李泽斌
- 作品数：1 被引量：5H指数：1
- 供职机构：南京农业大学农学院作物遗传与种质创新国家重点实验室更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金南京农业大学SRT基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 森林草莓组蛋白去乙酰化酶基因的鉴定和分析被引量：5
- 2017年
- [目的]本研究对森林草莓中组蛋白去乙酰化酶基因(HDAC)进行鉴定和分析,并研究其在生长发育以及逆境胁迫响应过程中的表达变化,为深入研究森林草莓组蛋白去乙酰化调控机制奠定基础。[方法]运用生物信息学方法,对森林草莓中HDAC基因进行鉴定,并进行蛋白结构域、染色体定位、基因复制类型和其他进化分析。利用转录组数据分析森林草莓中HDAC基因在不同组织和发育阶段中的表达变化。运用实时荧光定量PCR对森林草莓中HDAC基因在低温、高温胁迫下的表达变化进行分析。[结果]森林草莓中包含12个HDAC基因,其中RPD3/HDA1家族9个,SIR2家族2个,HD2家族1个;RPD3/HDA1家族基因可以分为5类,SIR2家族中基因分为2类。森林草莓中RPD3/HDA1和HD2家族HDAC基因主要通过离散型复制模式进行扩张,SIR2家族在双子叶进化过程中没有发生明显扩张。各个HDAC基因具有发育阶段或组织特异性表达。部分HDAC基因在森林草莓热胁迫处理中有不同程度的响应,对冷胁迫的反应相对较小。[结论]森林草莓HDAC基因具有植物的典型特性,并可能参与了森林草莓的生长发育和对热胁迫的响应。
- 林莹韩玉辉熊思嘉李泽斌张欣顾婷婷
- 关键词：去乙酰化进化分析基因复制逆境胁迫
