陈彬
- 作品数：27 被引量：45H指数：4
- 供职机构：福建省农业科学院更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 水稻转录因子基因SUSIRI的过表达及RNA干扰对水稻分子及表型效应的分析被引量：1
- 2013年
- 在克隆到水稻转录因子基因SUSIRI的基础上,构建其过表达及RNA干扰载体进行水稻的遗传转化。由潮霉素筛选及分子检测得到的T0代植株经大田栽植,共有34株过表达及46株RNA干扰植株获得T1代转基因种子。继续种植T1植株收获T2代种子,同时用半定量RT-PCR分析苗期及穗期野生型水稻中SUSIRI基因的时空表达谱并比较过表达及RNA干扰植株的SUSIRI基因在叶片及幼穗中的表达状况,发现过表达植株与野生型对照的基因表达基本相同,但RNA干扰植株的表达受到明显抑制。对过表达及RNA干扰植株稻穗性状考察表明:与野生型对照相比,无论是过表达还是RNA干扰,转基因植株的穗粒数、结实率降低,RNA干扰植株表现得尤为严重(P<0.05),但对水稻谷粒粒重的影响并不显著(P>0.05)。SUSIRI基因的过表达未出现使稻穗性状明显改良的株系,而RNA干扰会导致水稻的结实能力严重降低。
- 陈坚连肖华杨志敏陈彬郑斯平朱炳耀
- 关键词：水稻WRKY结实率
- 苏铁珊瑚状根的体外诱导
- 苏铁(Cycad)珊瑚状根是与固氮蓝细菌共生的特殊构造。但蓝细菌如何侵染苏铁珊瑚状根并建立共生关系至今还是个谜。苏铁珊瑚状根的体外诱导和培养是揭开这一奥秘的关键。本研究以福建苏铁(C.revo-luta)的侧根为材料,在...
- 陈彬蔡宣梅郑伟文
- 文献传递
- 结合态氮对满江红内生细菌群落组成和结构的影响被引量：2
- 2020年
- 研究从超微结构和分子水平上探讨结合态氮对满江红(Azolla)叶腔中以共生藻占优势的微生物群落的影响。为排除外源污染并保留其内生菌的多样性,采用茎尖组织培养并添加结合态氮等方法,取得了表面无菌的含藻满江红(AmA)和无藻满江红(AmB)。电镜观察揭示,AmB较AmA的萍体表型有某种程度的修饰。AmA的微生物群落结构以共生藻、内生菌和宿主腺毛及其分泌物组成的生物被膜和藻囊为主要特征,而AmB的叶腔几乎中空。基于16S rRNA基因和nifH基因的高通量测序结果显示,生长于无氮培养液的AmA样品的微生物群落有相当高的多样性,共有17个可操作分类单元(OTU),分属4个细菌门,并有一个以Nostoc azollae为优势的固氮微生物亚群包括草螺菌、根瘤菌和Niveispirillum等。而生长于富含结合态氮培养液的AmB样品的群落多样性明显降低,仅有8个OTU,且以Nostoc azollae为优势的上述固氮微生物亚群全部消失。研究结果表明,通过调整氮素营养,可改变宿主植物的微生物群落组成与结构,进而改良植物的生长发育。
- 陈坚陈彬郑斯平郑益平朱炳耀郑伟文
- 关键词：满江红蓝细菌电子显微镜
- 满江红内生细菌的培养及其抗生素抗性基因的检测
- 2021年
- 【目的】水产养殖中广泛使用抗生素会导致抗生素抗性基因在水环境中的传播。水生植物满江红含有丰富的内生菌,建立满江红内生细菌群落及所含有的抗生素抗性基因的检测方法,可以为水环境中抗性基因的监测提供参考。【方法】用3种不同的培养基对小叶满江红的内生细菌进行培养并对培养物进行宏基因组测序及生物信息学分析。【结果】共得到高质量的序列数据量48.66 G,预测出54180个基因(ORFs)。通过分类学信息数据库NR共注释出1712种微生物物种,在总门水平上属38个门,其中3种培养物中变形菌门(Proteobacteria)的物种丰度均占全部门类的99.14%以上。在总属水平,草螺菌属(Herbaspirillum)的丰度为91%左右,伯克霍尔德菌属(Burkholderia)可达1.2%左右。比对抗生素抗性基因数据库ARDB,3个样品共注释到10个与抗生素有关基因ARG,主要针对杆菌肽(bacitracin)和氯霉素(chloramphenicol)产生抗性。与综合抗生素抗性基因数据库CARD进行比对,获得212抗生素相关基因ARO。按照抗性机制分类,其中对抗生素起直接作用的抗性类基因AR的丰度占88%以上;对抗生素有敏感作用的抗性基因AS的丰度均在7%左右;抗生素靶标类抗性基因AT占4%~6%。【结论】通过3种不同的培养基获得的满江红内生细菌的群落结构,抗生素抗性基因类型基本一致。
- 陈坚郑益平陈彬郑斯平郑伟文
- 关键词：满江红内生菌抗生素抗性基因宏基因组
- 闽江流域不同断面大肠杆菌SepA基因序列及耐药性分析被引量：1
- 2011年
- [目的]分析闽江流域不同断面大肠杆菌(Escherichia coli)SepA基因序列,并对其抗生素耐药性进行比较。[方法]对分离自福建闽江流域不同断面的大肠杆菌的SepA基因进行测序比对,并对该菌株进行耐药性分析。[结果]不同断面分离的大肠杆菌SepA基因序列和抗生素的耐药性均存在一定的差异。[结论]该研究可为今后进行闽江流域污染源的追踪、风险评估和开发特异性探针提供依据。
- 陈彬郑斯平黄文文郑伟文
- 关键词：大肠杆菌抗药性闽江流域
- 小叶满江红(Azolla microphylla)内生细菌多样性的T-RFLP分析被引量：5
- 2012年
- [目的]应用T-RFLP技术揭示小叶满江红内生细菌的多样性。[方法]将分离自实验室无菌培养的小叶满江红内生细菌进行16SrDNA-PCR扩增,产物用MspI、HhaI、HaeIII、HinfI 4种内切酶进行酶切,通过检测带荧光标记的片段,将所获得的数据用相关的软件工具Phylogenetic Assignment Tool(PAT)进行比对分析。[结果]通过比对获得10个科42个属的细菌菌种。[结论]T-RFLP技术配合生物信息学软件能较有效地揭示小叶满江红内生细菌的多样性。
- 郑斯平陈彬王瑾陆培基
- 关键词：满江红内生细菌T-RFLP
- 固氮蓝细菌基因组多态性研究与分子标记技术平台的建立及应用
- 郑伟文陈坚宋铁英包晓东周莉娟吴忠兴许婉芳张秋芳徐华陈彬陈志彤
- 该项目首次将STRR-PCR、Hip-PCR、16SrDNA-RFLP、ITS-RFLP、16SrRNA-PCR-DGGE，以及RAPD技术应用于同满江红（水生厥类植物）和苏铁（裸子植物）共生蓝细菌的基因组多态性分析，揭...
- 关键词：
- 关键词：基因组多态性分子标记技术
- 特色农业微生物基因组研究系统的建立
- 2010年
- 以Web形式在LAMP(Linux+Apache+MySQL+PHP)环境下,建立以特色细菌菌株为主体的农业微生物基因组数据库和计算机工作平台,充分利用业已公布的生物基因组序列信息和技术平台,揭示特色农业微生物基因的结构功能,提供有自主知识产权意义的DNA序列等生物信息。
- 郑斯平陈彬宋亚娜关雄郑伟文
- 关键词：生物信息学微生物基因组数据库
- 闽江流域福州过境段大肠杆菌毒素基因的定性定量分析与季节性变化被引量：3
- 2008年
- 分别于不同季节在闽江流域福州过境段的洪山桥和解放大桥断面采集水样,进行大肠杆菌的分离、鉴定,用多元PCR方法对不同季节分离的大肠杆菌毒素基因的时空分布进行定性与定量分析。从分离的2 015株粪大肠杆菌中发现840株潜在的致病性大肠杆菌,分别属于肠出血性大肠杆菌(EHEC)、肠聚集性大肠杆菌(EAEC)、肠致病性大肠杆菌(EPEC)和肠产毒性大肠杆菌(ETEC);检出的10种毒素基因中,以扩散性黏附素基因(aidA-1)、热稳定性肠毒素基因(astA)和耐药性因子(sepA)为最多;细菌总量、大肠杆菌总数和致病性大肠杆菌总数在冬季较少,春季较多,夏秋季节达到全年数量的高峰;潜在的致病性大肠杆菌毒素基因的种类和数量也是在冬季最少,春夏季上升,秋季最多。
- 黄文文陈彬庄一廷陈宁郑伟文
- 关键词：闽江流域大肠杆菌毒素基因
- 稻田固氮细菌分离物的PCR-DGGE及其序列同源性分析被引量：2
- 2007年
- 采用PCR-DGGE法对从福建稻田取得的8个固氮细菌分离物进行分子鉴定,通过测序比对,发现它们与中慢生根瘤菌(Mesorhizobiumsp.)、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonassp.)、根瘤菌(Rhizobiumsp.)、慢生根瘤菌(Bradyrhizobiumsp.)、克雷伯氏杆菌(Klebsiellasp.)、伯克霍德尔氏菌(Burkholderia cepacia)、假单胞菌(Pseud-omonassp.)、诺卡氏菌(Nocardioides)和红球菌(Rhodococcussp.)9个属的固氮细菌具有高度同源性。
- 宋兵李友发林智敏陈彬郑伟文
- 关键词：水稻土固氮细菌
