魏永越
- 作品数:72 被引量:938H指数:9
- 供职机构:南京医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金江苏省自然科学基金江苏省“青蓝工程”基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学农业科学生物学更多>>
- 生物医学大数据统计分析方法与临床应用研究
- 2020年
- 以基因组学为代表的生物医学"大数据"时代已经来临.面对上百万指标的数据,常规分析方法已不能满足实际需求.新形势下生物医学研究迫切需要新的分析策略与方法.项目以"创新多组学数据填补与整合分析方法→创新疾病关键基因的筛选策略与方法→高维交互作用分析挖掘协同/拮抗因素→率先论证呼吸系统急重症的因果机制"为主线,深入地研究多种组学数据的分析方法及策略,解决了一系列统计理论方法技术难题,并成功运用于肺癌、急性呼吸窘迫综合征等研究领域.
- 张汝阳魏永越沈思鹏赵杨陈峰
- 关键词:生物医学大数据
- SEIR动力学模型辅助北京市新发地新型冠状病毒肺炎疫情传播起始时间溯源和防控效果评价被引量:12
- 2020年
- 目的推测2020年6月北京市新发地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情首例感染的传播时间起点,辅助传染病溯源,评价当前综合防控效果。方法根据北京市卫生健康委员会官方报告统计每日发病人数,建立SEIR传染病动力学模型,基于每日发病人数拟合动力学模型,并搜寻本次疫情的传播时间起点;考虑不同的防控效果而拟合6月12日至7月1日的累计发病人数,以评估当前综合防控措施效果。结果北京市新发地疫情传播首例感染应起始于5月22日至5月28日之间(累计概率为95%),起始于5月25日的概率最大(23%)。本次疫情R0为4.22(95%CI:2.88~7.02)。模型拟合结果提示,截至6月11日,累计发病为99例(95%CI:77~121),符合实际情况。若不加控制,则截至7月1日累计发病估计将达到65090例(95%CI:39068~105037)。截至7月1日,较之无防控措施的理论情况,实际感染人数减少了99%。自6月12日起,北京市采取了强有力的综合防控措施,疫情实际走势接近于传播率降低95%的推演结果,敏感性分析支持这一结果。结论针对突发性疫情,传染病动力学模型可用来辅助推演传染病传播起始时间,辅助疫情溯源。北京市针对本次突发疫情所及时采取的综合防控措施迅速控制了95%以上的传播途径,减少了99%的感染人数,快速遏制了疫情,对于未来疫情防控具有重要的指导意义。
- 魏永越官锦兴赵杨沈思鹏陈峰
- 基于马尔科夫链蒙特卡罗模拟方法的COVID-19年龄别病死率估计被引量:4
- 2020年
- 目的新型冠状病毒肺炎疫情已席卷全球,疫情结束前,其病死率的估计受现有确诊病例和发病到死亡时间分布的影响,且结论尚不明确,本研究旨在对新型冠状病毒肺炎的年龄别病死率进行估计。方法收集国家卫生健康委员会和CDC发布的新型冠状病毒肺炎疫情数据信息,采用Gamma分布拟合发病到死亡时间分布规律,采用马尔科夫链蒙特卡罗模拟估计年龄别病死率。结果新型冠状病毒肺炎的发病到死亡时间M=13.77(P25~P75:9.03~21.02)d,总病死率为4.1%(95%CI:3.7%~4.4%),0~、10~、20~、30~、40~、50~、60~、70~和≥80岁组病死率分别为0.1%、0.4%、0.4%、0.4%、0.8%、2.3%、6.4%、14.0%和25.8%。结论校正删失的马尔科夫链蒙特卡罗模拟方法适用于新发突发传染病疫情期间的病死率估计,尽早明确新型冠状病毒肺炎的病死率有助于疫情的防控。
- 杜志成郝元涛魏永越张志杰沈思鹏赵杨唐金陵陈峰姜庆五李立明
- 关键词:病死率
- 靶向临床试验全随机设计四种分析策略的比较
- 2018年
- 目的:探讨靶向临床试验全随机设计四种分析策略的统计学性能,为靶向药物研究分析方法的选择提供依据。方法:采用蒙特卡罗方法模拟数据,在不同参数组合下,比较序贯亚组特异性策略、序贯标志物阳性和总人群策略、标志物序贯设计及倒退设计的Ⅰ类错误和检验效能。结果:在阳性亚组分析中,当人群标志物阳性率较高时,四种分析策略的检验效能的差别较小,当人群标志物阳性率较低时,若靶向药物在不同标志物状态人群中疗效差异较大,序贯亚组特异性策略、序贯标志物阳性和总人群策略及标志物序贯设计的检验效能较高,若疗效差异较小,倒退设计和标志物序贯设计的检验效能较高;序贯亚组特异性策略及序贯标志物阳性和总人群策略能控制Ⅰ类错误。在总人群分析中,当阳性率较高时,序贯亚组特异性策略和标志物序贯设计的检验效能较可靠,当阳性率较低,疗效差异较大时,标志物序贯设计的检验效能最高,疗效差异较小时,标志物序贯设计和序贯亚组特异性策略的检验效能较好且差异不大。结论:在靶向治疗药物的全随机临床试验研究中,探寻靶向药物对阳性人群疗效时,宜采用序贯亚组特异性策略及序贯标志物阳性和总人群策略,仅当明确得知靶向药物在不同标志物状态的人群疗效的差异较小且人群标志物阳性率较低时,倒退设计是最优方法;而研究总人群疗效时,首要推荐标志物序贯设计。
- 徐昌榕柏建岭柏建岭陈峰魏永越陈峰黄丽红魏永越于浩
- 2型糖尿病微血管病变的代谢组学标志物和预测模型研究被引量:1
- 2022年
- 目的运用胆汁酸-脂肪酸代谢组学标志物建立2型糖尿病微血管病变预测模型。方法回顾性分析2019年6—10月某医院72例2型糖尿病住院患者,以是否发生糖尿病微血管病变分为病变组(20例)和无病变组(52例),利用患者临床资料,通过弹性网络回归筛选与微血管病变相关危险因素,构建风险得分,将风险得分和微血管病变结局建立logistic回归模型,通过ROC曲线下面积(AUC)评估模型效果。结果弹性网络回归筛选十八碳二烯酸(C18∶2)、γ-十八碳三烯酸(γ-C18∶3)和AA/DHA比值3种代谢组学标志物,及糖化血红蛋白(HbA1c)、总胆红素(tbil)、间接胆红素(ibil)、谷丙转氨酶(ALT)、高密度脂蛋白(HDL)等5种生化指标,分别构建生化指标风险、代谢标志物风险、代谢标志物-生化指标综合模型,AUC分别为0.879(95%CI:0.791~0.967)、0.834(95%CI:0.724~0.943)、0.894(95%CI:0.812~0.971)。结论建立的代谢组学标志物-生化指标糖尿病微血管病变预测模型,预测效果较好,可为糖尿病患者预后评估提供参考。
- 张益红林云志魏永越叶小龙
- 关键词:2型糖尿病微血管病变
- 生物统计学本科生SAS软件高级编程教学的探索与实践被引量:4
- 2017年
- 生物统计学专业旨在培养高素质的复合型统计应用人才。SAS软件高级编程是优秀生物统计学人才的必备技能。因此,SAS软件高级编程教学对专业人才培养至关重要。目前,国内开设生物统计学专业的医学院校屈指可数,且SAS软件高级编程教学经验相对缺乏。本文以我校生物统计学本科生的课程教学实践为例,对课程设置、教学内容、授课方式、考核形式、参考教材、软硬件设施和教学效果进行了总结和思考,以期进一步提高教学质量、保障生物统计学本科生的职业竞争力。
- 张汝阳魏永越赵杨于浩陈峰
- 关键词:生物统计学本科生
- 肿瘤临床试验中不同删失率情况下的统计学性质
- 肿瘤临床试验一般以总生存时间或无进展生存时间等生存资料作为主要疗效指标,其观测存在删失,是其重要的特征之一.有研究表明,过高的删失率将导致疗效评价的检验效能降低.但组间删失率水平不同的情况对疗效评价产生何种影响尚无定论....
- 陈梦锴魏永越柏建岭赵杨于浩
- 关键词:恶性肿瘤
- “病证相符/不相符”与双黄连注射液ADR/ADE的文献研究被引量:3
- 2010年
- "病证相符"是正确使用中成药的关键,也是中药发挥疗效、避免中药不良反应/事件的基石,本文通过建立中药注射剂模型ADR/ADE文献数据库,调查中药ADR/ADE与病证相符/不相符资料,结果显示,中药注射液的临床使用失宜现象突出,也是其ADR/ADE的重要危险因素,提示严格掌握中成药说明书,把握"病证相符"原则,珍爱生命,防止不必要的"药害事件"。
- 陈炯华王永炎谢雁鸣申春悌俞冲魏永越
- 关键词:中药注射剂中成药
- 期中分析的条件把握度及样本含量再估计被引量:3
- 2010年
- 目的介绍临床试验期中分析时条件把握度的计算原理及样本含量再估计方法。方法根据信息时间,构造B统计量,运用布朗运动理论,估计条件把握度,并据此采用二分搜索法估计后一阶段所需样本含量。以正态分布资料为例,介绍计算过程。结果如果试验期初对参数的估计不准确,可以根据试验中期数据,计算条件把握度。如果条件把握度较低,则通过调整样本含量可以达到期望把握度;如果条件把握度较高,则可以提前结束临床试验。结论该方法可以在试验过程中有效监测检验效能,在不违背临床试验方案的前提下,通过调整样本含量,保证临床试验达到预期的检验效能。
- 陈建平魏永越陈峰于浩
- 关键词:B值
- 高维DNA甲基化数据的随机森林降维分析被引量:4
- 2016年
- 目的将随机森林算法用于类风湿性关节炎病例对照研究的高维甲基化数据的分析,并探讨应用效果。方法实例数据来自基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO),检索号为GSE42861,包含354名病例、335名对照,本文选取类风湿性关节炎相关基因区域所在的第9号染色体,共纳入2 433个胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤双核苷酸(cytosine-phosphate-guanine pairs of nucleotides,CpGs)位点。利用随机森林计算变量的重要性评分并排序;对排序后的变量进行逐步随机森林过程,寻找最有可能与结果存在关联的变量子集;对降维后的变量子集进行逐步Logistic回归。结果逐步随机森林筛选出80个重要的CpG位点,Logistic回归模型中有13个位点具有统计学意义。纳入这些位点建立Logistic回归模型,该模型的预测正确率达88.29%。结论随机森林算法可以大大减少噪音变量,提高检验效能,适用于高维甲基化数据分析。
- 张秋伊赵杨魏永越张汝阳陈峰
- 关键词:DNA甲基化流行病学方法