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王琦

作品数:3 被引量:5H指数:2
供职机构:哈尔滨医科大学生物信息学系更多>>
发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
相关领域:生物学理学自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇理学

主题

  • 3篇基因
  • 2篇基因表达
  • 2篇基因表达谱
  • 2篇表达谱
  • 1篇生物学
  • 1篇生物学意义
  • 1篇树分类器
  • 1篇数据挖掘
  • 1篇特征维数
  • 1篇维数
  • 1篇稳健性
  • 1篇聚类
  • 1篇聚类分析
  • 1篇基因数目
  • 1篇疾病分类
  • 1篇功能模块
  • 1篇分类器
  • 1篇WEB平台
  • 1篇IDEA

机构

  • 2篇哈尔滨医科大...
  • 2篇哈尔滨工业大...

作者

  • 3篇王琦
  • 3篇郭政
  • 2篇张田文
  • 1篇李霞
  • 1篇王海芸
  • 1篇许杰
  • 1篇李霞

传媒

  • 1篇同济大学学报...
  • 1篇高技术通讯
  • 1篇生物信息学

年份

  • 1篇2006
  • 1篇2005
  • 1篇2003
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
基于基因功能表达谱的疾病分类:抗基因缺失的稳健性被引量:3
2005年
利用基因表达谱数据,按 Gene Ontology基因功能分类体系,将基因模块化地组织到具有显著生物学意义的低维差异表达功能模块单元中,构造新的指标用于分类疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的分析新途径.新算法可稳健地抗基因检测缺失,抗基因表达变异,抗检测误差,并可以显著地降低分类特征维数(参与疾病分类的基因数目).采用淋巴瘤数据集,比较了基于功能表达谱和常规的基因表达谱的决策树分类器.结果显示,基于功能表达谱可以得到高准确度的疾病样本分类结果,能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.通过仿真分析,进一步显示了基于功能表达谱的分类方法具有抗基因检测缺失的稳健性.
郭政张田文王琦李霞
关键词:稳健性生物学意义基因数目特征维数树分类器
基于功能模块的基因表达谱聚类分析被引量:2
2006年
按GENE ONTOLOGY基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NC I60数据集,通过功能表达谱对组织样本进行聚类分析.结果显示,新算法不但得到高准确度的样本分型结果,而且能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.同时,用基于功能表达谱对组织样本进行聚类分析可以显著降低特征维数,有效地处理高检测误差与基因表达变异问题.
郭政张田文王琦王海芸
关键词:基因表达谱聚类
基因表达谱信息分析软件IDEA与WebGEA
2003年
基因芯片具有高通量快速并行检测基因表达水平的功能,是功能基因组研究的有力工具。针对基因芯片常规的信息分析需要,我们初步设计开发了基因表达谱的信息学分析平台,包括基于单机的软件IDKA(Information Digger for Experiments of microArray)与网络应用程序WebGEA(WEB GeneChip Expression Analysis),分别支持用户运行独立程序与在因特网上提交数据运行服务器程序来完成数据采掘分析任务。该平台得到良好的应用,是解决基因芯片常规的信息分析问题的一个方便工具。
王琦许杰郭政李霞
关键词:基因表达谱数据挖掘WEB平台
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