黄淑琳
- 作品数:3 被引量:0H指数:0
- 供职机构:香港大学更多>>
- 发文基金:广东省科技计划工业攻关项目广东省医学科学技术研究基金广州市医药卫生科技项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 肝细胞癌相关长链非编码RNA差异表达的研究
- 2016年
- 目的分析肝细胞癌与正常肝组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),发现可能与肝细胞癌发生发展相关的特异lncRNA。方法采用lncRNA表达谱芯片技术检测5例肝细胞癌和其配对癌旁正常组织中的lncRNA,筛选出差异表达的lncRNA。运用分层聚类分析,对所有的lncRNA进行分类。最后从中选择10个lncRNA用RT-PCR进行定量验证。结果有1359个lncRNA表达水平出现显著性差异,差异倍数〉2倍。其中629个显著上调,占46.2%,其中125个表达5倍以上;730个显著下调,占53.7%,其中110个表达5倍以上。聚类分析(1)基因间lncRNA有11706条,其中与已知编码基因相距<300 kb的lncRNA共有352条。(2)增强子型lncRNA共有1802条,其中与已知编码基因相距<300 kb的lncRNA共有42条。(3)HOX基因簇共有101条。RT-PCR结果有8条lncRNA表达趋势与基因芯片结果一致。对癌组和癌旁组进行检验,有6条差异有统计学意义(P<0.05)。结论与癌旁组织比较,lncRNA肝细胞癌组织中的表达水平明显改变,可能与肝细胞癌的发生发展有关。
- 厉新妍方亮黄淑琳
- 关键词:肝细胞癌长链非编码RNA
- 特异长链非编码RNA在肝细胞癌中的表达和验证
- 2016年
- 目的:分析肝细胞癌组织与配对癌旁组织中表达差异的长链非编码RNA(lncRNA),探讨可能与肝细胞癌发生发展有关的特异lncRNA。方法:采用lncRNA芯片技术,检测5例肝细胞癌和其配对癌旁正常组织中的lncRNA和mRNA,筛选出差异表达的lncRNA和mRNA。运用分层聚类分析,GO分析和pathway分析等生物信息学技术对其进行分类。最后从中选择10个lncRNA用RT-PCR进行定量验证。结果:有1 359个lncRNA表达水平出现显著性差异,差异倍数>2倍。629个显著上调,占46.2%,其中125个表达5倍以上;730个显著下调,占53.7%,其中110个表达5倍以上。聚类分析结果:(1)基因间lncRNA有11 706条,其中与已知编码基因相距<300 kb的lncRNA共有352条。(2)增强子型lncRNA共有1 802条,其中与已知编码基因相距<300 kb的lncRNA共有42条。(3)HOX基因簇共有101条。GO分析将mRNA分成分子功能、生物过程和细胞组分3类。Pathway分析结果:差异表达的mRNA基因所参与的细胞生命活动调控通路共有61条,上调表达的mRNA参与12条通路,下调表达的mRNA参与49条通路。参与细胞周期和化学致癌作用的表达水平明显改变。RT-PCR结果:8条lncRNA表达趋势与基因芯片结果一致。对癌组和癌旁组进行检验,有6条有显著性差异(P<0.05)。结论:与癌旁组织比较,lncRNA肝细胞癌组织中的表达水平明显改变,可能与肝细胞癌的发生发展有关。
- 厉新妍方亮黄淑琳
- 关键词:肝细胞癌长链非编码RNA
- HBV相关慢加急性肝衰竭预后简易评分系统的建立
- 2014年
- 目的:建立 HBV 相关慢加急性肝衰竭(HBV -ACLF)严重度简易评分系统。方法收集620例 HBV -ACLF 患者的临床资料,选择肝性脑病、血清肌酐、血清总胆红素、凝血酶原活动度、感染、肝脏大小、腹水液平等7个临床指标,应用统计学方法并结合临床实际,确定各指标从0~4分评分界点,并累计总分。据此建立模型并确定诊断界点,对此评分模型进行验证。结果对HBV -ACLF 患者临床资料进行统计学分析,交互卡方检验确定各指标评分分值并建立模型。将500例患者分为生存组和死亡组。两组间评分差异有统计学意义(t =25.78,P <0.001)。受试者工作特征曲线(ROC 曲线)下面积0.963,最佳临界值9.5,灵敏度0.98,特异度0.83。120例患者对其进行验证,≥10分预后差,病死率为84.3%,≤9分组预后好,病死率为3.5%。两组病死率比较差异有统计学意义(χ^2=72.2,P <0.001)。结论本评分系统可用于 HBV -ACLF 预后评估,具有简易、敏感、客观的优点。
- 厉新妍黄淑琳方亮雷瑞祥柯伟民
- 关键词:肝功能衰竭预后