胡莹
- 作品数:6 被引量:5H指数:2
- 供职机构:天津医科大学更多>>
- 相关领域:医药卫生自动化与计算机技术生物学环境科学与工程更多>>
- A Comprehensive Pathway and Network Analysis of Candidate Genes Associated with Nicotine Addiction
- Background: Cigarette smoking is a main cause of preventable diseases and premature death worldwide.Nicotine i...
- 刘孟刘新华李霞范锐胡言石胡莹伊现富张涛王举
- 关键词:NICOTINEADDICTIONPATHWAYNETWORKSUBNETWORK
- The Functional Divergence Analysis of Neuronal Nicotinic Acetylcholine Receptor Subunits
- Background: Nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs), the ligand-gated ion channels in the plasma of certain...
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- 关键词:NEURONALNACHRSFUNCTIONALDIVERGENCEDUPLICATION
- TarPriGO: A New Method to Prioritize miRNA Targets Based on Gene Ontology
- Background: MicroRNAs (miRNAs) play important roles in post-transcription by repressing translation or causing...
- 李霞刘孟刘新华范锐胡言石胡莹伊现富张涛王举
- 关键词:MICRORNATARGETGENEGENEONTOLOGY
- Simulation Study on the Influences of Chain Length on the Shielding Effect of PEGylated Nanoparticles
- Background: The stealth shielding effect of PEGylated nanocarriers is of great importance for their properties...
- 胡莹李洋王举
- 关键词:NANOPARTICLEBIOMEMBRANEPOLYMERLENGTHMOLECULAR
- 基于蛋白质-蛋白质互作网络的神经精神疾病相关通路解析及功能研究
- 神经精神疾病是严重威胁人类健康的常见复杂疾病,对此类疾病的发病机制进行系统探究,有益于改善其临床诊治措施,提高患者生活质量。随着基因组学及相关技术的发展,通过多种不同技术,已经确定了数量众多的可能与神经精神疾病相关的基因...
- 胡莹
- 关键词:神经精神疾病发病机制
- 文献传递
- 与肝癌浸润相关候选基因的生物信息学分析被引量:2
- 2016年
- 目的通过功能富集与网络分析方法,对肝癌浸润相关候选基因进行生物信息学分析,旨在从分子水平系统探究肝癌浸润的发病机制,并为后续实验提供一些有意义的信息。方法首先,从与肝癌相关公共数据库Liverome下载与肝癌浸润相关的差异表达基因,共涉及278个相关候选基因。然后,通过Topp Fun、STRING、Network Analyzer等生物信息学分析工具,对涉及的278个与肝癌浸润相关候选基因进行系统的分析。最后,通过网络映射分析方法,对与肝癌浸润相关候选基因进行关键基因(Hub Gene)筛选,并通过i HOP在线软件,以及Pubmed文献检索方法对这些基因进行文献挖掘分析。结果通过对与肝癌浸润相关候选基因进行功能富集分析发现,这些基因主要参与细胞周期与增殖、细胞迁移与黏附、细胞骨架、血管形成等生物过程,而且这些基因共表达于肝癌与肝癌转移上调和下调等基因功能。对相关基因进行通路富集分析发现,这些基因参与调控细胞周期与增殖、能量供给、赖氨酸降解等生物通路,对肝癌浸润的发生、发展发挥调控作用。除此之外,通过网络分析方法,找到PLK1、AURKB、CDC20、CDK4、MCM3等20个处于网络关键节点的基因(Hub Gene)。之后,通过文献检索方式,对关键基因进行与肝癌浸润相关的功能验证,发现并预测CDC20、CDCA8、NUP37、ZWINT基因与肝癌浸润过程存在关联但作用机制尚未被挖掘。结论利用生物信息学手段,能够有效分析肝癌浸润的相关基因,并可以从分子水平系统探究其发病机制,为临床诊疗及后续实验提供一些有价值的信息。
- 王宁胡莹高英堂张艳艳杜智杨斌
- 关键词:肝癌生物信息学生物工程