陈农安
- 作品数：16 被引量：44H指数：3
- 供职机构：中国科学院上海生命科学研究院生物化学研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学更多>>
- mRNA翻译起始区构效关系的研究被引量：1
- 1995年
- 本文分析了9个表达量相差55倍的5′PCNA-LacZ′重组子的TIR二级结构与翻译起始效率的关系。在5′NTR顺序确定为28个核苷酸(从转录起始位点起)时,TIR范围在约编码第12个密码子(第33至37核苷酸)处存在一个二级结构及其△G的变化阈位,在该阈位处按表达量调正重组子TIR的范围,得到△G与表达量之间相关系数为0.97的曲线;在TIR二级结构中,起始密码子处于配对的空间位置对翻译起始效率有明显抑制作用,但SD顺序的空间位置与表达量之间无明显相关性。
- 王易伦陈农安陆长德郭瀛军戴建新陆德如
- 关键词：翻译起始MRNA
- 抗BmNPV即刻早期蛋白三联ribozyme在家蚕细胞中的表达被引量：1
- 1996年
- 为了阻断家蚕核多角体病毒（ＢｍＮＰＶ）的基因表达，以ＢｍＮＰＶ的即刻早期蛋白基因（ＩＥ）为靶序列，设计了三联ｒｉｂｏｚｙｍｅ．体外切割反应表明，该ｒｉｂｏｚｙｍｅ能特异地切割靶序列的ｍＲＮＡ；细胞实验表明，细胞中表达的ｒｉｂｏｚｙｍｅ也能够特异地切割靶序列，从而使受ＢｍＮＰＶ感染的Ｂｍ－Ｎ细胞中的多角体减少约３０％．
- 张晓岚陈农安陆长德祁国荣
- 关键词：家蚕核多角体病毒
- m RNA5′端不同位置的二级结构对原核生物翻译起始的影响被引量：11
- 2001年
- 一个 2 1 bp的序列插入 B50中的人 PCNA- Lac Z′融合蛋白 m RNA的 SD序列的上游 1 1 bpH ind 切点处 ,构成正、反向插入的两个重组质粒 B50 il、B50 i2 .通过计算机程序对 m RNA二级结构的模拟分析 ,B50 il的插入序列在翻译起始区 (TIR)前形成一个发夹结构 ,但不影响 TIR的二级结构 ;B50 i2的插入序列在 TIR 5′端形成一个二级结构 ;而另一克隆 D1 3与 B50因 SD前后的 6个和 7个碱基序列的不同 ;使翻译起始区 TIR的 SD到 AUG附近的二级结构不相同 .实验测定的四者的β-半乳糖苷酶活性与计算机计算的解开 m RNA TIR的二级结构所需能量ΔE进行比较 ,其结果说明 m RNA TIR前面的二级结构对翻译起始无影响 ,而位于 TIR的 5′端的二级结构对翻译起始效率是有影响的 .不过 ,它与 m RNA TIR的 SD到 AUG的附近的二级结构对翻译起始效率的影响相比 ,TIR5′端二级结构的影响比较小 .同时 ,PCNA- Lac Z和 PCNA- Lac Z′两种融合蛋白的β-半乳糖苷酶活性也进行了比较 ,酶活性有差别 ,但不同质粒酶活性的比值仍相同 .
- 夏宇蕾陈农安陆长德
- 关键词：翻译起始翻译起始区MRNA原核生物
- VEGF_(165)核酶对裸鼠人肺腺癌的治疗作用
- 2002年
- 谷仲平王云杰周勇安李谨革白雪帆陈农安
- 关键词：裸鼠人肺腺癌
- 抗血管内皮生长因子多位点核酶的合成及其体外切割作用
- 2005年
- 目的:设计合成血管内皮生长因子多位点核酶,探 讨其对靶RNA的切割作用.方法:利用计算机辅助设计针对 VEGF165的3个单位点核酶(Rz1,Rz2,Rz3)和联合型多位 点核酶(Rz123),构建其自剪切转录载体,观察多位点核酶对 靶RNA的切割作用.结果:构建的多位点核酶自剪切转录载 体在体外转录中,顺式核酶发生了自身剪切,并释放出正确的 目的核酶,多位点核酶可切割靶RNA,且效率高于单一核酶, 其切割效率分别为(37±10)%(Rz1),(51±8)%(Rz2), (68±15)%(Rz3)和(88±11)%(Rz123).结论:抗血管内 皮生长因子多位点核酶体外可联合切割靶RNA,具有较高的 生物活性.
- 谷仲平王耀程周勇安李谨革张涛陈农安
- 关键词：内皮血管内皮生长因子体外研究
- lBM Pc机上的核酸顺序数据库及其检索方法
- 1990年
- 我们在微型电脑IBM PC机上开发了一个核酸顺序数据库及其管理和分析系统。该库数据丰富且能更新,管理和分析软件系统功能强,结构设计合理、灵活,检索和管理比较方便。本文介绍了该库的作用及其各种检索方法。分析程序系统NASA(Nucleic Acid Sequence Analysis)将另文发表。
- 陈农安夏志清何东明
- 关键词：数据库
- 核酸顺序的计算机辅助分析系统被引量：1
- 1989年
- 本文介绍了一个在微机(IBM PC)上实现的、用于核酸顺序分析的计算机程序系统.该系统由三个层次和18个功能块构成,菜单及人机对话使得用户能较快地掌握和使用它.在编程中,采用了树结构、先进后出栈和稀疏矩阵等数据结构技巧,运用了Bayes法等统计分析方法,Kruskal算法和Floyd算法等一系列图论方法也被得到应用,这个软件系统的推出对于分子生物学研究具有一定的积极作用.
- 何东明夏志清陈农安
- 关键词：计算机
- 血管内皮生长因子_(165)核酶的合成及其体外活性被引量：2
- 2002年
- 目的 探讨抗血管内皮生长因子1 65(VEGF1 65)核酶的设计合成及其生物学活性 .方法 利用计算机辅助设计针对 VEGF1 65的锤头状核酶 ,构建核酶的自剪切转录载体p GEMRz2 12 ,体外转录合成核酶 Rz2 12及其相应的底物VEGF1 65m RNA,在无细胞体系中观察核酶对靶 RNA的切割作用 .结果 构建的自剪切转录载体在转录的过程中发生了自身剪切 ,并释放出目的核酶 Rz2 12 ,该核酶具有切割VEGF1 65m RNA的作用 .结论 计算机辅助设计的 VEGF1 65锤头状核酶体外可有效切割靶 RNA。
- 谷仲平王云杰李谨革陈农安
- 关键词：血管内皮生长因子核酶体外活性肿瘤
- 抗HPV16E7－ribozyme和靶RNA相互作用的计算机分析被引量：1
- 1996年
- 应用计算机分析了抗ＨＰＶ１６Ｅ７－ｒｉｂｏｚｙｍｅ的体外切割反应结果，发现ｒｉｂｏｚｙｍｅ和靶ＲＮＡ的二级结构及其能量变化能影响ｒｉｂｏｚｙｍｅ的切割活性。根据锤头结构ｒｉｂｏｚｙｍｅ的能量变化模型，对抗ＨＰＶ１６Ｅ７－ｒｉｂｏｚｙｍｅ和靶ＲＮＡ在痘苗表达体系及稳定表达体系中的相互作用，进行计算机模拟分析。结果表明，计算机分析ｒｉｂｏｚｙｍｅ和靶ＲＮＡ在细胞内的相互作用，可以指导ｒｉｂｏｚｙｍｅ的设计和在体内的应用研究。
- 黄扬中陈农安祁国荣王昌才陆长德
- 关键词：RIBOZYME计算机人乳头状瘤病毒RNA
- 抗VEGF_(165)核酶对人肺腺癌细胞生物学特性的影响
- 2003年
- 目的 探讨抗血管内皮生长因子 165 (VEGF165)核酶对人肺腺癌细胞生物学特性的影响。方法 设计合成针对VEGF1652 12位点的锤头状核酶 (vascularendothelialgrowthfactorribozyme ,VRz)及其突变体 (mutantVRz ,mVRz) ,体外检测核酶的剪切活性。采用亚克隆技术 ,构建腺病毒介导的抗VEGF165核酶真核表达载体pAdVRz ,用重组腺病毒感染人肺腺癌细胞A5 49,分别采用Northernblot印迹杂交、流式细胞仪、透射电镜和激光共聚焦等技术 ,观察感染前后A5 49细胞的生物学性状的改变。结果 成功地合成了具有明显剪切活性的抗VEGF165核酶VRz及其重组腺病毒表达载体rpAdVRz ,并在A5 49细胞中获得表达。重组腺病毒感染细胞的VEGF165表达减少了 87% ,而生物学性状不受外源基因表达的影响。结论 抗VEGF165核酶能够显著抑制人肺腺癌细胞内VEGF165的表达 ,为进一步进行肺癌的抗血管治疗提供了实验基础。
- 谷仲平王云杰周勇安程庆书刘锟李谨革白雪帆陈农安
- 关键词：核酶肺腺癌细胞生物学特性肿瘤血管生成
