张波
- 作品数：5 被引量：17H指数：3
- 供职机构：淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室更多>>
- 发文基金：江苏省高校自然科学研究项目江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 西施舌ISSR-PCR扩增条件优化被引量：4
- 2008年
- 采用CTAB裂解、酚氯仿抽提法,提取了连云港、长乐、北海、胶南等地的西施舌基因组DNA,并从10条ISSR引物中筛选出了能够显示西施舌种群遗传差异的引物835和847,对模板DNA浓度、镁离子浓度、dNTP浓度、引物浓度和Taq酶浓度等条件进行了优化,初步筛选出适于西施舌ISSR分析的最佳反应体系:在25μL体系中,加模板38ng,10×Buffer 2.5μL,镁离子浓度为3.5mmol/L,引物浓度为0.8μmol/L,dNTP为0.3μl(10mmol/L),Taq DiNA聚合酶2U,退火温度为47.2℃。
- 张波孟学平陈建安
- 关键词：西施舌ISSR
- 蚶科三种贝类ITS2核苷酸序列分析被引量：5
- 2008年
- 对蚶科三种贝类ITS2进行PCR扩增、测序及分析,用Mega3.1软件进行了系统发育初步分析。结果显示：毛蚶、泥蚶和魁蚶的ITS2大小分别为284～288bp、380bp、413～417bp,三种蚶的445个序列比对位点中,共有172个保守位点,245个变异位点,166个简约信息位点,78个单突变位点。系统发育分析结果显示,毛蚶和泥蚶先聚为一支,而后与魁蚶聚在一起。ITS2分析结果显示毛蚶和泥蚶种间的遗传关系较近。
- 张波孟学平
- 关键词：ITS2
- 海洋贝类基因组DNA的提取改进及ITS2扩增被引量：2
- 2008年
- 目前已报道的常见的基因组DNA提取方法有经典酚醇法、盐析法、碘化钾法、煮沸法等,其中酚醇法根据其裂解液的不同又有CTAB、SDS、ROSE等具体方法,本试验对经典的CTAB法进行了改进,从酒精保存的西施舌组织中提取得到质量高的基因组DNA,以此为模板扩增ITS2效果很好。
- 张波孟学平
- 关键词：海洋贝类基因组DNACTAB法提取
- 西施舌Cyt b基因核苷酸差异分析被引量：5
- 2010年
- 从线粒体DNA水平对我国沿海西施舌进行了遗传差异和系统发育研究,为其保护和可持续利用提供理论依据。对4个不同地理群体西施舌Cyt b基因片段进行了扩增、测序,利用MEGA4.1进行序列比对分析,以文蛤和中华文蛤为外类群,构建系统进化树。结果获得394 bp的Cyt b基因片段,其T、C、A、G含量分别为38.4%、16.9%、23.6%、21.1%,A+T含量明显高于G+C含量。在394 bp比对位点中,有318个保守碱基,76个变异位点。其中,70个简约信息位点。长乐与其他3个群体之间的遗传距离为0.194～0.209。氨基酸序列比对结果显示长乐群体与3个非长乐群体有7个位点的氨基酸差异,遗传距离为0.053。由此可见长乐群体是一个具有明显分子遗传特征的独立群体。
- 孟学平申欣张波程汉良田美郑雯雯
- 关键词：西施舌CYT
- 五种不同蛏类ITS2核苷酸序列分析被引量：2
- 2008年
- 对5种不同蛏类的ITS2核苷酸序列进行扩增、测序及分析。结果表明:5种蛏类的509个序列位点中共有49个保守位点,402个变异位点,318个简约信息位点,84个单突变位点。5种不同蛏类遗传距离在1.194～3.173之间,总角截蛏和小刀蛏的遗传距离较近,而与其他3种蛏类的遗传距离较远,遗传距离在1.965～3.173之间。缢蛏、长竹蛏和细长竹蛏3种蛏之间的遗传距离较其他2种蛏近,遗传距离在1.194～1.318之间。同种蛏类不同个体之间的遗传距离很近,遗传差异很小。
- 孟学平张波冒树泉
- 关键词：ITS2
