郑康
- 作品数：11 被引量：52H指数：6
- 供职机构：浙江大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划高等学校骨干教师资助计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 草鱼基因组DNA一些RAPD位点的遗传分析及分子标记筛选被引量：7
- 2006年
- RAPD技术的实验结果很容易因实验条件和反应参数的不同而造成差异。为了建立能通用的草鱼基因组多态性分析RAPD分子标记体系,需要利用RAPD位点按照孟德尔共显性规律遗传的特点,用不同遗传背景的材料对多态性的RAPD位点进行统计遗传学比较分析以判断其真实性。为此,本实验选择具有遗传多态性的湘江流域草鱼群体和经连续两代人工诱导雌核发育获得的雌核发育草鱼品系,对一些可能作为草鱼基因组DNA分子标记的RAPD位点进行了遗传学比较分析。所用的10条多态性随机引物共检测到30个多态性RAPD位点。两个不同遗传背景群体的遗传统计对比分析结果表明:这30个多态位性位点在湘江流域草鱼群体和雌核发育草鱼群体中的分布符合孟德尔遗传规律,可以作为草鱼基因组DNA分析的可靠分子标记。本实验的观察结果还表明:在人工诱导雌核发育过程中,存在RAPD位点的快速丢失现象,两次人工诱导雌核发育过程中共丢失了17个多态性位点。因此,加强对自然水体中草鱼种质资源多样性的保护和利用各种现代生物学技术纯化、筛选和组合优良性状基因,是草鱼遗传育种中同样重要和不可或缺的两个方面。
- 刘正华陈金辉黄明敏郑康罗琛
- 关键词：草鱼多态性位点分子标记
- 金鱼雌核单倍体发育过程中基因表达的调控障碍
- 建立在两性生殖基础上的二倍体依赖型发育是脊椎动物中普遍存在的发育模式。在哺乳动物配子发生时,父母本分别选择不同的基因打上甲基化印记,使来自精子和卵子的基因组在功能上存在差异但又互补,因而对正常发育都是必需的。然而,基因组...
- 罗敏娜李冰霞郑康刘正华张琼宇童英邱猛生罗琛
- 文献传递
- 草鱼连续两代的雌核发育群体及湘江流域群体基因组DNA的微卫星比较分析(英文)被引量：12
- 2007年
- 对湘江流域草鱼群体,一代及连续两代极体型人工诱导雌核发育草鱼群体基因组DNA的微卫星引物统计分析结果表明:湘江流域草鱼群体存在一定程度的遗传多态性;大多数被检测的微卫星位点上存在两个以上的等位基因,但遗传多样性程度较低。一代人工诱导雌核发育草鱼群体中个体的基因位点已基本纯合,但就整个群体而言,个体之间的基因型还不完全一致,表现出一定的多态性。连续两代人工诱导雌核发育草鱼群体中不仅所检测个体的基因位点已完全纯合,并且各个体的基因型也完全相同。这些观察结果说明所检测的两代人工诱导雌核发育草鱼群体是纯合的,经连续两代人工诱导雌核发育可能建立起草鱼纯系。该实验结果还发现不仅草鱼的微卫星位点上存在等位基因的多态性,而且微卫星位点本身也存在多态性;在人工诱导草鱼雌核发育的过程中不仅存在微卫星等位基因快速丢失的现象,而且也存在微卫星位点丢失的现象。因此,加强对自然水体中草鱼种质资源多样性的保护和利用各种现代生物学技术纯化、筛选和组合优良性状基因,是草鱼遗传育种中同样重要和不可或缺的两个方面。
- 郑康林凯东刘正华罗琛
- 关键词：草鱼雌核发育基因组微卫星位点
- 两个不同的人工雌核发育草鱼群体基因组DNA的RAPD分析被引量：20
- 2004年
- 采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对连续两代人工诱导雌核发育草鱼群体和一代人工诱导雌核发育草鱼群体的群体内的遗传相似度、遗传距离以及群体多样性进行了分析 ,并用一个随机取样的普通草鱼群体作比较。用 2 6个多态性引物在 3个群体中共检测到了 2 91个扩增位点 ;在 3个群体中检测到的位点数分别为 2 6 5、2 72和2 82。其中多态性位点数分别为 15、19和 81。遗传学统计分析结果表明 :3个群体的多态位点比例分别为 5 6 6 %、6 99%、2 8 72 % ;香农表型多样性指数分别为 0 170 2、0 316 9和 0 84 5 0 ;按照Nei指数统计的三个群体的遗传相似度分别为 0 985 1、0 982 0、0 9114。这些结果表明 :两个雌核发育草鱼群体的遗传多样性远低于普通草鱼群体 ,而其群体的基因组DNA同质性远高于普通草鱼。而在两个雌核发育草鱼群体中 ,两代雌核发育群体的遗传多样性要低于一代雌核发育群体的遗传多样性 ;而群体的遗传纯合度则前者高于后者。
- 陈金辉黄明敏郑康林凯东罗琛
- 关键词：雌核发育草鱼基因组DNA遗传相似度RAPD分析
- 低等脊椎动物中存在基因组印迹进化的基础被引量：2
- 2009年
- 哺乳动物配子发生过程中双亲特异性甲基化印迹导致父母双方的基因组在发育中的不等性和互补性,使父母双方的基因组对正常发育都是必需的.因此,基因组印迹是胚胎发育过程中基因组整体水平上基因表达调控至关重要的第一步,也是哺乳动物两性生殖的表观遗传基础.但基因组印迹在脊椎动物中的进化起源、形成并维持稳定的表观遗传修饰分子机制都还完全不清楚.在动物界,由于至今未在非哺乳动物中发现内源印迹基因,基因组印迹被认为可能是胎生哺乳动物单独进化出来的.为探索基因组印迹的进化起源,本文研究了哺乳动物印迹基因在低等脊椎动物的同源基因中是否存在双亲特异性差异甲基化区域.通过用重亚硫酸氢盐测序的方法,对金鱼Igf2基因的CpG岛在精子、卵子、不同发育阶段胚胎以及成体不同组织中的甲基化情况进行分析,结果表明,与哺乳动物Igf2基因一样,金鱼Igf2基因内部也存在差异甲基化区域,该区域在卵子中没有甲基化,在精子中被高度甲基化;但与哺乳动物印迹基因不同,金鱼的双亲特异性甲基化差异不能在胚胎发育过程中保持稳定,可能是脊椎动物进化早期的一种初级的基因组印迹.这些结果说明,低等脊椎动物中存在基因组印迹进化的基础,基因组印迹不是哺乳动物单独进化产生的.
- 谢冰花张蕾郑康罗琛
- 关键词：基因组印迹进化IGF2金鱼
- 草鱼基因组随机扩增多态性引物及多态性位点的筛选被引量：8
- 2004年
- 为了建立草鱼基因组DNA多态性分析的指标体系,应用RAPD技术,从180条10碱基随机引物中筛选出了31条能扩增出多态性DNA片段的引物。用这31条多态性引物共扩增出了327条重复性好、带型清晰、分辨率高的谱带。扩增产物的片段大小范围在400—2000 bp之间。单一引物扩增条带为5—14条。用这些多态性引物在草鱼基因组DNA中检测到了93个多态性位点,并对这些多态性位点上的等位基因频率进行了统计分析。这31条多态性引物和所检测到的93个多态性位点初步为草鱼基因组的多态性分析提供了可靠的分析指标体系。
- 黄明敏陈金辉郑康林凯东罗琛
- 关键词：草鱼多态位点基因组分子生物学
- 脊椎动物多倍体祖先二倍化的分子机制研究
- 近来,随着大量模式生物全基因组测序工作的完成,系统发育基因组学和比较基因组学的研究证明现存的典型二倍体脊椎动物都是从多倍体祖先进化过来的。但脊椎动物的多倍体祖先是如何克服基因组加倍带来的不利影响,通过怎样一种分子机制来完...
- 郑康
- 关键词：基因组进化VSX1
- 文献传递
- 金鱼Vsx1基因结构及其内含子多态性分析被引量：9
- 2007年
- Vsx1是第一个在金鱼中发现的编码含有同源异型框(homeodomain)和CVC结构域蛋白的基因。该基因在胚胎发育的不同阶段在胚胎的不同区域和不同组织中表达,并已经证明它在视网膜视锥双极细胞的分化和正常功能的维持中具有重要作用。为了进一步研究该基因在不同发育阶段组织特异性表达的调节机制,实验用PCR方法分析了金鱼Vsx1的基因组结构和内含子多态性。结果表明:金鱼Vsx1基因由5个外显子和4个内含子组成,与斑马鱼、人、小鼠的Vsx1基因结构相同。4个内含子中,第一内含子有两种序列差异明显的类型,但第二、三、四内含子无明显差异。第一内含子的一种类型比另外一种类型多39个碱基,这39个碱基中包括了真核生物增强子的核心序列。这一观测结果提示金鱼Vsx1第一内含子可能与该基因的发育阶段特异性和组织特异性表达调节有关。同时,第一内含子序列的明显差异也为分析Vsx1不同等位基因或基因拷贝的表达活性,以及组织特异性表达调节方式提供了合适的探针序列。
- 童英李冰霞陈金辉刘正华郑康罗琛
- 关键词：金鱼VSX1基因结构内含子多态性
- 金鱼β-catenin以细胞自主性方式抑制神经发育早期调节基因vsx1的表达
- 2009年
- β-catenin基因是脊椎动物背部中轴结构形成的必需基因.近年的研究发现,在斑马鱼和爪蟾中,β-catenin还具有抑制神经外胚层形成的作用.为深入了解β-catenin是如何抑制神经外胚层形成以及这种抑制在正常发育过程中的功能,我们研究了金鱼胚胎发育过程中β-catenin对神经外胚层发育早期调节基因vsx1表达的抑制作用.实验结果表明,用反义morpholino oligonucleotides(MO)抑制内源β-catenin的功能可导致胚胎发育早期vsx1的广泛表达;β-catenin可抑制vsx1基因启动子所控制的绿色荧光蛋白(GFP)报告基因的表达.进一步的分析证明,β-catenin所直接启动的下游靶基因boz可以通过vsx1基因启动子中的特定结合位点抑制vsx1基因启动子所控制的GFP报告基因的表达.这些结果表明,β-catenin在脊索中胚层前体细胞中启动与脊索中胚层发育调节相关基因表达的同时,还能以细胞自主性方式抑制神经发育早期调节基因vsx1在这些细胞中表达,提示β-catenin在脊索中胚层前体细胞中抑制vsx1基因的异位表达与启动脊索中胚层调节基因的表达都是保障脊索正常发育所必需的.
- 张琼宇郑康马珊珊童英罗琛
- 关键词：Β-CATENINVSX1发育
- 异源精子遗传物质对雌核发育草鱼基因组的影响分析被引量：6
- 2008年
- 为分析外源精子对人工诱导雌核发育草鱼基因组的影响,用随机扩增多态性和微卫星技术对经两代连续人工诱导,遗传背景一致的雌核发育草鱼以及母本草鱼和父本鲤鱼的基因组DNA进行了比较分析。10个随机引物在雌核发育草鱼中共检测到104个RAPD位点,在鲤鱼中检测到103个位点。7对微卫星引物在雌核发育草鱼中共扩增出4个微卫星位点,在鲤鱼中检测到22个位点。两种方法在雌核发育草鱼和鲤鱼中所检测到的位点均没有一个相同。根据RAPD和微卫星分析数据进行的遗传相似度分析表明二代人工雌核发育草鱼群体与其一代人工诱导雌核发育草鱼母本的遗传相似度从0.9903到1.000,与父本鲤鱼的遗传相似度为0.000。这些实验结果证明在适当的紫外线处理强度下,鲤鱼精子的遗传物质能够被完全破坏,不会对雌核发育草鱼的基因组造成遗传污染。
- 胡海星郑康陈金辉刘正华张琼宇罗琛
- 关键词：雌核发育草鱼RAPD微卫星遗传相似度
