赵飞
- 作品数:141 被引量:724H指数:15
- 供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家自然科学基金中国疾病预防控制中心青年科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 基于颜色判定的环介导等温扩增检测人型支原体的研究被引量:4
- 2018年
- 目的建立一种基于颜色判定的快速、灵敏、简便的人型支原体环介导等温扩增(LAMP)方法。方法使用PrimerExplorer V5软件设计针对人型支原体MHO_2540基因保守区域的4条特异等温扩增引物,用羟基萘酚蓝(HNB)作为结果判读指示剂并优化体系中dNTPs、MgSO_4浓度,建立人型支原体LAMP检测方法,进行灵敏度、特异度等的检测并与普通PCR比较。结果LAMP对标准浓度人型支原体核酸的检测限约为10^(2 )CFU,与普通PCR相同,但比实时荧光定量PCR差一个数量级。人型支原体阳性临床标本拷贝数>10^(3 )CFU者LAMP阳性率100%,与普通PCR检出率(100%)一致,拷贝数10~1~10^(3 )CFU的弱阳性标本LAMP检出率为63.6%(14/22),普通PCR检出率为31.8%(7/22),差异有统计学意义(χ~2=4.46,P<0.05)。结论LAMP检测人型支原体敏感、特异且操作简便,可在基层推广应用。
- 龚杰冉梦龙吴伟伟刘立雍何利华孟凡亮赵飞
- 关键词:人型支原体环介导等温扩增技术临床标本分子诊断
- 中国碘缺乏病(IDD)监测方案评估的定性研究被引量:6
- 2012年
- 目的探讨《全国碘缺乏病监测方案(试行)》的管理、实施、效果和可能存在的问题,为我国完善碘缺乏病(iodine deficiency disorders,IDD)监测方案、最终消除IDD提出建议和科学依据。方法选取新疆维吾尔自治区、西藏自治区、甘肃省、山东省、河北省、广东省、吉林省、四川省以及云南省为研究现场,对不同工作层面的IDD防治工作人员进行个人深入访谈。结果 IDD监测方案的实施促进了我国IDD监测体系的完善,为消除IDD做出了巨大的贡献,各级卫生行政部门及监测单位基本能够按照监测方案的要求开展监测工作,但监测过程中重点抽样监测与随机抽样监测的时间间隔短、重点抽样监测抽样范围规定死板、高危监测范围扩大化、各部门间缺乏配合以及全国碘盐监测管理信息平台不稳定等问题在一定程度上影响了监测工作的顺利开展。结论我国IDD监测已经形成了一个有机的监测体系,《全国碘缺乏病监测方案(试行)》是可行、有效的,但是实施细则有待进一步完善。
- 姚保栋赵琦赵根明周艺彪周颖赵飞王和兴何明祯李源培姜庆五
- 关键词:个人深入访谈
- 幽门螺杆菌动物模型驯化菌株SS1与其初始菌株的差异蛋白质组分析被引量:4
- 2009年
- 目的:比较H pylori动物模型适应菌株SS1与其初发菌株10700间蛋白质组差异,试图获得H pylori在小鼠体内适应过程中可能与定植能力增强相关的蛋白特征.方法:在相同件下培养SS1菌株及其初始菌株,并制备全菌蛋白样品,相同实验条件下重复3次,样品经二维电泳分离,扫描获得数字化的电泳胶图像并用ImageMaster2D图像分析软件比较分析,识别SS1与初始菌株间的差异蛋白点.取3次制备的样品间的共同差异点进行胶内酶解,经基质辅助激光电离解析飞行时间质谱(MALDI-TOF-TOF/MS)获得肽质量指纹图谱,用Mascot软件在Swiss-Prot和NCBI数据库中搜索匹配蛋白.结果:表达量有明显下降的11个点,经鉴定对应10个蛋白:4个属于H pylori的氧化还原系统,即过氧化氢酶、超氧化物双歧酶、硫氧环蛋白和环氧蛋白还原酶;5个蛋白与代谢有关,即脯氨酸肽酶(proline peptidase)、果糖磷酸氢盐醛缩酶(fructose-bisphosphate aldolase)、无机焦磷酸酶(inorganic pyrophosphatase)、3-含氧酸辅酶A转移酶亚单位B(3-oxoacid CoA-transferase subunit B)和延伸因子(elongation factor P);另1个蛋白为假想蛋白HPAG0942.结论:H pylori在小鼠体内的定植适应过程中,伴有代谢酶表达的降低和抗氧化水平的减弱,提示代谢和抗氧化能力适度下调可能与菌株的定植力增强相关.
- 李晶赵飞肖迪何利华张建中
- 关键词:幽门螺杆菌动物模型二维电泳
- 切割耶尔森氏鼠疫杆菌F1抗原的方法及相关应用
- 本发明提供了一种切割耶尔森氏鼠疫杆菌F1抗原的方法及相关应用。所述的切割鼠疫耶尔森氏杆菌F1抗原的方法包括:对F1抗原进行切割,得到两个以上切割片段,且使其中至少两个片段各包含至少一个完整线性表位。该方法可以进一步用于分...
- 张建中王鹏闫笑梅赵飞肖迪
- 文献传递
- 咽拭子与支气管肺泡灌洗液荧光定量PCR检测儿童肺炎支原体感染分析被引量:14
- 2019年
- 目的了解咽拭子标本以及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本在肺炎支原体(MP)临床核酸检测、细菌定量以及实验室分离培养中的效果,初步评估咽拭子作为核酸检测及分离培养标本的意义,并评估MP肺炎患儿的同期咽拭子的MP核酸载量能否准确预测出BALF的MP核酸载量。方法采集29例MP肺炎住院患儿的同期咽拭子及BALF,利用人源性β-globin内参基因质控所有标本采集及核酸提取质量,合格标本使用MP荧光定量PCR对同一患儿同期咽拭子及BALF标本中MP进行定量分析,计算两种标本的MP核酸载量。并对所有标本进行MP培养,比较两类标本的MP阳性培养率、细菌污染率。结果标本的β-globin内参基因检测阳性率为100%,咽拭子和BALF标本荧光PCR检测阳性率均为86.2%(25/29),其中咽拭子MP核酸定量范围是3.2×10^2拷贝/ml^1.8×10^7拷贝/ml,BALF为6.8×10^2拷贝/ml^5.4×10^8拷贝/ml。两种方法检测结果一致率为93.1%(27/29)。按照BALF标本MP载量递增排序后,阳性标本的咽拭子载量没有显示出类似的伴随升高趋势。BALF标本培养阳性率为65.5%(19/29),标本污染率为6.9%(2/29);咽拭子标本的MP培养阳性率为51.7%(15/29),标本污染率为51.7%(15/29)。结论咽拭子可以作为MP荧光PCR定性检测标本使用,但其不适合用于MP的定量研究,这说明咽拭子的MP核酸载量与BALF中载量不存在明显的相关性;BALF相比咽拭子标本培养率高、污染率低,更适合MP分离培养研究。
- 刘金荣刘立雍赵顺英徐慧唐晓蕾张建中赵飞
- 关键词:肺炎支原体支气管肺泡灌洗液咽拭子荧光定量PCR
- 多种一步法快速提取DNA对肺炎支原体PCR检测的影响被引量:1
- 2018年
- 目的对比不同一步法提取DNA在肺炎支原体PCR检测中的效果及应用范围,为临床标本中肺炎支原体的检测提供依据。方法以两种经典的DNA提取一步法(ROSE和Chelex-100法)及其优化方案和商品化DNA提取试剂盒,提取肺炎支原体纯培养菌株及30份肺炎支原体阳性临床咽拭子标本DNA,分别进行普通PCR和荧光PCR检测,对比不同方法提取的DNA对PCR检测结果的影响。结果 ROSE法和Chelex-100一步法中的SDS严重影响Taq酶活性,提取物稀释100倍方可进行荧光PCR扩增,稀释10倍可用于普通PCR扩增。改良的Chelex-100一步法提取肺炎支原体纯菌DNA产量最高,且PCR扩增效果最好。对于30份临床标本来说,试剂盒法、改良Chelex-100法和水煮法的阳性率分别为100.00%(30/30)、80.00%(24/30)和43.33%(13/30),且对相同肺炎支原体阳性标本提取的DNA,试剂盒法检测的循环阈值(Ct值)比上述两种方法分别小1.95和2.38。结论经典一步法提取的DNA必须经稀释后方可作为扩增模板。改良的Chelex-100法操作简便,可用于纯菌培养的DNA提取。临床标本中肺炎支原体DNA提取以试剂盒法最优,改良的Chelex-100法提取的DNA也可用于临床标本中肺炎支原体的检测,但不可用于定量分析。
- 张军鸽赵飞刘立雍马闪珊单小云
- 关键词:肺炎支原体聚合酶链反应临床标本
- 一种用于肺炎支原体的多位点SNP基因分型方法
- 本发明公开了一种用于肺炎支原体的多位点SNP基因分型方法,属于肺炎支原体基因分型技术领域。本发明通过对肺炎支原体全基因测序株序列比对分析,筛选出遗传稳定、种间区分度高的6个SNP位点,并将其组合使用,可将肺炎支原体分成6...
- 赵飞张建中肖迪龚杰刘立雍何利华孟凡亮
- 文献传递
- 幽门螺杆菌与免疫性肾炎相关性及其致病机制研究
- 吴忠标张建中李云生何利华林曦赵飞柯颖杰曹奇志林国兵王卫军郑敏巧江天
- 人类肾小球肾炎的发病多与免疫致病机制有关,越来越多的研究发现免疫致敏参与或导致肾脏损害,使免疫性肾炎的发病机制研究成为肾炎研究的热点。幽门螺杆菌作为唯一一种可胃内感染的细菌,却可以在许多免疫性肾炎患者的肾组织活检标本中发...
- 关键词:
- 关键词:幽门螺杆菌肾炎
- 幽门螺杆菌与胃上皮细胞不同作用时间点蛋白质组的差异分析被引量:5
- 2008年
- 目的:分析幽门螺杆菌(Hpylori)与人胃腺癌上皮细胞(humangastric adenocarcinoma epithelial,AGS)的相互作用蛋白质组学差异.方法:采用双向凝胶电泳分离Hpylori26695株与AGS细胞相互作用0.5、2、4h时间点的细胞和黏附菌的全蛋白样品,考马斯亮兰染色,ImageMster2D图像分析软件比较分析,识别差异蛋白,将差异蛋白点进行胶内酶解,经基质辅助电离解析飞行时间质谱(MALDI-TOF-TOF/MS)获得肽质量指纹图谱(PMF),通过搜寻蛋白质数据库完成对差异蛋白的鉴定.结果:对0.5、2、4h时间点图谱差异蛋白点分析共发现主要差异蛋白点66个,对其中34个(共对应16种蛋白)最终完成准确鉴定,2h后8种蛋白开始上调,其中2种是细胞来源,6种Hpylori来源;4h时4种细胞来源蛋白下调,并有4种新的蛋白开始被观察到.在共感染的早期,细胞的琥珀酸脱氢酶、Hpylori的抗氧化酶类、黏附素以及HSP60表达上调.感染晚期主要是细胞来源的亲环素A、新生多肽相关复合物α多肽开始表达,Hpylori来源的尿素酶、非血红素铁蛋白等蛋白明显出现在黏附菌成分中.结论:Hpylori与AGS细胞相互作用过程中,细菌和细胞蛋白表达均存在明显时序性变化,早期相互作用则主要表现为以与黏附等有关的蛋白表达变化,后期向有利细菌存活和增殖的方向发展,并呈现出与免疫逃逸和病理损伤相关的变化.
- 宋衍燕赵飞肖迪马广源孟凡亮何丽华张建中
- 关键词:幽门螺杆菌共培养蛋白质组
- 2010-2017年北京市昌平区结核病登记率分析被引量:2
- 2019年
- 目的分析2010-2017年北京市昌平区结核病患者登记情况及其流行变化趋势。方法从结核病信息管理系统和北京区域统计年鉴收集2010-2017年北京市昌平区结核病患者登记数据及人口、经济等相关数据,通过构建Probit回归模型对数据进行拟合与分析。结果2010-2017年年份与活动性肺结核患者登记率近似存在二项式关系。剔除≥65岁常住人口比例和常住外来人口比例后,以年份平方项、年份、国内生产总值(GDP)作为自变量拟合Probit回归模型,模型适合该数据(Pearsonχ^2=6.510,P=0.164;对数似然比χ^2=6.613,P=0.158)。Probit回归模型拟合结果显示,2010-2012年结核病登记率呈现下降趋势;2012-2017年结核病登记率呈上升趋势(Waldχ^2=1.994×107,P<0.001)。排除年份因素对活动性患者登记率的影响后,GDP与活动性结核病患病率的回归系数为-0.001 5,活动性结核病患者登记率随着昌平区GDP的增加而降低(Waldχ^2=56.620,P<0.001)。昌平地区活动性结核病登记率与常住外来人口比例差异无统计学意义。结论2012年后北京市昌平区活动性结核病登记率整体上呈上升趋势;2017年结核病患者登记率较2016年略微下降,提示可能从2017年开始昌平区活动性结核病登记率将逐渐接近平稳状态。
- 邢卫东王路钦王莉杨震张治国李涛杜昕张灿有成君赵飞赵飞
- 关键词:结核病登记率