张玉娟
- 作品数:38 被引量:99H指数:6
- 供职机构:重庆师范大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金重庆市教育委员会科学技术研究项目重庆市科技攻关计划更多>>
- 相关领域:生物学文化科学医药卫生农业科学更多>>
- 一种化学计量蛋白质组基础分析的计算方法
- 本发明公开了一种对蛋白质组进行化学计量基础分析的计算方法。本发明所提供的对蛋白质组进行化学计量基础分析的计算方法综合运用了Perl脚本语言编程,R脚本语言编程和可视化,基于物种蛋白质或蛋白质组序列,对物种的蛋白质组进行元...
- 张玉娟罗泽宇
- 成才视角下生物专业英语在师范院校中的教改研究被引量:1
- 2014年
- 教师要针对目前普通师范院校生物专业英语的课程特点与教学现状,结合学生的学习情况,从教材选择、课程设置、师资建设、教学方法等方面,对师范院校生物专业英语进行实践与探索,并提出具体的改革方案,以促进大学生早日成才。
- 邹祖力何秀张玉娟
- 关键词:生物专业英语教学实践成才
- 中华按蚊CYP6P5基因的鉴定及特征分析
- 目的:鉴定中华按蚊(Anopheles sinensis)CYP6P5基因并分析其序列特征,为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据.方法:以催命按蚊(An.funestus)基因CYP6P5为询问基因,...
- 车燕飞张玉娟陈斌
- 关键词:中华按蚊细胞色素生物信息学
- 文献传递
- 葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析被引量:5
- 2014年
- 过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录组unigene序列信息,设计特异性引物并首次通过PCR技术克隆了葱蝇过氧化氢酶基因全长cDNA,命名为DaCAT,其全长为2 073bp,开放阅读框1 518bp,编码505个氨基酸,推测其相对分子质量为5.68×104,等电点为7.72.该研究对其进行了生物信息学分析并建立了系统发育树,分析表明该基因编码的氨基酸序列具有2个保守结构域及多个酶活性位点,与其他物种CAT具有较高的同源性,其中和拟果蝇Drosophila simulans亲缘关系最近,相似率为89.3%,采用SWISS-MODEL对其进行了蛋白质同源建模及3D结构预测分析,为进一步研究DaCAT基因在葱蝇滞育期间的代谢表达、酶活力测定以及具体功能奠定了基础.
- 胡甘雨司风玲车燕飞张玉娟陈斌
- 关键词:葱蝇过氧化氢酶克隆生物信息学分析
- 一种高通量分析多物种化学计量转录组的方法
- 本发明公开了一种高通量分析多物种化学计量转录组的方法。本发明所提供的高通量分析多物种化学计量转录组的方法综合运用了Perl脚本语言编程,R脚本语言编程和R语言可视化,基于多个物种转录组数据,高通量计算多个转录组的碱基(A...
- 张玉娟罗泽宇王瑞
- 葱蝇冬滞育和夏滞育专化基因的比较研究
- 陈斌郝友进何正波张玉娟司风玲
- 滞育是昆虫在特定时期发育停滞的一种生命现象。夏滞育专化基因尚未被系统地研究,更无冬滞育和夏滞育专化基因的系统比较分析。葱蝇是世界性的重要地下害虫;这两种滞育都发生在蛹期头外翻后的同一发育点;在系统发育上与黑腹果蝇近缘,因...
- 关键词:
- 关键词:滞育昆虫发育蛋白质组学
- 一种批量分析多物种化学计量基因组的方法
- 本发明公开了一种批量分析多物种化学计量基因组的方法。本发明所提供的批量分析多物种化学计量基因组的方法综合运用了Perl脚本语言编程,R脚本语言编程和R语言可视化,基于多个物种基因组数据,批量计算多个基因组的碱基(A、T、...
- 张玉娟朱梦黎
- 中华按蚊全基因组微卫星的鉴定、特征及分布规律被引量:15
- 2016年
- 【目的】中华按蚊Anopheles sinensis是我国及东南亚重要的传疟媒介。本研究在全基因组上鉴定和分析中华按蚊微卫星并注释微卫星相关基因的功能,为遗传分子标记的筛选提供依据,也为昆虫微卫星比较基因组学进一步研究提供基础。【方法】用MISA程序鉴定中华按蚊基因组微卫星;用Excel 2010统计微卫星长度,结合微卫星序列信息编写Perl脚本计算微卫星碱基含量;结合微卫星位置信息编写Perl脚本定位微卫星出现的基因区域,并对基因区的微卫星进行GO功能注释;运用WEGO比较中华按蚊和冈比亚按蚊An.gambiae含微卫星相关基因功能注释。【结果】共鉴定出105 981个微卫星,出现的密度是365.5个/Mb。其中100 391个(94.7%)微卫星是完整型微卫星,其余5 590个(5.3%)是复合型微卫星。单碱基微卫星最为丰富,共58 837个,占总微卫星数量的55.5%,其余依次是二碱基(30 345个,占28.6%)、三碱基(15 104个,占14.3%)、四碱基(1 530个,占1.4%)、五碱基(121个,占0.1%)和六碱基(44个,少于0.1%)微卫星。(A)n为最主要的微卫星,其次是(AC)n,(AG)n,(C)n,(AGC)n,(ATC)n,(ACG)n和(ACC)n,数量都在2 000个以上。中华按蚊基因组微卫星长度以10~20 bp为主(87.1%)。这些微卫星的AT含量(63%)明显高于GC含量(37%),仅三碱基微卫星的GC含量(53%)略高于AT含量(47%)。90 632个微卫星(85%)分布在基因间区,15 349个(15%)微卫星分布在基因区。在基因区,2 782个(3%)微卫星分布在外显子区,12 567个(12%)分布在内含子区。GO注释比较中华按蚊和冈比亚按蚊含微卫星的基因,发现这两个物种各小类基因所占总基因数的百分比基本一致,但电子传递类(electron carrier)基因在中华按蚊所占百分比(0.9%)明显高于冈比亚按蚊(0.1%)。【结论】这是蚊虫中首个在全基因组上系统的微卫星研究工作,为
- 王小婷张玉娟何秀梅婷陈斌
- 关键词:中华按蚊基因组微卫星
- 植物叶绿体和线粒体蛋白质转运被引量:1
- 2011年
- 组成叶绿体和线粒体的绝大多数蛋白质都是由核基因编码,经转录翻译后需通过专门的转运到达这两种细胞器以行使功能。有关植物细胞叶绿体和线粒体蛋白质转运的研究近年来已取得一些重要进展,包括新受体蛋白的发现,更为普遍的双定位的发现,甚至全新的转运途径的发现等。此外,该领域的研究方法也有了新发展。本文将这些新的进展进行综述,并就该研究领域的发展做了展望。
- 张玉娟张燕琼文建凡
- 关键词:信号肽受体蛋白
- BSA技术与昆虫杀虫剂抗性基因定位
- 2022年
- 使用杀虫剂进行病虫害防控是有效防治虫媒疾病的重要方式之一,但大规模使用杀虫剂导致昆虫出现了不同程度的抗性。随着高通量测序技术的发展和分子标记的应用、大量物种全基因组测序的完成,利用双亲分离后代群体中具有极端表型的个体构建混池进行测序,通过比较不同混池之间的多态性并结合表型信息,从而定位目的基因的混合群体分离分析(bulked segregant analysis,BSA)技术,因其简单、高效的特点得到了快速广泛的应用。采用BSA技术揭示杀虫剂抗性产生的分子机制,对抗药性产生风险的有效评估以及新型杀虫剂的改良开发具有重要意义。本文就近年来BSA技术的发展和昆虫杀虫剂抗性分子机理的相关研究进行综述,并对该技术在昆虫杀虫剂抗性研究中的意义和应用前景进行了总结与展望。
- 孟晨仇鑫陈斌张玉娟
- 关键词:基因定位