孙琦
- 作品数：2 被引量：14H指数：2
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- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 毛果杨NLP基因家族生物信息学分析与鉴定被引量：9
- 2014年
- NLP基因家族是一类特殊的转录因子,豆科植物根瘤的形成依赖于该基因家族的存在,在非豆科植物中具有调节植物硝酸盐吸收以及同化的功能。通过对毛果杨(Populus trichocarpa)基因组的生物信息学分析,共鉴定出14个毛果杨NLP基因家族成员,这些成员具有低亲水性的特点,基因结构保守,都含有RWP-RK以及PB1两个保守结构域。通过细胞定位预测,所有成员都定位在细胞核中。直系同源与旁系同源进化分析显示,NLP基因家族成员在漫长的进化过程中经历了严格的选择。染色体定位分析表明,毛果杨NLP基因家族成员坐落在毛果杨9条染色体之上,成员数量的扩增来自于杨柳科染色体自身的扩增事件。芯片数据分析结果显示,NLP基因家族成员在嫩叶,根和雄花中表达,部分基因在木质部以及种子萌发过程之中表达,但所有成员均不在成熟叶片中表达。
- 吴翔宇许志茹曲春浦李蔚孙琦刘关君
- 关键词：NLP基因家族
- 小黑杨FLC基因的克隆及功能解析被引量：5
- 2015年
- MADS-box家族蛋白是一类重要的调控开花的转录因子，FLC是其家族成员的编码基因之一。FLC在调节开花过程，其功能的发挥受多个途径的调控。本研究利用RT-PCR方法在小黑杨雄花芽中克隆出FLC基因的全长cDNA序列PnFLC。该基因的开放读码框为726bp，编码241个氨基酸残基组成的分子量为27．559kD的蛋白质，蛋白质的等电点为9．37。实时定量荧光PCR结果显示，春化能够使PnFLC在小黑杨根、茎、叶各组织中表达量下调57．9％～84％；启动子GUS染色结果表明，PnFLC启动子在分裂活跃的组织中活性较高。拟南芥的遗传转化结果显示，PnFLC可以调控AtAP1、AtSOC1和AtFT基因的表达，同时延迟拟南芥的开花时间。
- 孙琦曲春浦郑美珠刘关君
- 关键词：小黑杨春化
