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涂阴肺结核病人血清蛋白组学研究及SHBG蛋白验证被引量：3: 2016年; 目的利用蛋白质组学方法发现和验证涂阴肺结核的候选血清标志物。方法采用i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例健康对照者和30例涂阴肺结核患者血清的差异表达蛋白,通过生物信息学分析差异蛋白之间的相互作用;对差异蛋白SHBG进一步ELISA验证,应用SPSS 20.0统计软件绘制ROC曲线。结果三次独立重复实验一共筛选和鉴定置信度在95%以上蛋白283种;以正常人血清为对照,涂阴肺结核患者血清中有差异表达蛋白31种(P<0.05),其中17个蛋白表达上调,14个蛋白表达下调;蛋白相互作用发现SHBG等12种蛋白处于相互作用网络关键节点;ELISA验证结果显示涂阴肺结核组血清SHBG蛋白浓度高于正常对照组和肺炎组(P<0.001),与蛋白组学筛选和鉴定的结果一致;以SHBG检测值绘制的ROC曲线下的面积是0.92(P<0.001),其诊断涂阴结核病的灵敏度和特异度分别是87.14%和85.11%。结论 i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS技术筛选和鉴定到的12种关键节点蛋白可能是涂阴结核病潜在标志物,SHBG是值得进一步研究的肺结核候选血清标志物。; 周颖李翠萍何晓李洪涛臧宁郑艳燕何敏; 关键词：蛋白质组学同位素标记

利用定量蛋白组学方法发现涂阴肺结核患者血清差异表达蛋白并验证FCN3被引量：1: 2016年; 目的:利用定量蛋白组学方法检测涂阴肺结核(SNP-TB)患者血清差异表达蛋白,并验证关键蛋白FCN3。方法:采用iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例健康对照者和30例SNP-TB患者血清的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析,对关键差异蛋白FCN3进一步ELISA验证,并绘制ROC曲线。结果:3次独立重复实验一共筛选和鉴定到344种蛋白质,其中置信度在95%以上有283种蛋白质;以正常人血清为对照,SNP-TB患者血清中呈显著性差异表达的蛋白有26种(P<0.05);生物信息学分析发现差异蛋白主要定位在细胞外,参与酶抑制剂活性和应激反应过程;蛋白相互作用发现FCN3等9种蛋白处于相互作用网络关键节点;ELISA验证SNP-TB组血清FCN3蛋白表达水平显著低于正常对照组和涂阳肺结核组(P<0.001),与蛋白组学结果一致;ROC曲线下的面积为0.929,灵敏度和特异度分别是81.24%和83.31%。结论:iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS技术能够有效的筛选和鉴定血清差异表达蛋白;FCN3是值得进一步研究的肺结核候选血清标志物。; 周颖李翠萍何晓李洪涛臧宁郑艳燕何敏; 关键词：涂阴肺结核差异蛋白

蛋白组技术发现和验证耐多药肺结核潜在血清标志物FCN3被引量：2: 2016年; 目的利用血清蛋白组学技术筛选和鉴定耐多药肺结核患者血清差异表达蛋白。方法采用i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选健康体检者、肺炎患者和耐多药肺结核患者血清的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析;对差异蛋白FCN3进行MRM相对定量验证。结果一共筛选和鉴定到248种蛋白质,其中置信度在95%以上有92种;以正常对照者和肺炎患者血清为对照,在耐多药肺结核患者血清中发现和鉴定出29种差异表达蛋白(P<0.05),其中16种表达显著增高,13种表达显著降低,FCN3在耐多药肺结核患者血清中表达降低(P<0.05);MRM相对定量验证显示,与正常对照组相比,FCN3在肺炎和耐多药肺结核组中积分峰面积分别为0.818 5±0.037 7和0.378 6±0.020 2,FCN3在耐多药肺结核组表达水平明显降低(P<0.005)。结论 MRM验证FCN3的表达水平与血清蛋白组学筛选的结果一致,FCN3可能是耐多药肺结核潜在的血清标志物。; 黄雪静李翠萍李洪涛周颖何敏; 关键词：耐多药肺结核基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱标志物

不同统计方法在手足口病季节性分析中的比较研究被引量：15: 2015年; 目的比较不同统计方法在手足口病季节性研究中的应用价值,为手足口病季节性防控提供科学依据。方法以南宁市手足口病为例,收集2006-2009年南宁市各乡镇、城区手足口病的新发病例数,利用流行曲线、季节指数、变异系数、圆形分布法以及扫描统计量等方法分析手足口病的季节性趋势。结果流行曲线直观描述南宁市手足口病高发月份集中在4-7月,12月和1月呈现小高峰。季节指数判断1月、4-7月为南宁市手足口病的高发季节,以5-6月份发生强度最大。圆形分布显示南宁市手足口病的高发日期为5月10日,高发时段跨度大。变异系数显示5-6月和9月的变异程度较低,为潜在的季节性月份。扫描统计量显示南宁市手足口病高发时段集中在4月下旬到7月上旬之间,以5-6月份最为高发;高发时段的相对风险为非高发时段的1.33-1.85倍。结论不同统计方法在检测手足口病季节性规律时的侧重面、精确性和实际意义有所不同,探测到高发时段的价值和意义亦有所不同。变异系数描述疾病在某时段内流行强度的变异度,变异度高说明疾病流行强度的强弱交替,但变异度低可能意味着普遍高发或普遍低发。流行曲线、季节指数虽可直观描述手足口病的季节趋势,但缺乏统计推断,可能受随机误差的影响。圆形分布可定量探测出具有统计学意义的手足口病高发日期和高发时段,但可能因高发时段跨度较大,而失去实际意义。扫描统计量兼顾手足口病的时空信息,在校正单纯性时间变化趋势和周内效应后,可探测到更精确、稳定和更具实际意义的高发时段,在探讨手足口病的季节趋势中具有优势。; 唐咸艳周颖李峤欧阳云仇小强黄高明周红霞; 关键词：手足口病圆形分布法

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周颖

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