陈婷婷 作品数:6 被引量:23 H指数:3 供职机构: 中国科学院北京基因组研究所 更多>> 发文基金: 中国科学院战略性先导科技专项 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 自动化与计算机技术 更多>>
面向国际的生命组学大数据管理体系建设 被引量:4 2016年 组学数据是生命科学研究中的一类极其重要的大数据,特别是二代测序技术的发展推动了组学大数据的爆炸式增长。通过借鉴国际数据中心建设的成功经验,分析国内组学产出数据及数据库建设、数据管理现状及应用需求,构建了面向国际的生命组学大数据管理体系,涵盖组学原始序列归档库、基因组序列数据库、基因表达数据库、基因组变异数据库、DNA甲基化数据库系统等,初步形成中国组学数据资源的存储、共享与应用体系。 赵文明 张思思 唐碧霞 陈婷婷 郝丽丽 桑健 李茹姣 肖景发 章张关键词:大数据 数据共享 生物信息学 基因组 指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒 本发明公开了一种指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒,其采用实时荧光定量PCR法测定肉苁蓉生药材四个基因的表达值,所用引物序列如下:SEQ1;SEQ2;SEQ3;SEQ4;其中基因SEQ2为与总苷含量呈正相... 宋述慧 陈婷婷 李语丽 王西亮 姚富文文献传递 生命组学大数据安全管理实践 2024年 生命组学大数据是国家重要基础性、战略性资源,对支撑生命科学基础研究和应用创新、推动生物经济创新发展、维护国家安全具有重要意义。随着数据规模的不断增长,生命组学大数据的安全管理问题逐渐凸显。国家基因组科学数据中心(National Genomics Data Center,NGDC)面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,建立了生命与健康大数据汇交存储、安全管理、开放共享与整合挖掘研究体系,形成了一系列数据安全管理的制度和措施。本文聚焦于生命组学大数据全生命周期的安全管理问题,探讨生命组学大数据安全管理框架,全面分析在数据汇交、存储、管理、共享全生命周期中涉及的安全管理内容,并总结了NGDC在生命组学大数据安全管理方面的成效。最后,本文展望了生命组学大数据安全管理的发展方向,包括完善数据分级分类制度、提升数据分级安全管理技术和加强数据异地灾备建设,以期实现生命组学大数据的安全管理与可持续发展。 王彦青 王彦青 张思思 陈婷婷 陈焕新 张思思 宋述慧 朱军伟 赵文明 陈焕新关键词:数据汇交 数据共享 安全管理 GSA-Human:人类遗传资源数据管理的公共系统 被引量:10 2021年 GSA-Human是人类遗传资源数据汇交、存储、管理与共享的数据库系统,可提供人类遗传资源数据的上传、下载、浏览、检索等公共服务,并有效支撑了国家重点研发计划科技项目数据的汇交与管理工作。系统具有符合《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》数据安全管理策略,提供公开访问和受控访问相结合的数据使用模式。公开访问数据允许用户自由下载与获取;受控访问数据采用申请-审核的模式,即需要通过数据管理委员会(Data Access Committee,DAC)的授权方可获得下载和使用权限。系统自上线以来,截至2021年7月,汇集数据总量已超5.27 PB。 张思思 张思思 陈婷婷 陈旭 唐碧霞 陈婷婷 董丽莉 朱军伟 孙艳玲 唐碧霞 翟爽 孙玉彬 陈焕新 杜政霖 肖景发 章张 鲍一明 王彦青 陈焕新关键词:数据汇交 数据共享 GSA:组学原始数据归档库 被引量:10 2018年 生命科学的发展已进入组学大数据时代,然而我国至今尚未形成公共数据库存储体系。为弥补国内空白,组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive, GSA, http://bigd.big.ac.cn/gsa)系统遵循国际核苷酸序列数据联盟(International Nucleotide Sequence Database Collaboration,INSDC)相关数据库建设标准,广泛收集各类生命组学原始数据。自2015年底上线运行以来,已获得了包括Cell、Nature、PNAS、GPB等30余个国内外期刊的认可,收录的数据量呈显著增长趋势,提供的数据服务受到国内外广大科研人员的认可。GSA有效缓解了当前我国生命组学数据汇交、存储与共享困难的问题,为我国国家生物信息中心的建设奠定了坚实基础。本文对目前GSA数据汇交、审核、发布与管理等机制进行了深入阐述,以方便用户了解GSA的各项功能,提供更高效的数据服务。 张思思 陈婷婷 朱军伟 周晴 陈旭 王彦青 赵文明关键词:数据汇交 数据共享 指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒 本发明公开了一种指示肉苁蓉生药材总苷含量范围的快速检测方法及试剂盒,其采用实时荧光定量PCR法测定肉苁蓉生药材四个基因的表达值,所用引物序列如下:SEQ1;SEQ2;SEQ3;SEQ4;其中基因SEQ2为与总苷含量呈正相... 宋述慧 陈婷婷 李语丽 王西亮 姚富文文献传递