刘冰
- 作品数:8 被引量:50H指数:4
- 供职机构:中国科学院过程工程研究所更多>>
- 相关领域:医药卫生自动化与计算机技术化学工程文化科学更多>>
- GABA_A五种亚型受体与BZ配基的3D-QSAR研究被引量:2
- 2004年
- GABAA受体是中枢神经系统内重要的抑制性受体,有广泛的神经生理活性.由于镇静/抗惊厥药物在临床上的广泛应用,使得其中苯并二氮杂作用位点尤为重要.我们用比较分子场法(CoMFA)对一系列咪唑苯并二氮杂类化合物(BZ)与五种重组受体亚型的亲和力进行了结构活性关系研究,得到的一组模型都有较高的交叉验证系数.并在此基础上,建立了非交叉验证的一组PLS模型.用该组模型对随机选择的6个化合物组成的测试集进行了预测,都得到了相当满意的结果,表明所建立的一组模型具有良好的预测能力.本研究对于设计高亲和力的BZ受体的配基和研究GABAA受体的模型有指导意义.
- 陆爱军刘冰刘海波周家驹
- 关键词:GABAA抗惊厥药物
- 天然产物数据库数据挖掘及SARS、HDAC抑制剂设计
- 本论文的各种研究,是基于①第二版的中草药数据库,共包含9127种化合物,其中有大约3,000条信息有活性数据和3,922条中药植物源。每个化合物包括2D及3D结构、物理性质、生物活性、来源植物等信息。②第一版海洋天然产物...
- 刘冰
- 关键词:数据挖掘药物设计化学结构
- 文献传递
- 磺胺基羟肟酸类HDAC抑制剂三维定量构效关系
- 2005年
- 组蛋白去乙酰化酶(HDAC)对染色质分布和基因调节起着重要的作用,也是治疗癌症和其它疾病的新靶点.羟肟酸类抑制剂是目前研究最多的组蛋白去乙酰化酶抑制剂.应用比较分子力场(CoMFA)法对一系列磺胺基羟肟酸类HDAC抑制剂进行了结构活性关系研究,得到的模型具有较高的交叉验证系数(q2=0.704).并在此基础上,建立了非交叉验证的偏最小二乘分析(PLS)模型.用该模型对随机选择的6个化合物组成的测试集进行了预测,得到了令人满意的结果,所建模型具有良好的预测能力.本研究对于设计高活性的HDAC抑制剂及抗癌药物都有指导意义.
- 刘冰陆爱军廖晨钟刘海波周家驹
- 关键词:3D-QSAR组蛋白去乙酰化酶
- 中药化学数据库关联规则的挖掘被引量:20
- 2005年
- 数据挖掘是一种新兴的信息处理技术,本文将其中的关联规则运用到中药化学数据的处理,对其中的中医药效、植物科属、化学成分的活性、中药提取物现代药理等数据进行了维间关联规则的挖掘,找到了一系列的强规则,并对这些规则进行了分析,得到了其中有趣的关联规则,同时该关联规则的结果也说明了中药和西药在药效概念上的差异。该结果对于中药现代化,植物化学等相关的研究提供了一种新的思路。
- 陆爱军刘冰刘海波周家驹
- 关键词:数据挖掘关联规则中药化学成分
- 中药化学数据库的数据仓库改造被引量:15
- 2006年
- 目的通过介绍针对中药化学数据库进行的数据仓库改造工作的详细操作步骤,为中药领域的数据研究人员提供参考。方法通过数据库数据构成分析,确定主题,设计数据仓库结构,数据的清洗和整理,维表建设等步骤,建成最终的数据仓库。并进行了初步数据挖掘工作以检验其性能。结果建成的中药化学数据仓库能够很好地支持数据挖掘软件的运行,挖掘得到了预期的结果。结论将中药化学数据库改造为数据仓库,可以很好地支持数据挖掘研究,加深对数据库中数据的利用层次。
- 刘海波乔颖欣刘冰周家驹
- 关键词:数据仓库数据挖掘
- 通过共有化合物建立中药药效和现代药理间的联系被引量:6
- 2005年
- 共有化合物是一类同时存在于多种具有相同药效的中药中的化合物。本研究寻找并分析了“泻下”、“止痛”和“清热”3类共有化合物 ,发现其现代药理活性与所属中药药效类别有很强的联系 。
- 刘海波陆爱军刘冰周家驹
- 关键词:现代药理中药药效清热止痛泻下化合物
- 化学结构二维子结构检索的开发被引量:8
- 2003年
- 将图形通用匹配VF算法应用到化学结构子结构检索中,用面向对象的方法,实现了化学结构数据库中二维子结构检索功能,程序各模块之间相互独立、可移植性强、健壮性好,通过与3DFS比较,结果正确,适于处理大型化学结构数据库,现己应用于中药数据库系统药物先导化合物的发现。
- 刘冰周家驹
- 关键词:面向对象化学结构数据库中药