何秀
- 作品数：3 被引量：31H指数：2
- 供职机构：重庆师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金重庆市教育委员会科学技术研究项目国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：生物学文化科学更多>>
- R语言在生物科学研究绘图中的应用被引量：15
- 2019年
- R语言具有强大的数据分析处理和可视化绘图功能,可以在Window、Linux以及Mac系统上使用,并且根据其编写新代码或调整已有代码可轻松实现科研中数据呈现与图形绘制的要求.然而其代码学习较为艰难、R-package使用复杂,所以未受到科研新手的青睐.基于生物科学相关领域的背景,整理汇集已出版的文献、公共数据库以及国家统计局中提供的数据,使用R语言、R编辑器RStudio并载入相关的R-package绘制出地图、热图、关联网络图、韦恩图和柱形图等高质量的图片,并提供相应的脚本与说明,以方便生物科研人员直接更改使用.本研究对生物科研中合理、直观地表述研究结果提供了良好的范例,并进行了详细讨论,且与其他绘图软件作了比较,以期R语言能够成为生物科学领域科研工作者入门学习、研究应用中绘制图片的首选工具.
- 蓝洋何秀朱诚勖张玉娟
- 关键词：地图韦恩图R语言
- 成才视角下生物专业英语在师范院校中的教改研究被引量：1
- 2014年
- 教师要针对目前普通师范院校生物专业英语的课程特点与教学现状，结合学生的学习情况，从教材选择、课程设置、师资建设、教学方法等方面，对师范院校生物专业英语进行实践与探索，并提出具体的改革方案，以促进大学生早日成才。
- 邹祖力何秀张玉娟
- 关键词：生物专业英语教学实践成才
- 中华按蚊全基因组微卫星的鉴定、特征及分布规律被引量：15
- 2016年
- 【目的】中华按蚊Anopheles sinensis是我国及东南亚重要的传疟媒介。本研究在全基因组上鉴定和分析中华按蚊微卫星并注释微卫星相关基因的功能,为遗传分子标记的筛选提供依据,也为昆虫微卫星比较基因组学进一步研究提供基础。【方法】用MISA程序鉴定中华按蚊基因组微卫星;用Excel 2010统计微卫星长度,结合微卫星序列信息编写Perl脚本计算微卫星碱基含量;结合微卫星位置信息编写Perl脚本定位微卫星出现的基因区域,并对基因区的微卫星进行GO功能注释;运用WEGO比较中华按蚊和冈比亚按蚊An.gambiae含微卫星相关基因功能注释。【结果】共鉴定出105 981个微卫星,出现的密度是365.5个/Mb。其中100 391个（94.7%）微卫星是完整型微卫星,其余5 590个（5.3%）是复合型微卫星。单碱基微卫星最为丰富,共58 837个,占总微卫星数量的55.5%,其余依次是二碱基（30 345个,占28.6%）、三碱基（15 104个,占14.3%）、四碱基（1 530个,占1.4%）、五碱基（121个,占0.1%）和六碱基（44个,少于0.1%）微卫星。（A）n为最主要的微卫星,其次是（AC）n,（AG）n,（C）n,（AGC）n,（ATC）n,（ACG）n和（ACC）n,数量都在2 000个以上。中华按蚊基因组微卫星长度以10~20 bp为主（87.1%）。这些微卫星的AT含量（63%）明显高于GC含量（37%）,仅三碱基微卫星的GC含量（53%）略高于AT含量（47%）。90 632个微卫星（85%）分布在基因间区,15 349个（15%）微卫星分布在基因区。在基因区,2 782个（3%）微卫星分布在外显子区,12 567个（12%）分布在内含子区。GO注释比较中华按蚊和冈比亚按蚊含微卫星的基因,发现这两个物种各小类基因所占总基因数的百分比基本一致,但电子传递类（electron carrier）基因在中华按蚊所占百分比（0.9%）明显高于冈比亚按蚊（0.1%）。【结论】这是蚊虫中首个在全基因组上系统的微卫星研究工作,为
- 王小婷张玉娟何秀梅婷陈斌
- 关键词：中华按蚊基因组微卫星
