林姗
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 供职机构：江西师范大学生命科学学院江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室更多>>
- 发文基金：江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室开放基金江西省科技支撑计划项目江西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生化学工程更多>>
- 基于比较基因组学新金分支杆菌底物耐性及产物专一性的分子机制研究
- 徐玲霞王筱兰杨慧林杨林施文杰谢雅雯林姗
- 雄烯二酮高产菌新金分枝杆菌MN4的全基因组测序及序列分析被引量：4
- 2016年
- 【目的】新金分枝杆菌(Mycobacterium neoaurum)MN4是1株经诱变育种获得的高产雄烯二酮,并且能够耐受高浓度底物植物甾醇的突变菌株。为深入研究MN4菌株耐底物的机制及雄烯二酮的生物合成途径,有必要解析MN4菌株的全基因组序列信息。【方法】本研究采用高通量测序技术对MN4进行全基因组测序,然后使用相关软件对测序数据进行基因组装、基因预测与功能注释、COG聚类分析以及次级代谢产物合成基因簇预测等。【结果】新金分枝杆菌MN4基因组装获得33个Contigs,整个基因组大小为5.39 Mb,GC含量为66.9%,编码4920个蛋白基因,序列提交至Gen Bank数据库,登录号为JXYZ00000000。【结论】本研究首次报道了1株高产雄烯二酮菌株MN4的全基因组序列,分析了基因组的基本特征,初步解析了该菌株降解植物甾醇生产雄烯二酮的关键基因,将为MN4的功能基因组学研究及相关次级代谢产物的生物合成途径与异源表达研究提供基础。
- 徐玲霞王筱兰杨慧林杨林施文杰谢雅雯林姗
- 关键词：甾醇全基因组测序生物合成基因簇
