刘宝玲 作品数:35 被引量:96 H指数:6 供职机构: 山西农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 引进国际先进农业科技计划 山西省回国留学人员科研经费资助项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
陆地棉WRKYⅠ亚家族成员的鉴定与表达分析 被引量:1 2022年 WRKY转录因子参与植物生长发育以及胁迫响应等生命活动的调控。尽管棉花GhWRKY的研究已有报道,但有关GhWRKYⅠ亚家族成员的功能还知之甚少。研究聚焦陆地棉(Gossypium hirsutum)GhWRKYⅠ亚家族成员的全基因组鉴定,以期筛选到参与棉花种子萌发调控的GhWRKY成员;基于陆地棉基因组数据库,应用组学工具对陆地棉GhWRKYⅠ亚家族成员进行鉴定,分析基因结构、蛋白保守基序、保守结构域和蛋白理化性质以及进化关系;基于转录组数据分析GhWRKYⅠ成员在不同组织和5种非生物胁迫下的表达谱;定量PCR(qPCR)检测候选GhWRKY在发育种子的表达特性。结果表明,从陆地棉基因组共鉴定到35个GhWRKYⅠ亚家族基因,不均匀分布于A和D亚基因组的19条染色体上;GhWRKYⅠ蛋白由331~769个氨基酸组成,均为亲水性蛋白并定位于细胞核;GhWRKYⅠ亚家族基因具有3~6个外显子和2~5个内含子。GhWRKY3、GhWRKY6、GhWRKY7、GhWRKY11、GhWRKY12和GhWRKY15未检测到5'-UTR,其余29个GhWRKYⅠ亚家族基因则含有5'-UTR和3'-UTR。仅发现GhWRKY11蛋白C端WRKY保守结构域WRKYGQK序列突变为WRNYGQK,GhWRKYⅠ亚家族成员存在着3种不同的进化方向。转录组数据分析表明,GhWRKYⅠ家族成员在不同组织以及应对不同非生物胁迫呈现差异化表达模式。qPCR分析揭示,GhWRKY24在棉籽萌发72 h内持续上调表达,预示着GhWRKY24可能参与调控棉籽萌发过程。 韩立军 刘宝玲 李润植 薛金爱关键词:陆地棉 WRKY转录因子 基因表达模式 种子萌发 杜氏盐藻DsFAD2基因的鉴定及缺氮胁迫下表达分析 被引量:2 2018年 [目的]w-6脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化油酸(18∶1)去饱和形成亚油酸(18∶2),是多不饱和脂肪酸合成过程中的第一个关键酶。为了探究DsFAD2在盐藻油脂合成积累中的作用。[方法]本文以运城盐湖分离的富油杜氏盐藻(Dunaliella salina)株系(YC-011)为材料,利用高保真PCR技术克隆盐藻DsFAD2基因,并对DsFAD2编码蛋白进行了跨膜区、高级结构及氨基酸序列比对等一系列生物信息学分析。应用qRT-PCR检测DsFAD2基因在氮(N)胁迫培养条件下的表达模式。[结果]DsFAD2蛋白定位于内质网中,有5个跨膜区,具有典型膜结合蛋白的结构特征。此外,DsFAD2也具有所有FAD2蛋白家族所特有的3个组氨酸保守区和芳香族氨基酸序列。系统发育分析发现杜氏盐藻DsFAD2与莱茵衣藻CrFAD2、团藻VcFAD2亲缘关系最近。qRT-PCR表明,与正常培养的杜氏盐藻相比,缺N培养显著诱导DsFAD2上调表达,N胁迫8d时DsFAD2的表达量是未胁迫对照的2.8倍。[结论]DsFAD2参与杜氏盐藻N胁迫响应,促进多不饱和脂肪酸形成,增强藻细胞抗逆性。本研究为进一步解析N胁迫条件下藻细胞油脂富集及响应分子机制提供了科学参考。 宋亚楠 安茜 岳敏 赵熙宁 刘宝玲 薛金爱 李润植烟草NtAGPase基因家族的鉴定及功能解析 2020年 淀粉是重要的碳水化合物,其组成和性质直接影响着烟叶的经济价值。ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)是淀粉合成途径的关键性限速酶,但有关其基因特征、酶活性和代谢调控等在烟草中还未见详细报道。以拟南芥AtAGPase蛋白序列为索引序列,对烟草NtAGPase基因家族进行全基因组鉴定,通过Blast P比对及结构域分析,鉴定出烟草NtAGPase基因家族包含3个大亚基基因(NtLSU1、NtLSU2、NtLSU3)和一个小亚基基因(NtSSU);利用生物信息学工具对其编码蛋白序列进行解析。结果显示,Nt AGPase蛋白分子质量在57.03~58.43 ku,等电点在6.58~8.52;NtLSUs和NtSSU均定位于叶绿体上,属于质体型亚基;NtLSUs基因含有14~15个外显子,NtSSU基因仅含有9个外显子。三级结构预测结果显示,烟草Nt AGPase酶蛋白为异源四聚体,NtAGPase基因家族启动子区域含有多种与光、激素和逆境反应相关的响应元件,预示着其在光合作用、生长发育和逆境响应等过程中行使重要功能。系统进化树分析表明,烟草Nt AGPase蛋白与茄科植物马铃薯亲缘关系更近,而与模式植物拟南芥亲缘关系较远。研究结果可为进一步阐明烟草NtAGPase基因家族的功能及作用机制奠定基础。 陈莹 李腾 高宇 刘宝玲 薛金爱 李润植关键词:烟草 生物信息学分析 大豆二酰甘油酰基转移酶(DGAT)基因家族的鉴定及功能分析 大豆是全球重要的油料和蛋白作物。与蛋白质含量相比,大豆种子含油量遗传变异小,对其进行遗传改良的难度较大。深入解析大豆种子油脂生物合成及其调控分子机制可为大豆高油育种和油脂品质改良提供重要靶标。二酰甘油酰基转移酶(DGAT... 孙岩 刘宝玲 高秀清 张飞 张靖洁 薛金爱 李润植关键词:大豆 底物特异性 生物信息学 文献传递 棉籽中富集棕榈油酸的代谢工程研究 【研究背景】棕榈油酸(C16:1Δ)是种ω-7单不饱和脂肪酸,具有重要的营养和医药保健价值,同时也是制备生物柴油的优异原材料,而这种高值脂肪酸在大豆、油菜、棉花等大田油料作物中含量极低。棉花是一种重要的油料作物,棉籽油中... 刘宝玲 孙岩 薛金爱 毛雪 贾小云 李润植关键词:棕榈油酸 代谢工程 文献传递 油莎豆CebZIP1基因的克隆及表达分析 被引量:3 2021年 bZIP蛋白是参与植物生长发育和抗性调控的一类转录因子。为探究bZIP在能源植物油莎豆中的生物学功能,从盐胁迫的转录组数据中筛选到1个bZIP家族基因,命名为CebZIP1,随后对CebZIP1基因进行克隆、生物信息学分析和基因表达模式分析。结果表明,CebZIP1基因的开放阅读框(ORF)全长为948 bp,共编码315个氨基酸,蛋白质分子质量为34.13 ku,理论等电点为5.02,经预测定位于细胞核内;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。系统发育分析表明,油莎豆与禾本科亲缘关系较近。组织特异性表达模式显示,CebZIP1在所有组织中均能检测到表达,表达量由高到低依次为叶片、根和块茎,揭示CebZIP1基因可能参与调控油莎豆的生长发育过程。同时,CebZIP1基因的表达水平受干旱、高盐及低温胁迫诱导,推测其可能在油莎豆非生物胁迫过程中发挥重要功能。研究结果可为更深入揭开bZIP转录因子在油莎豆发育及非生物胁迫应答中的功能提供一定理论依据。 李腾 孙岩 陈莹 刘宝玲 薛金爱 李润植关键词:油莎豆 克隆 陆地棉KASⅡ酶蛋白结构分析 2017年 β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ(KASⅡ)(EC:2.3.1.179)是控制植物细胞脂肪酸合成和16C与18C脂肪酸比值的关键酶,亦是植物油脂代谢修饰的分子靶标。应用基因组学分析工具从陆地棉(Gossypium hirsutum)基因组鉴定获得一个与已知KASⅡ高度同源的棉花KASⅡ基因GhKASⅡ,编码576个氨基酸肽链,其分子量为61.8 k Da,理论等电点为8.83。蛋白结构预测分析显示,GhKASⅡ蛋白为可溶性酶蛋白,具有质体转运肽,定位于质体中;GhKASⅡ蛋白二级结构主要形式为α-螺旋(32.99%)和无规则卷曲(36.63%)。3D结构模拟表明,GhKASⅡ蛋白为同源二聚体,由2个相同的亚基构成,空间构型为紧密的心形结构。蛋白序列多重比对发现,GhKASⅡ与雷蒙德氏棉、亚洲棉、可可树的KASⅡ蛋白亲缘关系较近,植物KASⅡ蛋白C端保守性高,N端变异大。GhKASⅡ蛋白保守的酶催化活性域位于318~334位(氨基酸残基),其关键酶活位点是位于327位的半胱氨酸。研究结果可为深入解析棉花等油料作物的脂肪酸生物合成机制及油脂遗传改良提供科学参考。 郝青婷 刘宝玲 吉夏洁 李润植 薛金爱关键词:陆地棉 油脂 生物信息学 杜氏盐藻DsKASⅢ基因的分离鉴定及其在氮胁迫下的表达分析 被引量:1 2019年 分离鉴定杜氏盐藻(Dunaliella salina)β-酮脂酰-ACP合酶Ⅲ(β-ketoacyl-ACP synthase Ⅲ,DsKASⅢ)基因并解析其编码蛋白理化特征及功能。依据同源克隆,分离杜氏盐藻DsKASⅢ基因编码序列,采用生物信息学方法解析DsKASⅢ编码蛋白的理化特性及功能,qRT-PCR检测缺氮条件下DsKASⅢ的表达谱,并检测细胞总油脂和β-胡萝卜素含量的变化。结果表明,杜氏盐藻KASⅢ基因含有9个外显子,ORF为960 bp,编码蛋白为319 aa。DsKASⅢ蛋白理论等电点pI为6.21,分子量为33.3 kD。亚细胞定位预测DsKASⅢ蛋白呈镶嵌状锚定在叶绿体内膜上,这种构象有助于利用能量高效率催化生化反应。DsKASⅢ蛋白二级结构主要由α-螺旋(35.11%)、β片层(25.71%)和无规则卷曲(27.90%)组成。三维模拟显示,DsKASⅢ蛋白以同源二聚体形式发挥催化功能的。系统发育分析表明,DsKASⅢ蛋白与莱茵衣藻KASⅢ蛋白亲缘关系最近,暗示其可能有共同的进化来源。qRT-PCR分析揭示,氮胁迫培养条件下,DsKASⅢ基因的表达显著升高,且在缺氮第3天时,表达量达峰值,比正常氮充足培养高1.1倍。氮胁迫培养的藻细胞总脂含量和β-胡萝卜素含量分别比正常氮充足培养的藻细胞提高49.05%和33.20%。氮胁迫能诱导DsKASⅢ基因的上调表达,进而促进杜氏盐藻细胞合成和积累高量油脂和β-胡萝卜素。研究为全面阐明氮胁迫条件下杜氏盐藻油脂及β-胡萝卜素合成及调控机制提供了科学依据。 高慧玲 刘宝玲 高宇 张飞 薛金爱 李润植关键词:杜氏盐藻 氮胁迫 油脂 Β-胡萝卜素 棉籽ω-7脂肪酸合成途径的组装及相关基因的功能研究 棉花是世界上重要的油料作物。棉籽油既可用作食用行业,又可用于制备生物柴油及其它油脂化工品。然而,棉籽油中含有较多的不饱和亚油酸(C18:2Δ9,12,约59%),容易发生酸败变质。因此,在棉籽食用油的加工过程中,一般需经... 刘宝玲关键词:棉花 生物合成 基因功能 文献传递 谷子bZIP转录因子的全基因组鉴定及其在干旱和盐胁迫下的表达分析 被引量:25 2016年 bZIP蛋白是植物转录因子中最大和最保守的一类转录因子,参与调控植物生长发育等多种生命活动。谷子(Setaria italica)是一种重要的C4杂粮作物,其b ZIP基因家族与功能报道较少。利用生物信息学工具,从谷子全基因组中鉴定出73个Sib ZIP转录因子,划分为A、B、C、D、E、G、H、I和X等亚家族。与已测序的禾谷类作物相比,谷子Sib ZIP基因家族在进化中发生缩减。在谷子Sib ZIP蛋白中检测到25种不同的保守氨基酸基序。RNA-seq和定量PCR检测结果表明,在干旱和盐胁迫条件下,多数Sib ZIPs基因不同程度地被诱导表达,预示着部分Sib ZIP成员在谷子干旱和盐胁迫响应中起重要作用。共表达关联性分析进一步揭示19个谷子Sib ZIP转录因子可通过与蛋白激酶或NPR1相关调节蛋白等互作介导谷子胁迫响应。研究结果为全面解析谷子Sib ZIPs基因结构与生物学功能、抗旱分子机制以及分子育种提供了新信息。 刘宝玲 张莉 孙岩 薛金爱 高昌勇 苑丽霞 王计平 贾小云 李润植关键词:谷子