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排序方式：

海带配子体抑制消减文库的生物信息学分析及lhcf5基因的序列特征研究: 本研究将海带配子体eDNA抑制消减文库所产生的627克隆进行测序，按照序列匹配部分大于100 bp并达到95％以上相似性的标准，使用DNAMAN软件去除低质量的EST，将剩下的618条EST聚类成187条TUGs。其中9...; 陆广琴; 关键词：海带配子体生物信息学序列标签; 文献传递

利用SMART技术构建海带配子体cDNA文库被引量：5: 2006年; 用Trizol试剂提取海带配子体总RNA，用SMARTcDNA文库构建试剂盒构建cDNA文库。经测定原始文库滴度达到1．1×10^8Pfu／ml，文库有500m体积，库容量为5．5×10^7Pfu，通过PCR检测，文库的重组率达100％，扩增出的片段主要集中在0.8—1.8kb，平均插入片段长度约为1．34kb。这些数据表明，已获得高质量的海带cDNA文库，为海带基因资源保存及新基因的克隆奠定了基础。; 胡乐琴陆广琴刘士成王丽丽毕燕会周志刚; 关键词：海带配子体 CDNA文库噬菌体

海带雄配子体抑制消减cDNA文库的生物信息学分析被引量：7: 2009年; 对海带(Laminaria japonica Aresch).雄配子体抑制消减cDNA文库进行生物信息学分析,并通过Northern印迹杂交进一步验证了雄配子体2个优先表达的基因。结果表明,(1)由627个克隆产生的618条高质量cDNA可聚类成187条非冗余序列(NRS);其中93条Contig由524条cDNA拼接而成,剩下的94条为Singleton(只有单条cDNA),冗余率达69.74%。(2)5条NRS因与rRNA基因相匹配而不进行分析;60条NRS与GenBank中注释蛋白基因显著匹配;122条NRS无显著匹配。(3)大部分已知功能的基因与物质和能量代谢(26.7%)、生长发育(13.3%)有关,其中与叶绿体光捕获蛋白复合体有关的基因有106条cDNA,所涉及的有lhcf6基因(62条cDNA)与fcp基因(12条cDNA)等。(4)经Northern印迹杂交证实lhcf6和fcp2个基因在处于营养生长期的雄配子体中优先表达。(5)90条Contig的总G+C含量平均值为52.58%,表明了密码子的使用对G、C有明显的倾向性;20个推测功能蛋白(1520密码子)密码子第三位碱基的使用偏好C(40.7%),其次是G(33.9%);终止密码子的使用偏好TGA(54.5%)。本研究为海带雌、雄配子体差异表达基因克隆、分析和功能基因组学等研究提供了信息。; 陆广琴欧阳珑玲周志刚; 关键词：海带配子体抑制消减杂交 CDNA

海带配子体Ihcf5基因的克隆及在雌、雄配子体中的差异表达分析: 根据海带(Laminaria japonica)雄配子体抑制消减cDNA文库中E04克隆序列及糖海带(L.saccharina)lhcf5基因的cDNA序列(GenBank登录号:AF226861)设计引物并进行反转录P...; 邹丹燕陆广琴毕燕会周志刚; 关键词：海带雌配子体雄配子体; 文献传递

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陆广琴