翟杰
- 作品数:6 被引量:9H指数:2
- 供职机构:首都医科大学附属北京同仁医院更多>>
- 发文基金:北京市科委重大项目内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 喉咽鳞状细胞癌与诱导化疗敏感性的靶向基因的相关研究
- 目的 应用基因芯片筛选分析与喉咽鳞状细胞癌诱导化疗敏感性相关的潜在靶向基因并行细胞生物学验证.方法 1.选取12位对诱导化疗敏感的喉咽鳞癌患者与9位不敏感患者的原发肿瘤组织;2.应用全基因组表达谱芯片进行差异基因筛选,运...
- 廉猛翟杰王海舟时倩房居高
- 关键词:诱导化疗TPF方案
- c-FOS基因在下咽鳞状细胞癌对诱导化疗药物敏感性中的作用研究被引量:1
- 2018年
- 目的通过分子生物学方法验证c-FOS基因与下咽鳞状细胞癌的TPF(顺铂+紫杉醇+5-Fu)化疗方案敏感性的相关性。方法利用特异性小干扰RNA(siRNA)转染Fadu细胞,获得下调c-FOS基因表达的体外培养Fadu细胞系。设置加入c-FOS-siRNA的实验组,正常Fadu细胞系为阴性对照组及空白对照组,应用MTT法检测细胞增殖能力,并计算各组细胞对TPF诱导化疗方案的半数抑制浓度(IC50)。对比正常细胞系及c-FOS下调细胞系IC50变化。结果成功构建c-FOS敲减Fadu细胞系,敲减效率为78.77%。MTT实验结果表明沉默c-FOS基因表达后,细胞系对TPF药物的IC50值(顺铂0.148μg/ml,紫杉醇0.223μg/ml,5-Fu4.156μg/ml)与对照组相比降低(顺铂0.0924μg/ml,紫杉醇0.139μg/ml,5-Fu 2.586μg/ml),表明c-FOS基因的表达可导致细胞对TPF化疗方案抵抗。结论 c-FOS基因在喉咽癌中与诱导化疗方案的敏感性有明显关系,可作为治疗方案选择的潜在分子标志物。
- 翟杰王茹王海舟刘术舟杨一帆廉猛房居高
- 关键词:下咽诱导化疗
- 基于miRNAs芯片的喉鳞状细胞癌致癌机制的初步分析被引量:2
- 2016年
- 目的 miRNA芯片筛选与喉鳞状细胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相关的差异miRNA s,结合生物信息学分析确定并进一步验证具有诊疗价值的目标miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片对5对LSCC组织及相应的癌旁组织行差异miRNAs的筛选,原始数据上传Gene Expression Omnibus数据库。采用Mev软件中配对方式t检验进行芯片探针的差异分析,经Affymetrix Analysis Center分析后将差异探针转换为差异表达的miRNAs;选择我们前期工作确定的微小染色体维持蛋白4(mini chromosome maintenance protein4,MCM4)作为核心基因,采用Mirfocus数据库生物信息学分析MCM4的调控miRNAs并结合相关文献确定目标miRNAs;采用RT-PCR在另外21对LSCC组织及相应的癌旁组织中验证目标miRNAs。结果经差异筛选分析,有127个差异表达的miRNAs,其中78个miRNAs在肿瘤组织中高表达,49个miRNAs在肿瘤组织中低表达;采用Mirfocus数据库生物信息学分析参与核心基因MCM4的调控miRNAs并结合相关文献,确定高表达的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p为与MCM4调控作用相关的目标miRNAs;hsa-miR-30a-5p为另一个潜在的目标miRNA,且在肿瘤组织中低表达;通过RTPCR验证这3个差异表达的目标miRNAs与芯片筛选结果一致。结论基于miRNAs芯片筛选分析得到的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p及hsa-miR-30a-5p对LSCC的发生发展具有重要调控作用,可作为潜在的诊疗靶点。
- 廉猛翟杰王茹王海舟冯凌时倩马泓智房居高刘晓琴刘红刚
- 关键词:微RNAS芯片分析技术计算生物学
- 基于miRNA芯片的喉咽鳞状细胞癌对TPF方案诱导化疗敏感性相关miRNA的初步分析被引量:3
- 2016年
- 目的运用miRNA芯片筛选与喉咽鳞状细胞癌对TPF方案诱导化疗敏感性相关的差异miRNAs,生物信息学分析确定具有诊疗价值的目标miRNA并进行验证。方法利用Affymetrix GeneChipmiRNAArray4.0芯片对12例TPF方案诱导化疗敏感的原发喉咽鳞状细胞癌患者及9例不敏感的患者的肿瘤组织行差异miRNA的筛选。选择文献中已经报道的和肿瘤发生相关的miRNA作为目标miRNA,并采用RT-PCR在24例原发喉咽鳞癌肿瘤组织(14例敏感,10例不敏感)中验证目标miRNA。结果筛选出24个miRNA在敏感组与不敏感组间表达有显著差异,其中6个miRNA在对TPF方案诱导化疗敏感组中表达上调,18个miRNA表达下调。运用miRNA靶基因预测数据库mirfocus对筛选出的24个差异miRNA进行分析,确定在敏感组中低表达的hsa-miR-211-3p、hsa-miR-4253、hsa-miR-4443、hsa-miR-193b-3p作为目标miRNA。采用RT-PCR对目标miRNA进行验证,hsa-miR-4253、hsamiR-4443、hsa-miR-193b-3p与芯片筛选结果一致。结论hsa-miR-4253、hsa-miR-4443、hsa-miR-193b-3p在诱导化疗敏感组与不敏感组间有显著性差异,可作为治疗方案的选择指标,并为进一步研究喉咽鳞状细胞癌对诱导化疗敏感性奠定分子生物学基础。
- 王海舟廉猛王茹翟杰冯凌时倩马泓智房居高
- 关键词:逆转录聚合酶链反应MIRNA芯片
- 喉咽鳞状细胞癌TPF诱导化疗敏感性相关基因表达谱分析
- 廉猛沈茜茜翟杰刘术舟王海舟房居高
- BMP1基因与声门上型喉癌临床分期相关性分析被引量:3
- 2019年
- 目的:利用基因表达谱芯片,筛选声门上型喉鳞状细胞癌TNM分期相关的差异表达基因。方法:选取12例不同分期的声门上型喉癌患者的新鲜肿瘤标本(Ⅱ期3例、Ⅲ期3例、Ⅳ期6例),运用Illumina人类全基因组表达谱芯片检测三组的表达差异,筛选肿瘤TNM分期相关基因,并对各期均有统计学差异基因进行贝叶斯网络分析,探寻与肿瘤分期相关的分子标记物。结果:筛选出10个差异基因(BMP1、NPHP3、C21ORF57、DNAJB5、CT45A1和LOC100130562为mRNA,LOC100132673、LOC646294和MGC39821为miscRNA,OR7E91P为non-coding RNA),10个差异基因能较好判别肿瘤的TNM分期(ANOSIM分析,r=0.936 5,P=0.001);贝叶斯网络显示与肿瘤分期相关的关键基因是BMP1,且TGCA数据库显示BMP1与头颈肿瘤的分期呈正相关(P=0.034 9)。结论:BMP1的表达与肿瘤的TNM分期呈正相关,BMP1是声门上型喉癌临床晚期的分子标志物之一。
- 何时知廉猛孔繁勇李连贺翟杰沈茜茜时倩王茹冯凌马泓智钟琦房居高
- 关键词:肿瘤分期