任丽娟 作品数:43 被引量:119 H指数:7 供职机构: 贵州省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 贵州省科技计划项目 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
贵州省首例人感染高致病性禽流感H7N9突变株血凝素分子特征与溯源分析 被引量:1 2018年 目的了解贵州省人感染H7N9禽流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因的分子特征、溯源和疾病风险,为高致病性禽流感H7N9病毒的预防和控制提供依据。方法采用实时PCR对5株高致病性禽流感H7N9毒株标本(1株人感染鼻咽拭子标本,4株活禽市场环境标本)进行核酸的提取、HA基因的扩增和测序,运用生物信息学软件对H7N9禽流感病毒HA基因的同源性、遗传进化、受体结合关键位点、致病相关位点和糖基化位点变异情况进行分析。结果贵州省威宁县人感染H7N9禽流感病毒HA基因与当地活禽市场环境中H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%和99.6%,而4株活禽市场环境中的H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为100.0%和100.0%。与2017年广西人感染的A/Guangxi/5/2017毒株同源性最高,分别为99.7%~99.9%和99.4%~99.8%;与2016年底广东环境中分离的毒株A/Environment/Guangdong/ C16283222/2016同源性为99.0%~99.2%和98.9%~99.2%,而与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013候选疫苗株的同源性为96.8%~97.0%和95.8%~96.2%。与广西毒株A/Guangxi/5/2017遗传进化距离最近。5株毒株HA蛋白裂解位点突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,为高致病性禽流感突变株;受体结合关键位点均发生了G186V的突变,均未发生Q226L突变,5株毒株均发生的新突变为A363S,仅感染人的毒株发生的突变是R56K和I297V;5个潜在糖基化位点中仅421NWT和493NNT发生位置后移的变异。结论贵州省威宁县5株H7N9禽流感病毒均为高致病性禽流感突变株,候选疫苗株匹配保护效果可能已经降低,HA蛋白裂解位点、G186V和新的突变位点的变异可能增强了H7N9禽流感病毒对人体的易感性和致病性。 万永虎 杨桃梅 郑勤妮 庄丽 任丽娟 付琳 米飞 唐光鹏 李世军关键词:血凝素基因 分子特征 贵州省2019年甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因特性分析 2023年 目的了解贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因的分子特征,探讨其特异性分子位点,为流感防控提供科学依据。方法采集2019年贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例的28份鼻咽拭子标本进行病毒株的分离,其中13株病毒的HA基因被扩增和测序,利用国家生物技术信息中心或全球禽流感数据共享倡议提供的参考序列和已有的轻症病例毒株序列对HA基因进行生物信息学分析。结果2019年贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为98.0%~100.0%和97.9%~100.0%,分别处于不同次分支;与2019年和既往疫苗株相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.2%~99.3%、97.1%~98.4%和98.1%~98.9%、97.5%~98.7%;与轻症病例相比,重症或死亡病例毒株共发生了12个位点的突变,其中V312I为共有的突变位点,抗原决定簇突变共涉及到3个区域,毒株QNZ2019YYX和BJ2019WXP发生了2个位点的突变。结论2019年度疫苗株匹配性更高,部分毒株突变涉及到抗原决定簇的2个区域,可能为新的变异株,V3121位点可能为重症或死亡病例毒株的特异性分子位点,需进一步研究和加强实时监测。 任丽娟 郑勤妮 庄丽 蒋维佳 万永虎关键词:甲型H1N1流感病毒 HA基因 分子特征 贵州省黔东南州职业暴露人群禽流感病毒感染状况调查 2013年 禽流感(avian influenza,AI)是由A型流感病毒引起的一种禽类感染综合征或疾病综合征。禽流感的发病情况取决于病毒的致病性及宿主的易感性,也受环境因素、饲养营养条件及并发疾病等因素的影响,可变现为无症状感染、轻度的上呼吸道症状、产蛋量下降到急性致死性死亡[1]。 任丽娟 庄丽 付琳关键词:禽流感病毒 职业暴露人群 INFLUENZA A型流感病毒 上呼吸道症状 登革2型病毒贵州分离株NS1部分基因原核表达蛋白及其多克隆抗体制备 被引量:1 2012年 目的原核表达、纯化DENV-2贵州分离株NS1部分序列表达蛋白,并制备其多克隆抗体以研究其功能。方法合成DENV-2M株NS1部分基因序列,克隆到原核表达载体pET28(a),转化大肠埃希菌BL21(DE3);用IPTG诱导表达,Ni柱亲和层析纯化、回收融合蛋白;用纯化融合蛋白免疫BALB/c鼠,制备多克隆抗体,采用ELISA法检测抗体效价。结果原核表达了NS1部分序列融合蛋白,并获得了其多克隆抗体,ELISA检测抗体效价为1∶800。Western blot检测该蛋白能被His标签抗体识别。结论 DENV-2M株NS1部分序列表达蛋白可诱导小鼠产生较高效价和特异性的多克隆抗体,为进一步研究DENV-2M株NS1部分序列表达蛋白的免疫原性奠定了基础。 朱海东 左丽 任丽娟关键词:登革2型病毒 多克隆抗体 Nb.BsrDI酶介导的多重交叉置换扩增结合荧光定量检测新冠病毒的方法 本发明提供了由Nb.BsrDI(限制性内切酶)介导的多重交叉置换扩增(multiple cross displacement amplification)新型冠状病毒(SARS‑CoV‑2)目的基因结合荧光检测的方法,该... 李世军 黄俊飞 任丽娟 蒋维佳文献传递 贵阳市2012-2015年B型流行性感冒病毒血凝素基因特性分析 被引量:6 2017年 目的了解2012-2015年贵阳市B型流行性感冒(以下简称流感)病毒的变异和流行特点,分析其与WHO推荐的疫苗株和我国的代表株匹配情况。方法将21份标本进行血凝素基因片段1(haemagglutinin 1,HA1)基因序列测定,通过DNA Star version 7.1等软件对测序产物进行分析。结果贵阳市B型流感病毒存在BY和BV两种谱系;核苷酸同源性显示,BV系与疫苗株B/Brisbane/60/2008的同源性为97.8%~99.3%;2013-2014年BY系与疫苗株B/Massachusetts/02/2012的同源性为96.2%~96.5%,与既往的疫苗株B/Wisconsin/01/2010同源性为99.0%~99.3%;2015年BY系与疫苗株B/PHUKET/3073/2013同源性为99.2%~99.5%;2012-2015年BV系与我国代表株B/Chongqing-Yuzhong/1384/2010同源性为96.8%~99.0%,BY系与种子疫苗株B/Hubei-Wujiagang/158/2009为98.2%~99.2%。与当年度疫苗株相比,2013-2014年BY系毒株有9个氨基酸位点发生变异,其中A134P位点涉及到抗原决定簇A区,N142K涉及到B区;2015年BY系毒株发生新的L198Q变异,且涉及到D区;BV系氨基酸位点替换多样,但很少涉及到抗原决定簇。结论 2012-2015年贵阳市人群中B型流感病毒在不断地发生改变,除2013-2014年疫苗株与流行株匹配性不佳以外,其余年度的匹配性均较好,能起到保护作用。 万永虎 张德著 郑勤妮 庄丽 任丽娟 付琳 唐光鹏 李世军关键词:流感病毒B型 血凝素类 基因 贵州省2011—2021年流感流行特征及变异规律 被引量:7 2022年 目的分析贵州省2011—2021年流感的流行病学特征,揭示流感病毒的流行特点及变异规律,为流感病毒的防控提供科学依据。方法采集2011—2021年全省13家流感监测哨点医院发热/内科、儿科门诊流感样病例(ILI),通过RT-PCR检测,以流感监测年度为周期进行数据统计分析。结果共采集ILI标本135537例,总阳性率为16.73%(22676例)。检出阳性率最高为H3N2亚型(34.3%),最低为BY系(13.69%),各亚型均引起过不同程度流行,且交替共存。呈冬春季和夏季2个流行高峰特征;女性阳性率略高于男性;人群主要集中在5~24岁年龄段,各亚型主要感染的对象有所不同;各监测年度间阳性率差异有统计学意义(P<0.05)。结论贵州省流感呈周期性流行,且各亚型交替或共存呈优势株流行。多发于冬春季和夏季,青少年是防控的重点,各地区阳性率差异有统计学意义。应加强监测并及时分析病毒变异情况。 郑勤妮 任丽娟 庄丽 万永虎 雷明玉 牟鸿江 李世军关键词:流感病毒 贵州省部分县区登革热媒介监测及人群感染状况调查 被引量:8 2015年 目的了解贵州省部分地区蚊媒的带毒情况以及人群感染情况,为防控工作提供科学依据。方法蚊媒监测,人群监测,病原学检测。结果诱蚊灯共捕蚊虫31 749只,库蚊占41.19%,阿蚊占29.70%,按蚊占28.95%,白纹伊蚊占0.15%;按蚊的高峰期在5月,库蚊高峰在7月下旬~8月下旬,白纹伊蚊高峰期在6月下旬~9月上旬,最高为7月上旬;对蚊媒进行登革热病毒核酸检测,结果阴性;对3县媒介监测村寨流行期前(4月)和流行后期(11月)人群进行监测,流行前期登革热Ig M和Ig G阴性,流行后期登革热Ig M抗体阳性7份,阳性率1.32%。结论开展登革热病原学监测,加强医务人员培训,早诊断、早治疗、早处理登革热病例至关重要。 唐光鹏 周敬祝 蒋维佳 任丽娟 余春 庄妍 田兴国 王定明关键词:登革热 蚊媒监测 2012~2014年贵阳市B型流感监测结果分析 被引量:2 2016年 目的:了解2012-2014年贵阳市B型流感流行趋势,为防控B型流感提供科学依据。方法:采集流感样病例(ILI)的咽拭子,使用实时荧光定量PCR方法对流感样病例(ILI)咽拭子样进行检测。收集2012-2014年流感监测资料进行分析。结果:监测了4936份流感样病例样本,其中阳性161份,各年龄段均易感,其中30岁以下病例126份,占总阳性的78.26%。结论:2012-2014年间贵阳市B型流感主要在早冬春季流行,在流感中检出率呈逐年下降趋势,30岁以下病例占总流感阳性78.26%,揭示了贵阳市B型流感流行趋势,为贵阳市B型流感防控提供科学依据。 付琳 任丽娟 蒋维佳 庄丽 郑勤妮 万永虎 胡静 李世军 唐光鹏关键词:流感样病例 流感监测 B型流感 贵州省2010年H3N2亚型流感病毒HA1基因序列分析 被引量:5 2012年 目的了解2010年贵州省H3N2亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法用MD-CK细胞分离流感病毒,采用血凝抑制试验分型鉴定,随机选取8株H3N2亚型流感毒株进行RNA提取,逆转录扩增获得HA1基因产物,将其进行基因产物测序,测定的序列用相关的生物信息软件进行分析。结果贵州省各代表株在同一分支。该分支与2008-2009年疫苗推荐株A/Brisbane/10/2007(H3N2)接近,与WHO 2010年疫苗推荐株A/Perth/16/2009(H3N2)相距较远。结论2010年根据WHO疫苗推荐株生产的疫苗对该年我市H3N2亚型流感预防效果不好,以至于H3亚型在我省成为优势株,引起广泛流行。 任丽娟 庄丽 付琳关键词:H3N2亚型流感病毒 血凝素 基因分析