田美
- 作品数:38 被引量:121H指数:6
- 供职机构:淮海工学院更多>>
- 发文基金:江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金国家自然科学基金江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学文化科学天文地球更多>>
- 浅谈生物技术专业本科生创新能力的培养被引量:4
- 2009年
- 本文结合本院实际,在生物技术专业本科生的创新能力培养方面,强调教学、实践、科研相结合,对大学生创新能力的培养进行了探索和实践,认为注重对大学生创新能力的培养是创新型人才形成的重要环节。
- 田美申欣
- 关键词:生物技术本科生
- 江苏连云港沿海蛤蜊科贝类18S-ITS1序列分析被引量:2
- 2009年
- 利用PCR技术扩增了江苏连云港海域3种贝类(西施舌、中国蛤蜊,四角蛤蜊)核糖体RNA基因18S-ITS1区域序列。用DNAStar和MEGA3.1软件分析序列的碱基组成、进行序列比对,构建系统发育树。结果显示,西施舌、中国蛤蜊、四角蛤蜊18S-ITS1部分序列长度分别为1052bp、1017bp、1013bp,ITS1部分序列长度分别为910bp、875bp、871bp,G+C含量为58.90%~60.23%;18S区序列保守,种间仅存一个碱基变异位点。序列分析显示,中国蛤蜊与四角蛤蜊的ITS1同源性为70.1%~71.1%。西施舌与中国蛤蜊、四角蛤蜊的同源性为44.7%~46.3%;18S-ITS1序列适于蛤蜊科种间特别是蛤蜊属内种间的分子系统发育分析。
- 孟学平陈建安申欣程汉良董志国阎斌伦田美
- 关键词:RRNA基因ITS1西施舌中国蛤蜊四角蛤蜊
- 海水养殖凡纳滨对虾肌肉组织蛋白质组学研究被引量:7
- 2010年
- [目的]建立分析海水养殖凡纳滨对虾肌肉组织蛋白的双向电泳图谱及技术体系。[方法]采用裂解、离心等抽提方法提取凡纳滨对虾肌肉蛋白样品,利用bradford蛋白定量试剂盒作蛋白定量后,进行一向等电聚焦电泳和二向聚丙烯酰胺凝胶电泳。电泳后的凝胶采用考马斯亮蓝染色,利用ImageScannerⅢ扫描仪扫描凝胶,获得凝胶图像。[结果]经双向电泳图谱分析显示,所获得的凡纳滨对虾肌肉蛋白点分布于pH值4.0—7.0之间,大部分蛋白为酸性蛋白,其中有部分蛋白可能存在同分异构体,高pH值区蛋白分布相对较少。[结论]首次获得海水养殖凡纳滨对虾肌肉蛋白质的双向电泳图谱,初步建立了海水养殖凡纳滨对虾肌肉组织双向电泳技术体系.可为进一步探索海水养殖凡纳滨对虾的生理生化机制及比较蛋白质组学研究提供理论依据和技术保障。
- 田美申欣孟学平彭永兴程汉良
- 关键词:凡纳滨对虾蛋白质组学双向电泳肌肉组织
- 文昌鱼线粒体基因组特征分析及分子标记探讨被引量:2
- 2011年
- 线粒体基因组已被广泛应用于后生动物分子系统发育和群体遗传的研究。文昌鱼(Amphioxus)作为研究脊椎动物起源和进化的模式动物,在脊椎动物起源和进化研究中占据极为重要的位置。作者综合分析文昌鱼2科7个种的51条线粒体基因组全序列,全面揭示了文昌鱼线粒体基因组的基本特征。文昌鱼线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因,文昌鱼线粒体基因组共有3种基因排列方式,其中文昌鱼属和侧殖丈昌鱼属共有的基因排列与脊椎动物线粒体基因组的典型排列相比最为接近。因此,文昌鱼属和侧殖文昌鱼属线粒体基因组的基因排列方式代表了文昌鱼原始的基因排列方式。与此相比,偏文昌鱼属的3个物种发生了基因重排。文昌鱼线粒体基因组13个蛋白编码基因的Ka/Ks值均远远低于1(0~0.3363),显示出较强的纯化(负)选择。文昌鱼线粒体基因组种问和种内基因变异分析表明,在文昌鱼群体遗传的研究中,nad5、nad4和nad2基因是理想的分子标记,可以作为coxl基因辅助的分子标记,用于分析丈昌鱼不同群体之间的遗传多样性,为其生物多样性的保护及合理利用其生物资源提供更多基础资料。
- 申欣田美孟学平程汉良
- 关键词:线粒体基因组分子标记
- 真虾类线粒体基因组的特征分析
- 本研究系统分析了现有的13种真虾类线粒体全基因组,结果显示,13种真虾线粒体基因组的长度介于15500~16100 bp之间,平均碱基含量A=34.35%、T=29.98%、G=12.73%、C=22.94% (A+T=...
- 田美刘汉湖黄净轩申欣
- 关键词:线粒体基因组基因组成
- 鲸类线粒体基因组特征分析及分子标记探讨被引量:2
- 2011年
- 综合分析鲸类32个物种的线粒体基因组全序列,全面揭示了鲸类线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因、选择压力和差异位点等。鲸类线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因。绝大多数鲸类线粒体基因组的基因排列顺序完全相同,而且与脊椎动物线粒体基因组的典型排列一致。4个类群(真露脊鲸属、须鲸属、原海豚属和宽吻海豚属)线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值介于0和0.587 7之间,均低于1,显示为纯化(负)选择。其中,cox3基因的Ka/Ks均值最低,其次为cox1,cox2和cob基因,说明这些基因承受较强的选择压力和功能束缚;而nad6基因的Ka/Ks均值最高,其次为atp8,nad2和atp6基因,说明这些基因的选择压力较弱。从32种鲸类物种间和属内(真露脊鲸属、须鲸属、原海豚属和宽吻海豚属)线粒体基因组主编码基因(13个蛋白质编码基因和2个核糖体RNA基因)和D-loop区的变异位点分析显示,在鲸类群体遗传的研究中,nad5,nad4和nad2基因是理想的分子标记,可以作为cox1基因辅助的分子标记,用于分析鲸类不同群体之间的遗传多样性,为其生物多样性的保护及其生物资源的合理利用提供参考。
- 田美申欣孟学平程汉良
- 关键词:鲸目线粒体基因组分子标记
- 双壳纲贝类18S rRNA基因序列变异及系统发生分析5
- 纲(Bivalvia)为软体动物门的一个纲,全世界约有2 万种.我国有8 个目.生态及形态上极具多样性,在我国,双壳贝类分类工作已有几十年的历史,双壳类种类繁多,分类困难,目前,以形态学资料为依据的分类结果常出现分岐.
- 孟学平申欣程汉良田美
- 鳍足类线粒体基因的选择压力比较及进化关系探讨被引量:1
- 2014年
- 鳍足类Pinnipeds是海洋哺乳动物的重要类群,现存种类包括海象科Odobenidae、海狮科Otariidae和海豹科Phocidae的所有物种。在海豹属Phoca中,atp8基因的Ka/Ks最高,仅为0.084 7(远小于1),因而海豹属所有线粒体蛋白质编码基因的选择压力均非常高。对于群海豹属Pusa,cox1、cox2和nad3基因的Ka/Ks均为0,表明在这3个基因中,所有的核苷酸的替换均为同义替换,没有出现氨基酸的改变。科内、属内基因变异位点的分析表明,nad5、nad4和nad2基因可以作为cox1和cob基因辅助的分子标记。线粒体基因组的系统发育结果,强烈支持食肉目所有12个科均为单系群,并且鳍足类(海狮科、海象科和海豹科)为食肉目Carnivora内部的一个单系群(BPM=100,BPP=100)。在鳍足类内部,海狮科与海象科亲缘关系最近,聚类为海狮总科Otarioidea,然后与海豹科聚类:(海狮科+海象科)+海豹科。在海豹科内部,线粒体基因组的证据支持将海豹科划分为2个亚科,即僧海豹亚科Monachinae和海豹亚科Phocinae。线粒体基因组的证据,强烈支持鼬科Mustelidae与浣熊科Procyonidae关系最近,臭鼬科Mephitidae与熊猫科Ailuridae近缘,同时,鳍足类与[(鼬科+浣熊科)+(臭鼬科+熊猫科)]为姊妹群,而与熊科Ursidae较远。犬科Canidae在犬型亚目Caniformia中分化较早,位于犬型亚目的基部。
- 申欣田美孟学平程汉良阎斌伦
- 关键词:系统发育线粒体基因组
- 西施舌外套膜蛋白质组双向电泳体系的构建被引量:10
- 2009年
- 建立了西施舌(Coelomactra antiquata)外套膜蛋白质组的双向凝胶电泳体系,比较分析了不同pH梯度胶条、水化条件的优化及不同染色方法对双向电泳结果的影响。结果表明:用pH 4~7的非线性胶条,水化时加上除盐步骤,采用硝酸银染色,即可获得高分辨率、高重现性的双向电泳图谱,为进一步研究西施舌外套膜蛋白质的组成奠定了基础。
- 田美申欣程汉良孟学平
- 关键词:双向电泳蛋白质组学外套膜
- 10种软骨鱼线粒体基因组特征分析被引量:5
- 2011年
- 综合分析了软骨鱼10个物种的线粒体基因组全序列,全面揭示软骨鱼线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等。软骨鱼10个物种线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因,而且其基因排列完全相同。真鲨目和鳐形目线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值都远远低于1(0.019 1~0.156 4),显示出较强的纯化(负)选择。基于线粒体基因组构建的系统发育树结果显示,软骨鱼纲分为两支:全头亚纲和板鳃亚纲。在板鳃亚纲内部,鳐形目和鲼形目聚为一支;真鲨目、鼠鲨目、须鲨目、虎鲨目和角鲨目聚为一支,其亲缘关系为:{[(真鲨目+鼠鲨目)+须鲨目)]+虎鲨目}+角鲨目。软骨鱼线粒体基因组差异位点分析表明,在软骨鱼群体遗传的研究中,nad5和nad4基因是理想的分子标记,可以作为cox1基因辅助的分子标记,用于分析软骨鱼不同群体之间的遗传多样性,为其生物多样性的保护及合理利用其生物资源提供更多保障。
- 申欣田美孟学平程汉良
- 关键词:线粒体基因组系统发育分子标记