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北京市昌平区肺结核发病数ARIMA模型预测被引量：7: 2015年; 目的探讨自回归滑动平均混合模型(autoregressive integrated moving average model,ARIMA)模型在北京市昌平区肺结核发病数预测中的应用,阐述建模过程并预测2015年昌平区肺结核发病数,为制定防治策略合理配置资源等提供参考。方法采用全国结核病网络专报系统中2009 2014年现住址为北京市昌平区的肺结核报告发病数数据,通过模型识别、参数估计、检验诊断及模型评价,建立昌平区结核病发病数的ARIMA模型,并预测其2015年肺结核发病数。结果现住址为昌平区的肺结核发病数预测模型为ARIMA(0,1,1)(0,1,1)12,预测2015年的新发报告肺结核患者总数为851例,模型2015年第一、二季度(1 6月)预测误差率为1.65%,不到10%,模型预测精度较好。结论 ARIMA模型适用于昌平区肺结核发病数的早期预测。; 原梅张治国豆智慧王路钦张峣李卫民高基民; 关键词：ARIMA模型结核病发病数

不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究: 目的：在规范化的结核分枝杆菌数目可变串联重复序列多态性(15-VNTR)基因分型的基础上,构建涵盖我国31个省的VNTR数据库,每个省份优化出一套(VNTR)位点组合,为我国结核病预防控制提供科学依据. 方法：...; 陈海霞刘静仪张治国原梅贾俊楠孙照刚黄海荣蔡超高基民李卫民; 关键词：结核病分子流行病学结核分枝杆菌基因分型

不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究被引量：4: 2017年; 目的在规范化的结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）可变数目串联重复序列（variable number of tandem repeats，VNTR）基因分型的基础上，构建我国31个省（自治区、直辖市）VNTR数据库，每个省优化一套VNTR位点组合，为我国结核病预防控制策略的制定提供科学依据。方法对2007－2008年全国结核病耐药性基线调查的4 116株MTB15位点VNTR（15-VNTR）基因分型。汉高指数（Hunter-Gaston Index，HGI）分析每个位点的分辨率。依据谱系流行特征，以分辨率高和稳定性强为原则，为各省设计一套VNTR优化组合（12-VNTR、10-VNTR、8-VNTR和5-VNTR），采用HGI和成簇率进行评价。结果完成了涵盖率为96.36%（3 966/4 116）MTB完整15-VNTR图谱。发现QUB11b、MIRU26等7个高分辨率位点；QUB26、MIRU16、Mtub21、QUB11b在部分地区遗传稳定性差。内蒙古自治区、重庆市、黑龙江省的最优组合为10-VNTR，其他各省的最佳组合为8-VNTR。结论 VNTR数据库的建立将推动全国范围MTB传染源的追踪；各省优化VNTR组合的推出有助于当地结核病疫情的监测和群体遗传学的研究。; 陈海霞蔡超刘静仪张治国原梅贾俊楠孙照刚黄海荣高基民李卫民; 关键词：结核分枝杆菌可变数目串联重复序列基因分型分辨率

不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究: 2017年; 目的在规范化的结核分枝杆菌（Mycobacteriumtuberculosis，MTB）可变数目串联重复序列（variablenumberoftandemrepeats，VNTR）基因分型的基础上，构建我国31个省（自治区、直辖市）VNTR数据库，每个省优化一套VNTR位点组合，为我国结核病预防控制策略的制定提供科学依据。方法对2007—2008年全国结核病耐药性基线调查的4116株MTBl5位点VNTR（15-VNTR）基因分型。汉高指数（Hunter-GastonIndex，HGI）分析每个位点的分辨率。依据谱系流行特征，以分辨率高和稳定性强为原则，为各省设计一套VNTR优化组合（12．VNTR、10．VNTR、8-VNTR和5-VNTR），采用HGI和成簇率进行评价。结果完成了涵盖率为96．36％（3966／4116）MTB完整15-VNTR图谱。发现QUB11b、MIRU26等7个高分辨率位点；QUB26、MIRU16、Mtub21、QUB11b在部分地区遗传稳定性差。内蒙古自治区、重庆市、黑龙江省的最优组合为10．VNTR，其他各省的最佳组合为8-VNTR。结论VNTR数据库的建立将推动全国范围MTB传染源的追踪；各省优化VNTR组合的推出有助于当地结核病疫情的监测和群体遗传学的研究。; 陈海霞蔡超刘静仪张治国原梅贾俊楠孙照刚黄海荣高基民李卫民; 关键词：结核分枝杆菌可变数目串联重复序列基因分型分辨率

四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征研究被引量：3: 2015年; 目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定，采用3（2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复序列基因分型，评价各位点的分辨力。构建N—J树分析其系统进化；构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构；采用分子方差分析不同谱系MTB的群体问遗传分化；采用贝叶斯模型计算菌株最近共祖年代。结果通过LSP可将413株MTB分为两大谱系，其中北京谱系占56．2％（232／413），欧美谱系占43．8％（181／413）。两谱系MTB在人群中的分布（性别、年龄、民族以及菌株耐药性）差异无统计学意义（P〉0．05）。北京谱系MTB的N—J树呈放射状分布，最小跨度树中有72．4％（168／232）的菌株被划分到同一“克隆复合群”；欧美谱系MTB的N—J树呈枝状分布，最小跨度树中呈现出多个“克隆复合群”。北京谱系MTB在该地区有显著的群体间遗传分化（F ST=0．01891，P〈0．05），而欧美谱系MTB群体间遗传分化不显著（F ST=0．00519，P〉0．05）。欧美谱系MTB中最大菌株复合群的最近共祖年代为723（95％CI：517-946）年。结论北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行；两谱系MTB的群体间遗传分化存在差异；欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件（约720年前的战争）有关。; 李颖付育红原梅董玲玲黄海荣李卫民高基民; 关键词：结核分枝杆菌群体遗传学

不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究: 目的在规范化的结核分枝杆菌数目可变串联重复序列多态性(15-VNTR)基因分型的基础上,构建涵盖我国31个省的VNTR数据库,每个省份优化出一套(VNTR)位点组合,为我国结核病预防控制提供科学依据。方法对2007—20...; 陈海霞刘静仪张治国原梅贾俊楠孙照刚黄海荣蔡超高基民李卫民; 关键词：VNTR 基因分型; 文献传递

Xpert MTB/RIF检测非呼吸系统标本中结核分枝杆菌及其利福平耐药性研究: 目的:肺外结核的诊断一直是困扰临床的难题。临床上，肺外结核病变部位分散且病灶结核菌量少，传统的涂片、培养阳性率低，耗时长，常不能满足临床快速诊断和及时治疗的需求。Xpert MTB/RIF为一种新型的分子诊断技术，其以结...; 原梅; 关键词：肺外结核利福平耐药结核分枝杆菌

四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征研究被引量：1: 2015年; 目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定，采用x^2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复序列基因分型，评价各位点的分辨力。构建N—J树分析其系统进化；构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构；采用分子方差分析不同谱系MTB的群体间遗传分化；采用贝叶斯模型计算菌株最近共祖年代。结果通过LSP可将413株MTB分为两大谱系，其中北京谱系占56．2％（232／413），欧美谱系占43．8％（181／413）。两谱系MTB在人群中的分布（性别、年龄、民族以及菌株耐药性）差异无统计学意义（P〉0．05）。北京谱系MTB的N-J树呈放射状分布，最小跨度树中有72．4％（168／232）的菌株被划分到同-“克隆复合群”；欧美谱系MTB的N—J树呈枝状分布，最小跨度树中呈现出多个“克隆复合群”。北京谱系MTB在该地区有显著的群体间遗传分化（Fst=0．01891，P〈0．05），而欧美谱系MTB群体间遗传分化不显著（Fst=0．00519，P〉0．05）。欧美谱系MTB中最大菌株复合群的最近共祖年代为723（95％CI：517～946）年。结论北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行；两谱系MTB的群体间遗传分化存在差异；欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件（约720年前的战争）有关。; 李颖付育红原梅董玲玲黄海荣李卫民高基民; 关键词：结核分枝杆菌群体遗传学

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原梅

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