孙桂芹
- 作品数：36 被引量：74H指数：6
- 供职机构：复旦大学更多>>
- 发文基金：宁波市自然科学基金国家科技重大专项绍兴市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 单核苷酸多态性在多基因遗传病研究中的作用
- 多基因遗传病是多对微效基因协同作用并与环境因素共同导致的疾病，与单基因疾病相比，多基因疾病涉及的易感基因数量多，发病原因也更为复杂。目前常见的肿瘤、心血管疾病、糖尿病等均为多基因遗传病，通常具有如下特点：(1)先证者的各...
- 陈菁孙桂芹
- 关键词：多基因遗传病单核苷酸多态
- 文献传递
- 脑膜炎败血伊丽莎白金菌感染的临床分布及耐药性分析被引量：13
- 2014年
- 目的探讨脑膜炎败血伊丽莎白金菌(EM)感染的临床分布及其耐药性,为临床治疗和预防EM感染提供依据。方法从浙江省3家三级甲等医院2010年1月至2012年12月收集经法国生物梅里埃公司的VITEK-2系统鉴定的66例EM感染病例,并对临床分离株进行体外药敏分析。结果 EM感染患者主要来自重症监护室(78.8%);菌株主要分离自呼吸道标本,构成比为87.8%;EM感染患者伴有的基础疾病前三位的是呼吸系统疾病、脑部疾病和恶性肿瘤(25.8%、25.7%、16.6%)。体外药敏试验结果表明EM对头孢他啶、头孢曲松、亚胺培南、美罗培南、妥布霉素、多粘菌素B的耐药率高达100%;对氟喹诺酮类左氧氟沙星和环丙沙星的耐药率均低于35.0%;对派拉西林/他唑巴坦、米诺环素及治疗革兰阳性菌的万古霉素敏感率分别为81.8%、97.0%、100%。结论 EM对临床常用的头孢类及碳青霉烯类抗生素有较高的耐药率,临床治疗应根据药敏结果,合理选用抗生素,临床实验室应重视该菌的分离、鉴定,预防EM可能引发的医院感染。
- 孙桂芹李蒙王蕾郭航远俞洪陈菁陈力
- 关键词：耐药性
- 耐萘啶酸甲型副伤寒沙门菌gyrA基因突变研究被引量：1
- 2009年
- 目的研究绍兴地区耐萘啶酸甲型副伤寒沙门菌(SPA)gyrA基因突变情况。方法对52株SPA进行基因扩增,PCR产物纯化后进行双向测序,用OMIGA2.0软件对DNA促旋酶A亚单位序列进行分析比对,确定gyrA基因突变。结果耐萘啶酸SPA在gyrA喹诺酮类耐药决定区(QRDR)氨基酸残基83或87位点发生点突变;其中51株在83位发生突变,1株在87位点发生突变;未发现两个位点同时突变菌株;gyrA QRDR其他部位未发现突变。结论gyrA基因83位突变与SPA耐萘啶酸有直接关系,gyrA基因87位单突变也可导致对萘啶酸耐药;绍兴地区近两年耐萘啶酸SPA主要为83位的TCC→TTC(Ser→Phe)突变。
- 陈菁孙桂芹王宗欣
- 关键词：甲型副伤寒沙门菌GYRA基因
- 一种用于N-糖蛋白去糖基化的糖苷酶及其应用
- 本发明属于糖生物学研究领域，具体涉及一种新型N-糖苷酶，该新型N-糖苷酶命名为二型PNGase F，PNGaseF-II。本发明的N-糖苷酶能够将不同糖链结构类型（高甘露糖型糖链、复合型糖链、杂合型糖链）的N-糖蛋白上的...
- 陈力孙桂芹策力木格
- 文献传递
- 萘啶酸耐药甲型副伤寒沙门菌gyrA基因突变研究
- 抗生素类药物的广泛使用,导致甲型副伤寒沙门菌对常用抗生素的耐药性逐渐升高,给临床治疗带来困难。DNA促旋酶的突变被认为是甲型副伤寒沙门菌对喹诺酮类产生耐药的主要机制。本文对绍兴地区各医院分离到的萘啶酸耐药甲型副伤寒沙门菌...
- 陈菁孙桂芹王宗欣
- 文献传递
- 随机扩增多态性DNA技术(RAPD)在甲型副伤寒沙门菌同源性分析中的应用被引量：1
- 2010年
- 目的:采用随机扩增多态性DNA技术(RAPD)探讨绍兴地区散发的甲型副伤寒沙门菌菌株间的同源性。方法:对临床分离的55株甲型副伤寒沙门菌进行RAPD分型,使用NTSYS-2.10 e软件进行聚类分析。结果:经聚类分析,相似系数在0.70时,55株甲副可以分为6个类群,其中最多的一群内聚集的菌株数达40株;相似系数在0.90时,可以分为17个群,最多的一群内聚集的菌株数达13株;相似系数在1.00时,可以得到10个组群,每组内菌株之间的同源性最高。结论:利用RAPD技术对甲型副伤寒沙门菌进行基因分型对于确定不同来源的甲型副伤寒沙门菌间的同源性具有重要意义。
- 孙桂芹陈菁王宗欣俞洪
- 关键词：甲型副伤寒沙门菌随机扩增多态性DNA同源性
- 氨基糖苷类耐药基因ant(6)在脑膜炎败血伊丽莎白金菌中的分布被引量：3
- 2017年
- 目的检测ant(6)基因在脑膜炎败血伊丽莎白金菌中的分布,为该菌链霉素耐药性的快速检测提供依据。方法收集浙江省3家三级甲等医院的脑膜炎败血伊丽莎白金菌66株临床分离菌,提取细菌基因组DNA,利用ant(6)的特异性引物,进行PCR扩增,并对阳性扩增产物进行测序比对。结果 66株菌中,ant(6)基因阳性61株,阳性率为92.4%,其中4株(6.3%)ant(6)基因检测阳性,但对链霉素不耐药。5株(7.6%)ant(6)基因检测阴性,但是对链霉素耐药。结论 ant(6)基因检测阳性的脑膜炎败血伊丽莎白金菌,90%以上的菌株有耐药表型,少数菌株携带基因,但无耐药表型;ant(6)基因检测阴性,但是有链霉素耐药表型,可能是由其他耐药机制介导,因此,临床应结合耐药基因快速检测和药物敏感性实验结果合理使用抗生素。
- 陈菁李天胜丁丽婧陈力孙桂芹
- 绍兴地区胆石症患者胆汁病原菌分布及抗菌药物敏感性分析被引量：15
- 2011年
- 目的了解绍兴地区胆石症患者胆汁中的病原菌构成及耐药性,指导临床合理应用抗菌药物。方法对2009年1月-2010年6月住院的胆石症患者胆汁标本中分离的287株病原菌及耐药性进行分析,并对革兰阴性杆菌进行ESBLs检测。结果分离到的287株病原菌中,革兰阴性杆菌占68.64%,主要以大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌为主,分别占27.18%和11.50%;革兰阳性球菌占28.57%,以肠球菌属为主,占全部病原菌的25.78%,其中粪肠球菌占8.71%,屎肠球菌占5.92%;真菌占2.79%;肠杆菌属对阿米卡星、亚胺培南、美罗培南、厄他培南具有较高的敏感率;肠球菌属对利奈唑胺、替考拉宁、万古霉素耐药率较低。结论绍兴地区胆石症患者胆汁病原菌感染,以革兰阴性杆菌为主,其中大肠埃希菌最多;各种病原菌对抗菌药物均有不同程度的耐药,因此加强病原菌耐药监测,对临床合理使用抗菌药物有重要的意义。
- 茅国峰孙桂芹
- 关键词：胆石症胆汁病原菌耐药率
- 随机扩增多态性DNA技术(RAPD)在甲型副伤寒沙门菌同源性分析中的应用被引量：2
- 2009年
- 目的以随机扩增多态性DNA(RAPD)技术探讨不同来源甲型副伤寒沙门菌间的亲缘关系。方法采用RAPD技术对临床分离的55株甲型副伤寒沙门菌进行RAPD基因分型,根据marker计算不同扩增片段分子量的大小,使用NTSYSpc-2.10e软件对来源不同的甲型副伤寒沙门菌菌株进行分析。结果相似系数在0.70时,55株菌可以分为6个类群,其中最多的一群内聚集的菌株数达40株;相似系数在0.90时,可以分为17群,最多的一群内聚集的菌株数达13株;相似系数在1.00时,可以得到10个组群,每组内菌株之间的同源性最高。结论分离的55株甲型副伤寒沙门菌有一定的亲缘关系,在遗传学上属于同源,在不断的进化过程中,发生和积累微小的变异,因而使菌株呈现多样性。
- 孙桂芹陈菁王宗欣
- 关键词：DNA技术甲型副伤寒沙门菌同源性分析
- 肺炎克雷伯菌gyr A基因新亚型的发现和对喹诺酮类药物耐药机理的研究
- 2010年
- 目的调查多耐药肺炎克雷伯菌中喹诺酮类耐药相关基因的存在与变异状况。方法收集绍兴市人民医院2007年10月至2009年6月住院患者标本中分离的多耐药肺炎克雷伯菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析1种染色体介导的喹诺酮类耐药相关基因(gyrA基因)和5种质粒介导的喹诺酮类耐药相关基因(qnrA、qnrB、qnrS、aac(6’)-Ⅰb、qepA基因)。结果 gyrA基因83位密码子17株菌(85.0%)有突变,87位密码子7株菌(35.0%)有突变,各分为四种突变方式。SX007株存在同义突变的gyrA基因新亚型(Genbank登录号:GU060628),SX001株、SX002株、SX003株、SX006株、SX017株同时存在有义突变和同义突变的gyrA基因新亚型(Genbank登录号:GU060624-GU060627、GU060629)。另检出aac(6’)-Ⅰb-Cr基因2株(经测序比对证实)(10.0%),qnrB基因1株(5.0%),qnrS基因4株(20.0%),qnrA和qepA基因未检出。结论本组多耐药肺炎克雷伯菌gyrA基因突变率为85.0%(17/20),这是该菌对喹诺酮类耐药的主要原因。
- 陈菁孙桂芹
- 关键词：肺炎克雷伯菌喹诺酮类基因多耐药GYRA
