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羽叶三七的转录组测序与三萜皂苷生物合成的关键酶基因的识别被引量：10: 2017年; 羽叶三七是五加科人参属的名贵药材,三萜皂苷为羽叶三七最主要的活性成分。为了探索羽叶三七根茎中皂苷物质生物合成的分子基础,采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得羽叶三七根茎的转录组数据;使用Trinity和TGICL软件实现Uni Gene的de novo拼接;基于BLAST完成Uni Gene的蛋白功能注释、KOG功能注释、GO分类和KEGG代谢通路分析。最终通过de novo拼接注释得到Uni Gene 62 240个。研究发现,羽叶三七根茎部表达的26个Uni Gene与三萜碳环骨架合成相关;三萜合成通路中的关键酶FPS、SS、SE等,分别有11 114个Uni Gene。该研究发现的三萜皂苷合成相关候选基因对于阐明羽叶三七三萜皂苷合成方式研究提供了理论基础。; 黄勋金健余洁韩喆闫祺陈平; 关键词：转录组测序

珍稀药用植物珠子参的转录组测序及分析被引量：26: 2015年; 药用植物珠子参的根茎在中国西南区域已有上千年的药用历史,三萜皂苷为珠子参最主要的活性成分。为了探索珠子参根茎中皂苷物质生物合成的分子基础,该文采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得珠子参根茎的转录组数据;使用Trinity和TGICL软件实现Unigene的de novo拼接;基于BLAST完成Unigene的蛋白功能注释、KOG功能注释、GO分类和KEGG代谢通路分析。最终获得了短读序15.6 Gb,通过de novo拼接注释得到Unigene 62 240个。研究发现,珠子参根茎部表达的19个Unigene与三萜碳环骨架合成相关;69个Unigene与介导三萜碳环骨架的氧化和羟基化等修饰的CYP450相关,18个Unigene与负责三萜碳环骨架的糖基化的糖基化转移酶相关。该研究发现的三萜皂苷合成相关候选基因对于阐明珠子参三萜皂苷合成方式研究提供了重要的基础。; 张绍鹏金健胡炳雄吴亚运闫祺曾万勇郑用琏张西峰陈平; 关键词：珠子参转录组三萜皂苷

人参属植物鲨烯环氧酶编码基因的生物信息学分析被引量：2: 2016年; 目的对人参属植物的三萜皂苷生物合成途径中的鲨烯环氧酶及其编码基因进行分子层面的分析研究。方法从Genbank中找到目前已公布的所有人参属植物的鲨烯环氧酶基因序列信息,利用生物信息学方法对这些序列进行开放阅读框、编码氨基酸和进化关系树进行了初步的预测和分析。结果不同物种间的鲨烯环氧酶基因在核苷酸和氨基酸平均相似性以及结构分析表明14种鲨烯环氧酶编码基因在人参属植物中是稳定的。对人参属的14种鲨烯环氧酶进行聚类分析发现可以将其分为3类。结论通过生物信息学方法对人参属植物鲨烯环氧酶及其编码基因进行分析,可以为鲨烯环氧酶基因以及三萜皂苷途径的分子生物学研究提供理论上的依据和指导资料。; 金健吴亚运晏旋黄勋张绍鹏; 关键词：人参属理化性质生物信息学分析

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金健