柳明
- 作品数:4 被引量:20H指数:2
- 供职机构:中国水产科学研究院南海水产研究所农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室更多>>
- 发文基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家高技术研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 石斑鱼神经坏死病毒RNA干扰的转染条件优化与效果分析被引量:2
- 2011年
- 克隆了石斑鱼神经坏死病毒(Nervous necrosis virus,NNV)的衣壳蛋白(Major capsid protein,MCP)基因序列并构建了绿色荧光蛋白(EGFP)基因与MCP基因的融合真核表达载体pEGFP-MCP,设计了3对针对MCP基因序列的小片段干扰性RNA(Small interfering RNA,siRNA)序列(NNV-001、NNV-002、NNV-003),开展了转染方法、转染剂量与转染效果的研究,用脂质体转染法将pEGFP-MCP和不同剂量的siRNA共转染导入黑头呆鱼肌肉(FHM)细胞.结果表明,用无血清培养基转染、4-6 h后换液的转染方法,比不换液、只将转染混合物代替同体积培养基的转染方法效率高;当质粒的转染量为50、70、100和150 ng时,100 ng的转染量为最合适;在pEGFP-MCP与siRNA共转染组,3对siRNA序列都有干扰效果,均能干扰绿色荧光蛋白的表达,其中NNV-002效果最好.当siRNA终浓度为200 nmol/L时,显示出了较好的沉默效果.
- 黄桂菊喻达辉柳明潘俐玲王晓宁曾令兵龙华
- 关键词:石斑鱼神经坏死病毒衣壳蛋白基因RNA干扰
- 中国海南三亚大珠母贝不同年代种群的遗传变异研究被引量:7
- 2011年
- 利用10个多态微卫星标记对中国海南三亚海域大珠母贝(Pinctada maxima)3个不同年代(2007、2009和2010)群体的遗传变异进行了分析,每个群体30个样品。10个位点共扩增出60个等位基因,平均每个位点6(2—8)个,3个群体分别丢失了1、2和4个稀有等位基因。平均期望杂合度(Hc)、平均多态信息含量(PIC)、平均Shannon多样性指数均呈下降趋势。各群体均存在一定程度的杂合子缺失。30个数据中(3个种群×10个位点)有18个偏离了Hardy—Weinberg平衡。两两群体间的平均近交系数(FIS)介于0.2273~0.2601之间,平均遗传分化指数(FST)介于0.0204~0.0462,遗传分化显著(P〈0.01)。结果表明,3个年代群体遗传多样性水平已经出现了逐渐降低的趋势,遗传结构存在显著差异,近交程度增加,因此,人工繁育工作中应注意避免近亲繁殖和遗传多样性的降低。
- 柳明喻达辉黄桂菊卢传亮
- 关键词:大珠母贝微卫星
- 大珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选被引量:11
- 2010年
- 采用生物素标记的(CA)15探针和磁珠富集法构建了大珠母贝(Pinctada maxima)微卫星DNA文库,随机挑选1200个菌落,经PCR筛选得到298个候选克隆,成功测序246个,分析获得251个微卫星序列,其中完美型、非完美型和混合型分别占63%、32%和5%。除探针中使用的CA重复外,还得到AT、GT、TC、AG、GC、TAA、CAA、AGG、GATA、GACA、GTGC、CGTC、GACG、CTGT等重复序列。设计引物90对,挑选其中30对合成并筛选出21对能在大珠母贝基因组有效扩增的引物。种群PCR扩增后利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法进行检测,获得了10个多态位点,共检测出59个等位基因,片段长度范围为133~444bp。各位点等位基因数2~8个,平均等位基因数5.9个;有效等位基因数为1.3423-6.0000,平均为4.1240;多态性信息含量(CPI)为0.2225-0.8118,平均0.7179;期望杂合度(Hc)为0.2593-0.8475,平均0.7179;观测杂合度(H0)为0.3000-0.8000,平均0.5333。这些微卫星多态性标记的获得,为进一步开展大珠母贝遗传育种、保护生物学和种群遗传多样性等研究奠定了一定基础。
- 柳明喻达辉黄桂菊
- 关键词:磁珠富集法微卫星
- 大珠母贝微卫星DNA标记的筛选分离与分析
- 采用生物素标记的(CA)探针和磁珠富集法构建了大珠母贝(Pinctada maxima)微卫星DNA文库,随机挑选了1200个菌落,经PCR筛选得到298个候选克隆,成功测序236个,分析获得397个微卫星序列,其中完美...
- 柳明喻达辉黄桂菊
- 关键词:大珠母贝微卫星磁珠富集法
- 文献传递