宋述慧 作品数:9 被引量:79 H指数:4 供职机构: 中国科学院北京基因组研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 北京市科技新星计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 医药卫生 自动化与计算机技术 更多>>
指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒 本发明公开了一种指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒,其采用实时荧光定量PCR法测定肉苁蓉生药材四个基因的表达值,所用引物序列如下:SEQ1;SEQ2;SEQ3;SEQ4;其中基因SEQ2为与总苷含量呈正相... 宋述慧 陈婷婷 李语丽 王西亮 姚富文文献传递 茶薪菇国内外研究进展及展望 被引量:4 2012年 综述了茶薪菇及相近物种的国内外研究现状,讨论了茶薪菇产业发展存在的问题和发展前景。通过与相近物种比较,为探索茶薪菇菌种退化机制提供研究方向,促进茶薪菇产业可持续发展。 刘万飞 路等学 赵宇慧 宋述慧 耿佳宁 胡松年关键词:茶薪菇 生命组学大数据安全管理实践 2024年 生命组学大数据是国家重要基础性、战略性资源,对支撑生命科学基础研究和应用创新、推动生物经济创新发展、维护国家安全具有重要意义。随着数据规模的不断增长,生命组学大数据的安全管理问题逐渐凸显。国家基因组科学数据中心(National Genomics Data Center,NGDC)面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,建立了生命与健康大数据汇交存储、安全管理、开放共享与整合挖掘研究体系,形成了一系列数据安全管理的制度和措施。本文聚焦于生命组学大数据全生命周期的安全管理问题,探讨生命组学大数据安全管理框架,全面分析在数据汇交、存储、管理、共享全生命周期中涉及的安全管理内容,并总结了NGDC在生命组学大数据安全管理方面的成效。最后,本文展望了生命组学大数据安全管理的发展方向,包括完善数据分级分类制度、提升数据分级安全管理技术和加强数据异地灾备建设,以期实现生命组学大数据的安全管理与可持续发展。 王彦青 王彦青 张思思 陈婷婷 陈焕新 张思思 宋述慧 朱军伟 赵文明 陈焕新关键词:数据汇交 数据共享 安全管理 2019新型冠状病毒信息库 被引量:60 2020年 2019年12月在中国武汉开始爆发的新型肺炎已造成全球25个国家/地区的31516人感染、638人死亡(截止2020年2月7日16时),引起该肺炎的病毒被世界卫生组织命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。为促进2019-nCoV数据共享应用并及时向全球公众提供病毒的相关信息,国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)建立了2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR,https://bigd.big.ac.cn/ncov)。该信息库整合了来自德国全球流感病毒数据库、美国国家生物技术信息中心、深圳(国家)基因库、国家微生物科学数据中心及CNCB/NGDC等机构公开发布的2019-nCoV核苷酸和蛋白质序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章等信息,开展了不同冠状病毒株的基因组序列变异分析并提供可视化展示。同时,2019nCoVR无缝对接CNCB/NGDC的相关数据库,提供新测序病毒株系的基因组原始测序数据、组装后序列的在线汇交、管理与共享、国际数据库同步发布等数据服务。本文对2019nCoVR数据汇交、管理、发布及使用等进行全面阐述,以方便用户了解该信息库各项功能及数据状况,为加速开展病毒的分类溯源、变异演化、快速检测、药物研发以及新型肺炎的精准预防与治疗等研究提供重要基础。 赵文明 宋述慧 宋述慧 陈梅丽 马利娜 马利娜 李茹姣 李茹姣 郝丽丽 田东梅 田东梅 唐碧霞 王彦青 朱军伟 陈焕新 章张 鲍一明超级杂交稻SAGE转录组数据的比较分析和杂种优势相关基因数据库的构建 杂种优势是一种普遍而复杂的生物学现象,其遗传分子基础一直是农作物遗传学家研究的热点。两优培九(LYP9)是中国水稻育种学家育成的超级杂交稻,其产量比推广种植稻高出了15%;还表现出其他优异的农艺性状,如生长势、抗逆性强等... 宋述慧关键词:超级杂交 RNA中6-甲基腺嘌呤的研究进展 被引量:11 2013年 RNA酶促共价修饰研究,尤其是m6A(6-甲基腺嘌呤),是RNA生物学研究的一个新兴领域。m6A是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种转录后修饰形式,由包含3个独立组分的复合物mRNA:m6A甲基转移酶催化生成。最新研究发现肥胖相关蛋白FTO可以脱掉m6A上的甲基,表明该甲基化过程是可逆的。抑制或敲除m6A甲基转移酶会引起重要的表型变化,但是由于过去的检测方法受限,m6A确切的作用机制目前为止还不甚清楚。二代测序技术结合免疫沉淀方法为大规模检测m6A修饰并研究其作用机制提供了可能。文章主要综述了m6A的发现史、生成机制、组织和基因组分布、检测方法、生物学功能等及其最新研究进展,并通过比较3种IP-seq技术和数据分析的异同及优缺点,对m6A这种RNA表观修饰研究中尚未解决的问题进行了讨论。 李语丽 于军 宋述慧中国人群参考基因组及基因组变异图谱资源库 被引量:4 2018年 随着人类基因组计划和国际千人基因组计划的实施,已公开数百个中国人个体的全基因组数据。建立高精度的中国人群参考基因组序列,发现并解析中国人群特有的序列变异,是我国未来精准医学研究的基础。为满足未来精准医学研究中国人基因组数据持续增长的科学管理和深入研究的需求,中国科学院北京基因组研究所发展并建立了基于中国人群全基因组测序数据的虚拟中国人基因组数据库(Virtual Chinese Genome Database,VCGDB)和中国人群基因组变异数据库(Genome Variation Map, GVM),面向国内外用户提供数据检索、共享、下载和在线分析服务。本文重点介绍了这两个数据库的特点和功能,以及未来发展与应用前景,以期为中国人群参考基因组及基因组变异图谱资源库的推广使用、发展完善提供有益信息。 宋述慧 滕徐菲 肖景发指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒 本发明公开了一种指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒,其采用实时荧光定量PCR法测定肉苁蓉生药材四个基因的表达值,所用引物序列如下:SEQ1;SEQ2;SEQ3;SEQ4;其中基因SEQ2为与总苷含量呈正相... 宋述慧 陈婷婷 李语丽 王西亮 姚富文文献传递 滩羊不同季节及发情周期不同时期间松果体组织的差异基因筛选 狄冉 王金鑫 刘秋月 潘章源 曹贵玲 黄冬维 孙晓笛 王耀武 杨志敏 储明星 贺建宁 宋述慧 田东梅 相深 梁小军 马青 王建东 陈耀星关键词:滩羊 松果体 转录组测序 泛素系统