慈海鑫
- 作品数：15 被引量：194H指数：8
- 供职机构：中国科学院西北高原生物研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程领域前沿项目青海省重大科技攻关项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程更多>>
- 缠绕植物手性的系统发育分析(英文)被引量：1
- 2010年
- 利用matK、rbcL与trnL基因,分析了中国薯蓣属植物缠绕手性的系统发生关系;利用matK基因,从大分类单元角度进一步分析了缠绕植物的系统特征。结果显示左、右旋缠绕植物物种存在显著的系统发育特征:matK数据中的右旋薯蓣聚成独立的进化枝与rbcL基因的分析共同支持右旋物种的单系性;rbcL和trnL的数据均较好地显示了右旋薯蓣的单系特征[除多毛叶薯蓣(D.decipiens)和甘薯(D.esculenta)外];在大分类单元上,缠绕植物手性性状则呈现出明显的多系特征。结果表明在中国区薯蓣属的分类中,手性特征是较可靠的性状特征,《中国植物志》薯蓣属章节直接将右旋物种归入周生翅组(sect.Enantiophyllum)较合理。但在世界范围上看,在小分类单元的薯蓣属内和薯蓣科及其他大分类单元内,手性特征都具有单独多次起源的性质,因此在执行分类时应当慎用这个性状。对于手性特征的起源问题,最新的观点倾向于否定南北半球物理差异相关的假说,但其结论的正确性有待商榷。结合地质事件研究薯蓣属等具有两种手性方向的小分类单元,以及构建突变体的方法,有助于最终解决植物手性的起源问题。
- 林恭华慈海鑫刘永安苏建平
- 关键词：手性
- 高原鼠兔(Ochotona curzoniae)基于线粒体DNA(mtDNA)序列的种群遗传结构
- 高原鼠免(Ochotona curzoniae),隶属于兔形目(Lagomorpha)鼠兔科(Ochotonidae)鼠兔属(Ochotona),是青藏高原上数量最多,分布最广的土著动物,也是青藏高原的关键种,对维持青藏...
- 慈海鑫蔡振媛林恭华唐利洲苏建平
- 文献传递
- 基于ISSR标记和线粒体Cytb基因分析高原鼠兔的遗传多样性及其遗传分化被引量：9
- 2009年
- 高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是青藏高原的特有动物和关键种。本实验应用ISSR分子标记和细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)基因序列分析了雅鲁藏布江两岸高原鼠兔4个种群的遗传多样性和遗传分化。结果显示,两种标记所得到的4个种群的遗传多样性都较高,并以Cytb基因为指标的遗传多样性水平在种群间体现出较大差异。在ISSR标记中,分子方差分析(AMOVA)表明种群间的遗传变异为13.50%,种群分化较低且UPGMA聚类时江北岸与南岸的种群有交叉;而在Cytb基因中遗传变异主要发生在种群间,占79.24%,种群间存在着显著的遗传分化,且江北岸和南岸的两个种群分别聚为一类。研究结果表明,mtDNA基因在反映种群遗传多样性和遗传分化上较ISSR分子标记相对具有优势。
- 葛艳丽林恭华慈海鑫张同作唐利洲苏建平
- 关键词：高原鼠兔ISSR细胞色素B基因遗传分化
- 高原鼠兔的谱系地理学研究
- 张同作林恭华苏建平雷晓水慈海鑫刘翠霞谢久祥杨传华陈家瑞蔡启山
- 利用谱系地理学的原理和方法，以线粒体序列为分子标记，系统分析了高原鼠兔谱系地理发生规律及其与青藏高原环境历史事件的耦合关系。研究发现，高原鼠兔单倍型多样性较高，而核苷酸多样性较低；高原鼠兔在历史上经历了快速扩张，种群扩张...
- 关键词：
- 关键词：高原鼠兔谱系地理学
- 一种提取动物基因组总DNA的野外样品保存方法被引量：24
- 2006年
- 为了确定一种方便的野外动物样品保存方法,以新鲜材料作对照,从-20℃冰箱、70%乙醇、含50mmol/L EDTA的70%乙醇、95%乙醇、液氮处理的高原鼠肌肉和肝脏组织中提取基因组总DNA。通过琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计对提取的基因组总DNA质量进行检测。结果显示:相同处理的肝脏DNA产量大,肌肉组织提取的DNA质量好;各种保存方法提取的DNA降解程度依次为,-20℃冰箱、70%乙醇>含50mmol/L EDTA的70%乙醇、95%乙醇>液氮>新鲜。选择新鲜肌肉和95%酒精处理的肌肉样品提取的总DNA作模板,进行微卫星PCR扩增,均可获得清晰的电泳带。将该方法用于高原鼢鼠,进行线粒体12S rRNA、Cytb和D-loop区测序,结果显示该方法保存的样品与新鲜样品没有差别。因此,在野外用95%乙醇固定肌肉样品是一种可行的样品保存方法。
- 蔡振媛张同作连新明慈海鑫苏建平
- 关键词：高原鼠兔高原鼢鼠总DNA提取
- 高原鼢鼠线粒体谱系地理学和遗传多样性被引量：25
- 2007年
- 高原鼢鼠是一类地下独居啮齿动物,为青藏高原特有种之一。为研究该物种的谱系地理学和遗传多样性,本文测定了采自青藏高原东部3个地理种群8个小种群共37个个体的线粒体D-loop区序列变异。在长度为627bp的序列中,共发现50个变异位点,定义了26种单倍型。该物种的单倍型多样性(Haplotype diversity,H)较高和核苷酸多样性(Nucleotide diversity,πn)较低。谱系分析得到3个稳定的分支,分别与采集的地理种群相吻合:同一地理种群内单倍型之间遗传差异小,而不同地理来源的单倍型之间存在较大区别。距离隔离分析表明高原鼢鼠的遗传分化与地理距离呈正相关。AMOVA分析同样表明地理种群之间存在显著差异:地理种群间变异占遗传变异的80.45%。高原鼢鼠的这种遗传结构特点可能主要是由于第四纪气候变迁、该物种稳定的地下生活环境和有限的迁移能力造成的。
- 蔡振媛张同作慈海鑫唐利洲连新明刘建全苏建平
- 关键词：高原鼢鼠线粒体控制区
- 高原鼠兔ISSR引物反应体系的优化与筛选被引量：2
- 2008年
- [目的]筛选和优化高原鼠兔(Ochotona curzoniae)适宜的ISSR反应体系,以在对高原鼠兔进行ISSR分析时获得清晰和多态性好的扩增结果。[方法]以高原鼠兔基因组DNA为模板,通过单因素试验,对体系中的模板浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度、Taq酶用量、引物用量、退火温度进行探讨。[结果]结果表明,高原鼠兔ISSR-PCR扩增的最佳条件为:25μl PCR反应体系,其中4lμDNA模板,1.5 mmol/LMgCl2,0.2 mmol/L dNTPs,1.25 UTaq聚合酶,1.5μmol/L引物,复性温度4560℃(退火温度随引物不同而确定)。用11条引物进行了PCR扩增,筛选出效果较好的6条引物。[结论]该反应体系的建立为鼠兔遗传多样性和分子系统学研究提供技术支持。
- 葛艳丽慈海鑫唐利洲林恭华苏建平
- 关键词：高原鼠兔ISSR
- 沂河4条支流浮游植物多样性季节动态与水质评价被引量：66
- 2009年
- 2006年11月—2007年8月对沂河4条支流水体浮游植物展开调查.结果表明：东汶河、蒙河、涑河和柳青河内检测到的浮游植物分别为75,67,70和80种,浮游植物种类组成和细胞密度季节变化明显.东汶河、蒙河、涑河和柳青河水体浮游植物Shannon-Wiener指数分别为2.97-3.96,3.05-3.35,2.86-4.02和1.74-2.89;Margalef指数分别为2.92-4.42,2.44-4.03,3.07-5.38和1.23-2.76;Pielou指数分别为0.78-0.92,0.71-0.94,0.73-0.89和0.48-0.90.4条支流的细胞密度分别为1.54×10^7-5.69×10^7,0.28×10^7-12.64×10^7,0.97×10^7-3.19×10^7和4.17×10^7-9.96×10^7L^-1.综合水质评价结果：东汶河和蒙河为β-中污型—寡污型,涑河为β-中污型—清洁型,柳青河为α-中污型—β-中污型.水质从优至劣排序为涑河〉东汶河〉蒙河〉柳青河.东汶河和涑河为温度制约型,蒙河和柳青河为温度和营养盐制约型.
- 高远慈海鑫亓树财苏宇祥
- 关键词：浮游植物SHANNON-WIENER指数水质评价
- 繁殖期夜鹭对城市化的适应性研究被引量：11
- 2005年
- 2004年3月～6月以曲阜的孔庙、孔林两地作为夜鹭不同城市化程度的栖息地,从繁殖、人为干扰两个方面对繁殖期夜鹭的城市化适应性行为机制进行了初步研究.结果显示,两地的城市化程度存在显著差异,其中孔庙较高.营巢高度随城市化程度的提高呈增大趋势.营巢密度最初随城市化程度的提高先降低,但随其进一步提高有所增加,在最高时又降低.惊飞距离随城市化程度的增加而减小.
- 杨月伟慈海鑫
- 关键词：夜鹭城市化栖息地惊飞距离
- 青藏高原高原鼠兔体表寄生虫感染与寄主性别的关系
- 高原鼠兔(Ochotona curzoniae),又称黑唇鼠兔(black lipped pika),隶属于兔形目(Lagomorpha)鼠兔科(Ochotonidae)鼠兔属(Ochotona),是青藏高原的特有种和关...
- 慈海鑫林恭华苏建平曹伊凡
- 关键词：高原鼠兔体表寄生虫感染率
