刘新国 作品数:51 被引量:52 H指数:4 供职机构: 山东师范大学物理与电子科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山东省自然科学基金 教育部科学技术研究重点项目 更多>> 相关领域: 理学 生物学 文化科学 医药卫生 更多>>
碰撞能对O++DH(v=0,j=0)→OD++H的准经典轨续 2010年 运用准经典轨线的方法,基于RODRIGO势能面,研究反应体系O++DH(v=0,j=0)→OD++H的立体动力学性质.对描述K-j′两矢量相关和k-k′-j′三矢量相关的分布函数P(θr)和P(φr)以及产物转动取向参数进行了详细的讨论,发现极化微分反应截面呈现有趣的现象,计算了反应几率与反应截面.O++DH(v=0,j=0)→OD++H反应的立体动力学性质对体系的碰撞能非常敏感. 孙海竹 刘新国 吕娟娟 刘会荣关键词:立体动力学 准经典轨线方法 H+HLi体系同位素取代反应准经典轨线理论研究 被引量:1 2016年 Li H分子在宇宙形成的过程中起着十分重要的作用,它是少数参与整个气相化学反应的分子之一.H+HLi体系只有5个电子,是除了H3体系外最简单的中性的三原子体系,但是具有许多复杂的性质.作者基于最新Li H2体系的高精度基态势能面,通过研究H+HLi反应的同位素替代来深入地了解它的反应特性.作者利用了准经典轨线方法计算了P(θr)、P(r)不同碰撞能下两种同位素替代反应D+HLi、H+DLi的反应特征.作者对计算结果进行分析讨论,发现碰撞能对上述两种替代反应都是有影响的,并且H+DLi替代反应受到的影响更为明显.当碰撞能从10 kcal/mol逐步增加到40 kcal/mol时,产物的定向增强了、取向减弱了,且前向散射与侧向散射的强度都呈现无规律变化. 李琦 王艳洁 刘新国 宋俊美 王田田关键词:同位素效应 准经典轨线 D+CH_4→CH_3+HD反应的量子含时动力学研究 被引量:3 2003年 运用SVRT(semirigidvibratingrotortarget)模型[1 ] ,对反应D +CH4 →CH3+HD进行了量子含时动力学研究 .计算结果表明 ,反应几率随平动能的变化曲线 ,呈现出显著的量子共振特性 .H -CH3的振动激发 ,极大地提高了反应几率 ,转动量子数j的增大 ,也会使反应几率有较大的提高 .结果表明 ,SVRT模型对于精确计算某些多原子分子间的反应碰撞 。 白丽华 刘新国 张庆刚关键词:SVRT模型 量子计算 分子动力学模拟和自由能计算研究孕酮和孕酮受体蛋白的结合模式(英文) 被引量:7 2010年 孕酮在确立和维持妊娠中起到了关键的作用.为了研究孕酮和孕酮受体蛋白的结合模式,进行了3.5纳秒的分子动力学模拟,用MM-PBSA\GBSA方法计算了结合自由能.自由能分解和丙氨酸扫描两种方法说明,残基Leu718,Met756,Met759,Phe778和Tyr890对于结合抑制剂作用明显,这些残基的主要作用能是范德瓦尔斯作用能.这一研究结果可以指导孕酮受体蛋白抑制剂的优化. 扈国栋 张少龙 刘新国 张庆刚关键词:孕酮受体 分子动力学 半刚性振转靶模型在Cl+CH_4反应中的应用 被引量:1 2008年 基于新的势能面,运用半刚性振动转子靶(SVRT)模型和含时波包法对Cl+CH4→HCl+CH3反应体系进行了计算,给出了反应过程中体系的振动对该反应的反应几率和反应阈能的影响,并计算了基态的总散射截面和热速率常数. 孙善书 刘新国 张庆刚关键词:SVRT模型 基于酪氨酸磷酸酶Ⅱ型糖尿病药物设计 酪氨酸磷酸酶PTP1B己被公认为治疗Ⅱ型糖尿病药物的最为理想的靶标。目前为止,已发现的PTP1B抑制剂多数是由化学方法合成的,该类抑制剂在治疗糖尿病的同时,存在着不同程度的毒副作用。 闫芳芳 苏静 刘新国关键词:MM-PBSA MM-GBSA 抑制剂对溴结构域蛋白4的两个溴结构域选择机制的多副本分子动力学模拟和自由能分析 2023年 溴结构域蛋白4在细胞周期调节中至关重要,已成为治疗各种癌症的潜在靶标、溴结构域蛋白4包含两个溴结构域,即BD1和BD2.研究表明,选择性地抑制BD1或BD2可能提供更有效的治疗方案.因此,了解抑制剂对BD1和BD2结合的选择性机制对于开发BD1和BD2的高选择性抑制剂至关重要.本文利用多副本分子动力学模拟研究了抑制剂SG3-179、GSK778和GSK620对BD1和BD2的结合选择性.结果显示,BD1比BD2具有更强的结构灵活性,而且BD1和BD2表现出不同的内部动力学.对自由能景观的分析表明,BD1和BD2的构象分布存在明显的差异.结合自由能预测表明,熵变、静电相互作用和范德华相互作用是SG3-179、GSK778和GSK620对BD1和BD2选择性结合的关键因素.单个残基能量贡献的计算表明,(BD1,BD2)中的残基(W81,W374)、(P82,P375)、(Q85,K378)、(V87,V380)、(L92,L385)、(N93,G386)、(L94,L387)、(C136,C429)、(N140,N433)、(K141,P434)、(D144,H437)和(I146,V439)在SG3-179、GSK778和GSK620与BD1和BD2的结合中产生明显的能量差异,它们可以作为开发针对BD1或BD2的高选择性抑制剂的有效靶点.相关信息可为提高抑制剂对BD1和BD2的选择性提供重要的理论指导. 李梦 刘新国 张少龙 孙嘉豪 张庆刚 陈建中He+H_2^+及其同位素取代反应的立体动力学研究 被引量:2 2009年 运用准经典轨线方法,基于AQUILANTI势能面,在碰撞能为145kJ/mol时,对He+H2+及其同位素取代反应的立体动力学性质进行了理论研究.对k-j′两矢量相关和k-k′-j′三矢量相关的分布函数,以及产物转动取向参数进行了详细的讨论.结果表明,He+HH+→HeH++H,He+HD+→HeH++D和He+HT+→HeH++T反应的立体动力学性质对反应体系的质量因子和双原子分子的排斥能非常敏感. 孔浩 刘新国 许文武 梁景娟 张庆刚关键词:矢量相关 立体动力学 准经典轨线方法 强激光场中分子的红外多光子解离几率的计算-RS-BOXSW方法的应用 应用RS-BOXSW方法,计算了加入转动项后,双原子分子在共振频率处理解离几率随作用时间的变化规律,并与只考虑振动项时解离几率随作用时间的变化规律作了比较。 刘新国 张庆刚 丁世良关键词:强激光场 文献传递 多原子分子在金属表面解离吸附的量子动力学研究 2002年 利用SVRT模型计算CD4在Ni(1 0 0 )表面的解离几率随动能的变化关系 ,给出对应初始状态 (v=1 ,2 ,3 ,j=1 )和(v=2 ,j=1 ,3 ,5 )时的计算结果 ,画出了解离关系曲线 . 刘新国 白丽华 张庆刚关键词:含时波包