...

年份

  • 1篇2023
  • 3篇2022
  • 4篇2021
  • 3篇2020
  • 6篇2019
  • 7篇2018
  • 5篇2017
  • 10篇2016
  • 4篇2015
  • 9篇2014
  • 5篇2013
  • 5篇2012
共 62 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
不同来源大白猪总产仔数近交衰退评估被引量：7
2021年
旨在评估两个不同来源大白猪群体经过近8个世代的选育后总产仔数(total number of piglets born,TNB)近交衰退的程度。本研究对1937头大白猪使用GeneSeek GGP Porcine HD芯片进行分型,其中1039头来自加系大白猪和898头来自法系大白猪,且两品系均有表型记录和系谱记录,系谱共由3086头大白猪组成。分别使用系谱、SNP和ROH进行个体近交系数估计,并将近交系数作为协变量利用动物模型对总产仔数进行近交衰退评估。为了精准定位导致总产仔数衰退的基因组片段,又进一步对每条染色体以及显著染色体分段计算近交系数并估计其效应,检测是否能引起总产仔数发生近交衰退现象。对于加系群体,FROH、FGRM和FPED估计的近交系数均值分别为0.124、0.042和0.013,其中FROH和FPED相关最高,相关系数为0.358;对于法系群体,FROH、FGRM和FPED均值分别为0.123、0.052和0.007,其中FROH和FGRM相关最高,相关系数为0.371。利用3种不同计算方法所得近交系数用于估计近交衰退时,加系群体的总产仔数均检测到显著的近交衰退,而且当FROH、FGRM和FPED每增加10%时,总产仔数分别减少0.571、0.341和0.823头;但法系群体仅有FROH估计的总产仔数检测到显著近交衰退,FROH每增加10%时,总产仔数减少0.690头。为了锁定相关的染色体和基因组区段,首先利用ROH估计每条染色体近交系数并进行近交衰退分析发现,加系群体中检测到第6、7、8和13号染色体产生了显著近的总产仔数交衰退,而法系群体未检测到与近交衰退相关的染色体。然后,又将与加系总产仔数近交衰退显著相关的4条染色体平均分为2、4、6、8个片段进行近交衰退检测,其中平均分成8段后的染色片段的长度范围为15.1~25.8 Mb。在第6、7和8号染色体分别检测到1、2和3个与总产仔数相关的近交衰退染色体片段。这些区域注释到了CUL7、MAPK14和PPARD基因与胎盘发育相关,AREG和ER
史良玉王立刚张鹏飞莫家远李洋王立贤赵福平
关键词：大白猪总产仔数近交系数近交衰退
肌肉发育相关LncRNA的研究进展被引量：12
2014年
生长发育性状是受遗传和环境因素共同作用和/或相互作用的复杂性状,尽管利用全基因组关联研究可分析基因组上全部基因,筛选出与某类性状关联的SNP,但很难综合评价某个基因对其确切的作用。寻找与生长发育相关的精准基因是育种研究的目标之一。长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)在细胞增殖分化、个体发育、信号转导、干细胞维持、代谢等几乎所有重要生命活动中发挥关键的调控作用,在表观遗传水平、转录水平及转录后水平等方面具有控制基因表达的作用,与多种重大疾病的发生密切相关。LncRNA是一类长度大于200个nt,且不表现出蛋白质编码潜能的RNAs,通过多种机制发挥生物学功能,参与染色质修饰、X染色体沉默以及基因组印记、转录干扰、转录激活、核内运输等多种重要调控过程,涉及表观遗传调控、转录调控及转录后调控等多个层面。深入探讨LncRNA调控生肌因子进而调节肌肉发育分化的新路径,阐释哺乳动物生肌分子时间,寻找肌肉组织中与生长发育相关的新LncRNA分子,深入研究与生长发育密切相关的LncRNA分子及其靶基因的生物学功能,阐明LncRNA在肌肉生长发育的调控机制,是肌肉发育遗传育种的主要研究内容。本文就LncRNA在哺乳动物肌肉生长发育、细胞生长、分化、增殖中的作用进行综述。
魏彩虹吴明明刘瑞凿赵福平张莉杜立新
关键词：哺乳动物细胞增殖分化
一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法
本发明公开了一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法。本发明提供的方法包括如下步骤：检测待测绵羊的基因组DNA中rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型...
张莉马晓萌杜立新轩俊丽魏彩虹赵福平朱才业吴明明袁泽湖刘瑞凿
文献传递
杂交群体动物基因聚合被引量：1
2012年
基因聚合是通过优化设计杂交方案,选择利用目标基因或与其紧密连锁的分子标记,通过世代选择实现将来源于多个不同群体的优势目标基因或基因型聚合到同一个理想个体中,进而达到生产出超级经济性状个体的目的。针对聚合不同目标基因个数,设计4类杂交方案——两群体、三群体、四群体级联、四群体对称。在相同的杂交方案中,比较基因型选择和表型选择策略,分析不同杂交组合、性状遗传力、初始基因频率、基础群体规模对聚合设计的影响,并筛选出最佳的聚合方案。研究结果表明,在较大的基础群体规模和较高初始群体基因频率下,获得聚合多个目标基因的理想个体的可能性较大。在四群体杂交方案中,亲本的杂交次序对于级联杂交比对称杂交的影响较大。模拟结果表明,运用基因型选择进行聚合育种优于表型选择。文章所开发设计的聚合模拟育种的统计分析方法和相应软件为指导杂交育种方案和选择策略的设计提供理论参考,同时,为进一步设计开发聚合设计模拟育种平台奠定基础。
徐凌洋赵福平任航行陆健张莉魏彩虹杜立新
关键词：基因聚合优化设计杂交群体
基因型填充策略研究被引量：3
2020年
基因组数据在畜禽遗传育种中的应用越来越广泛,基因型填充作为基因组数据处理的重要工具,填充结果的好坏直接影响后续分析,为了得到好的填充结果,需要制定完善的填充策略。本研究通过模拟数据探讨参考群体大小、目标群体与参考群体间遗传关系(距离)远近、目标位点数目(比例)、最小等位基因频率以及填充算法等因素对基因型填充效果的影响。结果表明,目标位点数目与填充效果呈显著的正相关(P<0.05),是影响基因型填充准确性的主要因素;参考群体大小是影响Beagle5.1填充错误率的主要因素,目标位点数目是影响Minimac4填充错误率的主要因素;目标群体和参考群体的遗传距离对Beagle5.1填充效果的影响较Minimac4更为显著;一般情况下,最小等位基因频率越高的位点填充错误率越高;在参考群体个体数量少且目标位点数目多的情况下,Minimac4的填充速度优于Beagle5.1,但随参考群体个体数目增加有逆趋势。在保证填充质量的前提下,Beagle5.1对本研究中几种因素的标准要求相对较低。相对地,当目标群体位点数目较低,参考群体个体数目较多时,Beagle5.1的填充效果更好,而Minimac4更适合参考群体个体数目较少,目标群体位点数目较高的填充中。本研究针对不同的填充目的制定了不同策略,为基因型填充标准提供了参考。
邓天宇杜立新王立贤赵福平
关键词：模拟数据错误率
基于群体分化指数F_(ST)的绵羊全基因组选择信号检测被引量：17
2013年
本研究基于苏尼特羊(n=66)、德国肉用美利奴羊(n=159)和杜泊羊(n=93)3个群体的Illumina Ovine SNP50芯片分型数据,借助群体分化指数FST法进行群体间选择信号的检测分析,应用生物信息学方法分析寻找选择信号区域内的重要基因。结果,共找到343个"离群"位点,通过基因注释找到这些位点对应的365个候选基因。其中部分基因与绵羊生长、繁殖及肉质性状相关,如IGF2PB3、IGF1R、BMP2、BMPR1B、CAPN3等,本研究结果也进一步验证了前期利用CNV和GWAS研究检测到的基因结果。通过GO分析发现,这些基因主要富集在新陈代谢和去甲基化等条目。通过群体分化指数FST能有效地检测到具有选择信号的基因,其中包括绵羊部分重要经济性状的候选基因,研究结果能为绵羊的育种提供参考。
曾滔赵福平王光凯吴明明魏彩虹张莉李利张红平杜立新
关键词：候选基因
乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联被引量：6
2016年
【目的】基于前期绵羊肉用性状GWAS研究结果,旨在探讨RIPK2基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响,找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记,同时对GWAS结果进行验证。【方法】在343只乌珠穆沁绵羊试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成池DNA,设计引物对RIPK2基因外显子及其上下游1 000bp的调控区进行PCR扩增,PCR产物检测为目的条带后测序。使用DNAMAN和Chromas2软件对测序峰图进行分析,采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点及前期GWAS得到的SNP位点进行基因型分型。使用Haploview软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用SPSS（22.0）软件进行RIPK2基因SNP位点与生长性状间的关联分析。【结果】共发现了4个多态位点,A5536G的同义突变rs01位于第四外显子内,在该位点检测到三种基因型,AA基因型频率为0.42,AG基因型频率为0.45,GG基因型频率为0.13,优势等位基因为A,其频率为0.65;在第七外显子上检测到T8952C错义突变rs02,在该突变位点检测到3种基因型,其中TT基因型频率为0.82,TC基因型频率为0.16,CC基因型频率为0.02,T为优势等位基因,基因频率为0.9;在第十外显子检测到T2836C的突变rs05,在该位点检测到两种基因型TT和CC,没有检测到杂合子基因型,TT基因型频率为0.25,CC基因型频率为0.75;上游调控区发现一个G5181C的突变rs30,有3种基因型,其中GC基因型频率为0.50,CC基因型频率为0.18,GG基因型频率为0.32,G为优势等位基因,其频率为0.58;GWAS得到的SNP位点是T4456C,在本研究中被命名为rs34,在该位点有3种基因型,其中TT基因型频率为0.49,TC基因型频率为0.37,CC基因型频率为0.14,优势等位基因T的频率为0.68。χ^2适合性检验发现,除rs34位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0.05）。rs02位点处于低度多态（PIC〈0.25）,
马晓萌轩俊丽王慧华袁泽湖吴明明朱才业刘瑞凿魏彩虹赵福平杜立新张莉
关键词：生长性状多态性
绵羊全基因组ROH检测及候选基因鉴定被引量：19
2019年
旨在利用长纯合片段(runs of homozygosity,ROH)信息评估不同绵羊群体的近交情况,并鉴定与绵羊经济性状相关的基因。本研究基于Illumina Ovine SNP50芯片对来自10个绵羊群体共440个个体进行全基因组ROH检测,统计ROH在不同绵羊群体中的数目、长度及频率,根据ROH计算基因组近交系数(FROH),并对高频ROH区域进行基因注释。结果,在10个绵羊群体中共检测到25 920个ROH片段,不同绵羊群体ROH的数目、长度、频率及分布存在明显差异。ROH平均数目的变化范围从10.17个(苏尼特羊)到95.99个(杜泊羊),平均长度的变化范围从2.04 Mb(四川藏羊)到4.71 Mb(罗布羊),平均FROH的变化范围从0.010(苏尼特羊)到0.172(杜泊羊)。引进品种的(杜泊羊和德美羊)平均FROH明显高于地方品种。在地方绵羊群体中,西藏藏羊(0.085)具有最高的平均FROH。在高频ROH区域鉴定到26个与绵羊经济性状相关的基因,如与生长发育相关的基因NCAPG、LCORL、PRKAA2、FAIM2和HYDIN,与脂肪代谢相关的基因LEPR、WNT10B和NCKAP5L,与肉质及胴体性状相关的基因CDIPT、CAPN3和FGF9。基于ROH评估的近交情况可为绵羊种群育种和保种提供参考依据,鉴定到的候选基因可以作为绵羊标记辅助选择重要的基因。
刘家鑫魏霞邓天宇谢锐韩建林杜立新赵福平王立贤
关键词：候选基因绵羊
庆阳现代肉羊产业现状及建议被引量：2
2017年
甘肃省庆阳市地处北方农牧交错区，有着悠久的养羊历史、丰富的饲草料资源和独特的生态地理条件，发展以肉羊产业为核心的草食畜牧业是当地政府一贯倡导支持的主导产业。近年来，在环县、华池、庆城三个省级养羊大县的带动下，全市肉羊生产布局不断优化，养殖方式加快转变，养殖规模持续扩张，发展后劲明显增强。但近两年受全国整体肉羊市场行情低迷及小反刍兽疫疫情影响，庆阳肉羊产业组织化、标准化程度低，品牌化不明显等问题集中凸显。
刘刚赵福平张强张春义李世恩朱正生
关键词：肉羊产业饲草料资源草食畜牧业小反刍兽疫
基因组选择在羊育种中的应用研究进展被引量：9
2018年
基因组选择(genomic selection,GS)已经作为新一代畜禽遗传评估方法应用于奶牛育种中,并取得了显著成效。随着羊参考基因组的不断完善,以及不同密度SNP芯片的推出和商业化推广,新西兰、澳大利亚、法国等相继将基因组选择应用到羊育种中,揭开了羊育种的新时代。本研究总结了国内外羊基因组选择的研究现状、影响因素、优势以及存在问题和展望,以期为中国羊开展基因组选择育种提供参考。
张统雨魏霞张勤杜立新王立贤赵福平
关键词：育种
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