方坚松
- 作品数:37 被引量:154H指数:8
- 供职机构:广州中医药大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金“重大新药创制”科技重大专项国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生自动化与计算机技术理学农业科学更多>>
- 沙美特罗防治流感的药物用途
- 本发明属于医药技术领域,涉及平喘药物沙美特罗(Salmeterol)防治流感的药物用途。本发明的创新之处在于药物重定位:研究发现,沙美特罗具有体内、体外具有抗流感病毒作用;具有抗金刚烷胺、奥司他韦耐药毒株的作用。有望成为...
- 刘艾林方坚松郑丽舒许律捷郭鹏飞王喆赵君杜冠华
- 支持向量机(SVM)和贝叶斯等数据挖掘技术在新药发现中的应用
- 2013年
- 在新药研发过程中,针对老年痴呆相关药物靶点如BuChE已发现大量活性化合物,然而用于预测化合物活性的模型并不多见。为了建立化合物活性预测模型,并指导新药筛选与发现,本研究基于药物靶BuChE抑制剂和非抑制剂的结构,应用支持向量机(SVM)、
- 刘艾林方坚松杨然耀刘帼静杜冠华
- 关键词:支持向量机数据挖掘技术新药发现贝叶斯
- 基于化学信息学方法预测药物靶点的研究进展被引量:22
- 2014年
- 网络药理学与多向药理学等新兴学科的出现迫使科学家们重新认识与探索已有药物新的作用机制。药物靶点的预测对阐释药物分子作用机制和老药新用等领域都具有重大意义。本文结合近年来国内外多个课题组的研究成果,主要综述了当前几种基于化学信息学方法预测小分子潜在靶点的方法,包括基于配体结构特征的预测方法、基于蛋白结构特征的预测方法以及基于数据挖掘技术的预测方法,通过应用实例,说明这些方法的优势,并提出今后的发展方向。
- 方坚松刘艾林杜冠华
- 关键词:化学信息学数据挖掘相似性搜索
- 基于UPLC-Q-TOF-MS/MS分析养血清脑丸化学成分与体外抗衰老活性分析被引量:4
- 2024年
- 基于超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术,对养血清脑丸(Yangxue Qingnao Wan,YXQNW)的主要化学成分进行分析鉴定。根据质谱信息,用Mass Hunter 10.0分析软件将采集到的准分子离子峰、二级碎片离子结合文献及对照品进行比对。从养血清脑丸中共推测鉴定出131个化合物,包括苯丙素类11个,黄酮类11个,含氮化合物42个,萜类12个,苯酞类17个,醌类23个及其他类化合物15个。应用D-半乳糖(D-gal)诱导的HT22细胞衰老模型,评价了养血清脑丸及养血清脑丸中迷迭香酸、没食子酸、芦丁、7-羟基香豆素、金丝桃苷、香草酸6个化合物的抗衰老活性。通过Beyo ClickTM EdU-555细胞增殖试剂盒从整体及个体的角度观察化合物对HT22细胞的损伤及单个细胞增殖能力的影响,并通过Annexin V-FITC/PI双染细胞凋亡检测试剂盒检测细胞凋亡的情况,最后采用细胞衰老β-半乳糖苷酶染色试剂盒测试化合物抗衰老的作用。该研究对养血清脑丸化学成分进行了较全面的分析,并对其抗衰老作用进行评价,为养血清脑丸进一步开展治疗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)、头痛、记忆力减退等多种神经系统相关疾病的药效物质基础研究提供科学依据。
- 张洁其符小梅卓越杨金娜郝宁王文佳胡蕴慧方坚松
- 治疗阿尔茨海默病的中药有效成分的网络药理学研究被引量:4
- 2016年
- 目的为了探索用于治疗阿尔茨海默病的中药方剂的网络药理学。方法本文收集了阿尔茨海默病相关的25个作用靶点,以及13种治疗阿尔茨海默病中药方剂,根据单味药出现的频率,从中选取了7种代表性的中草药进行后续研究。结果利用已建立的机器学习分类模型对中草药的化学成分进行作用靶点预测,并构建了化合物-靶点网络,靶点-靶点网络以及靶点-疾病网络来解释中药方剂的多种有效成分的协同作用机制。此外,经过血脑屏障透过性分析及对预测靶点的验证,得到了7个结构具有代表性的多靶点的先导化合物。结论本文应用网络药理学研究了抗阿尔茨海默病的传统中草药有效成分的网络作用机制,为抗阿尔茨海默病的中药临床应用以及多靶点药物设计提供了重要信息。
- 庞晓丛王喆方坚松连雯雯康德赵赢刘艾林杜冠华
- 关键词:阿尔茨海默病中药方剂网络药理学类药性
- 基于大规模比较蛋白质组学的内表型网络揭示阿尔茨海默病的血管功能障碍特征
- 2023年
- 目的基于大规模比较蛋白质组学的内表型网络识别特异性、敏感性、可靠性高的阿尔茨海默病(AD)蛋白标志物,揭示AD的血管功能障碍特征。方法我们提出一种新颖的基于网络的框架,通过大规模比较蛋白质组学分析来识别五种AD病理的内表型特征。首先通过分析来自AD患者和转基因小鼠模型的23套蛋白质组学数据集,揭示了AD内表型的蛋白质组学景观。利用网络近邻法测量AD内表型模块与AD患者皮质、血清和脑脊液的整合蛋白质组学数据集中差异表达蛋白(DEP)的距离显著性,识别AD病理中不同内表型的潜在生物标志物。结果通过整合基因型-脑组织表达RNA-seq数据、全基因组关联研究、单细胞转录组数据和文献证据,重点探讨了包含21个DEP的AD血管功能障碍内表型特征。APP/PS1和MCAO小鼠动物模型实验进一步验证了SEPT5、SNAP25和STXBP1可能作为AD血管功能障碍内表型的候选生物标志物。结论本研究展示了一种有效的网络策略,用于从整合的蛋白质组学数据中推测新的AD标志物,以期揭示AD的不同内表型特征。
- 蔡垂浦代朝方坚松
- 关键词:阿尔茨海默病蛋白质组学
- 治疗阿尔茨海默病的中药有效成分的网络药理学研究
- 目的 为了探索用于治疗阿尔茨海默病的中药方剂的网络药理学。方法 本文收集了阿尔茨海默病相关的25个作用靶点,以及13种治疗阿尔茨海默病中药方剂,根据单味药出现的频率,从中选取了7种代表性的中草药进行后续研究。结果 利用已...
- 庞晓丛王喆方坚松连雯雯康德赵赢刘艾林杜冠华
- 关键词:阿尔茨海默病中药方剂网络药理学类药性
- 异丹叶大黄素防治衰老及神经退行性疾病的药物用途
- 本发明属于医药技术领域,公开了异丹叶大黄素防治衰老及神经退行性疾病的药物用途。具体涉及式I所示的异丹叶大黄素(Isorhapontigenin)或其药学上可接受的盐在制备预防和/或治疗衰老相关疾病或神经退行性疾病药物中的...
- 刘艾林郭鹏飞赵君方坚松王超
- 中药复方在病证基础上的网络药理学研究被引量:37
- 2016年
- 中医研究方向强调利用现代研究手段探索各种中医治疗机制,随着系统生物学和网络生物学等交叉学科的兴起,以生物分子网络为切入点的网络药理学有望系统地刻画中医药的整体特征,立足于疾病与证候相结合的模式,多层面阐释中药复方药效物质基础,而成为当今中医药研究的热点所在。文章主要以网络药理学为切入点,探讨病证结合基础上中药复方在网络药理学方面的应用。
- 蔡甜甜潘华峰王奇方坚松赵金媛林钟宇陈晓东
- 关键词:中药复方病证结合网络药理学
- 健脾化瘀解毒方调控PKA/NLRP3通路治疗胃癌前病变的机制
- 2024年
- 目的:探讨健脾化瘀解毒方(JPHYJD)调控蛋白激酶A(PKA)/核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)通路治疗胃癌前病变(GPL)的作用机制。方法:动物实验一:将60只小鼠随机分为空白组,模型组,JPHYJD高、低剂量组,维酶素组,分别进行处理后,HE染色观察胃黏膜病理改变,免疫荧光染色观察NLRP3、GSDMD表达。动物实验二:将60只小鼠随机分为空白组、模型组、H89组、模型+H89组、JPHYJD组、模型+H89+JPHYJD组,Western Blot检测GSDMD-N、Caspase-1、IL-1β表达。细胞实验一:THP-1细胞分为空白组、模型组和JPHYJD组,使用LPS+ATP造模后,JPHYJD组予含药血清处理。细胞实验二:分组同动物实验二,分别予以H89及JPHYJD含药血清处理。检测焦亡相关分子表达和PI染色。结果:动物实验中,与空白组比较,模型组出现GPL病变,NLRP3、GSDMD表达显著升高(P<0.01),JPHYJD可改善胃黏膜病变,显著抑制NLRP3、GSDMD表达(P<0.01,P<0.05);与空白组比较,模型组GSDMD-N、Caspase-1、IL-1β表达显著升高(P<0.01),JPHYJD可抑制其表达(P<0.01),模型+H89+JPHYJD组表达水平显著高于JPHYJD组(P<0.05)。细胞实验中,与空白组比较,模型组NLRP3、GSDMD-N、Caspase-1、IL-1β蛋白和mRNA表达显著升高,焦亡水平显著升高(P<0.01,P<0.05),JPHYJD可显著抑制上述分子表达,减少细胞焦亡(P<0.01);与空白组比较,模型组PKA降低,NLRP3、GSDMD-N、IL-1β升高,焦亡水平升高(P<0.01),JPHYJD可上调PKA,抑制NLRP3、GSDMD-N、IL-1β,减少细胞焦亡(P<0.01,P<0.05);与JPHYJD组比较,模型+H89+JPHYJD组PKA降低,NLRP3、GSDMD-N、IL-1β表达升高,焦亡水平升高(P<0.01)。结论:JPHYJD可通过调控PKA/NLRP3通路抑制细胞焦亡从而治疗GPL。
- 张丹倪家慧张喜沈阳刘伟方坚松方坚松
- 关键词:胃癌前病变蛋白激酶A