张文燕
- 作品数：11 被引量：42H指数：3
- 供职机构：中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院海外杰出学者基金山东省科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程天文地球更多>>
- 基于高通量测序方法分析荣成月湖潮间带趋磁细菌多样性被引量：2
- 2019年
- 摘要:荣成月湖是一个典型天然潟湖,潮间带沉积物中存在多种形态趋磁细菌。通过Roche454高通量测序平台,对沉积物样品(B_S)和磁收样品(B_M)进行16SrRNA基因高通量测序,认识荣成潮间带沉积物的细菌群落结构,并了解趋磁细菌多样性及系统进化地位。研究结果表明沉积物样品中主要的细菌类群为δ-变形菌纲,占总细菌数的26.4%,其次是γ-变形菌纲和α-变形菌纲;而磁收样品中细菌多样性和种类明显降低,以α-变形菌纲占绝对优势,相对比例达72.6%。在磁收样品和沉积物样品分别发现了1612条和186条reads与趋磁细菌相关,分别占细菌总数的5.76%和0.85%,磁收样品中趋磁细菌数是沉积物样品的6.8倍。对两个样品中获得的趋磁细菌序列进行系统进化分析,发现这些序列多数属于变形菌门的α-变形菌纲,以趋磁球菌占绝对优势,少数属于δ-变形菌纲,与多细胞趋磁原核生物亲缘关系最近。海洋趋磁螺菌属仅在B_M样品中检出,趋磁弧菌属在B_M样品优势度高于B_S样品,而多细胞趋磁原核生物和趋磁螺菌属在B_S样品中优势度更高。通过分析样品间的差异OTUs,认为荣成潮间带沉积物中可能存在大量未知的趋磁细菌新类群。研究结果为下一步培养和开发趋磁细菌这一功能菌群,发现趋磁细菌新类群及趋磁细菌生态功能提供了基础资料。
- 张文燕潘红苗潘红苗杜海舰董逸吴龙飞杜海舰
- 关键词：潮间带多样性趋磁细菌高通量测序
- 胶州湾潮间带海洋趋磁细菌的特性研究
- 趋磁细菌(magnetotactic bacteria,MTB)是一类可以沿着磁力线方向运动的细菌,包含多种形态不同的革兰氏阴性细菌,广泛分布在淡水、海洋和土壤等环境中。它们能够在体内生物控制矿化合成纳米级(35-120...
- 张文燕
- 关键词：海洋趋磁细菌生物多样性系统发育
- 青岛潮间带趋磁细菌的垂直分布特征及与环境因子的关系被引量：4
- 2013年
- 趋磁细菌是一类能够沿着磁力线运动的革兰氏阴性细菌,主要生活在淡水和海洋的有氧-无氧过渡区。本调查通过对青岛汇泉湾潮间带沉积物柱状样分层样品中趋磁细菌的计数和沉积物理化因子的分析,研究了趋磁细菌的垂直分布特征及其与环境因子的关系。结果显示趋磁细菌以趋北型的趋磁球菌占优势,主要分布环境的氧化还原电位为179.7--107.0 mV,为弱还原-还原性质,最大丰度（94-169个/cm3）出现在氧化还原跃层（表层下5-9 cm黄-黑沙界面处）,暗示有氧-无氧过渡区；趋磁细菌的垂直变化趋势与粒径、含水率、硫酸盐的变化趋势基本一致。
- 张蕊陈一然周克张文燕肖天吴龙飞
- 关键词：趋磁细菌环境因子氧化还原电位潮间带
- 胶州湾海域表层沉积物细菌多样性被引量：14
- 2010年
- 采用16S rDNA文库结合PCR-RFLP分析的手段,对胶州湾4个站位沉积物中的细菌多样性和群落特征研究分析。结果表明,沉积物中细菌种类丰富,最多包含分布于14个已知门类的细菌,和一些未被认知的序列;各站位沉积物中优势菌群均为变形菌门和酸杆菌门,其中γ-和δ-变形菌纲为变形菌门中的绝对优势类群,在4个文库序列中平均占42%和16.75%;此外,拟杆菌门、浮霉菌门和放线菌门的种类也较为大量存在。各细菌种群有较明显空间分布差异,可能与不同区域胶州湾环境条件相关。
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- 关键词：沉积物细菌群落
- 深海趋磁细菌研究被引量：3
- 2019年
- 介绍了趋磁细菌的基本概念及研究状况,综述了海洋趋磁细菌的研究进展,着重总结了深海趋磁细菌的研究成果及现状,展望了深海大洋和海山生态环境中趋磁细菌的研究意义及前景,为海洋趋磁细菌研究提供借鉴与参考。
- 肖天潘红苗张文燕
- 关键词：深海趋磁细菌生态系统
- 东太平洋锰结核区沉积物趋磁细菌的多样性及磁学特征的研究
- 趋磁细菌已经被发现广泛分布于世界各地的水体和沉积物中,包括河流、湖泊、潟湖、沿岸潮间带、草原土壤,以及深海沉积物环境.东太平洋锰结核区是一个多金属结核区,富含大量的锰,铁,钴,铜和镍等.研究表明涉及这些重金属沉积的微生物...
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- 关键词：东太平洋趋磁细菌种群多样性磁学特征
- 文献传递
- 青岛太平湾潮间带趋磁细菌多样性被引量：3
- 2016年
- 在青岛太平湾潮间带沉积物中发现了一定量的海洋趋磁细菌,最大丰度可达350个/cm^3。透射电镜观察发现该区域趋磁细菌均为趋磁球菌。磁小体个体形状单一,皆是立方体状;磁小体排列方式多样,以链状排列为主,包括单链、双链与多链,也有少数成簇排列。EDS结果表明,磁小体成分为四氧化三铁。据估算,趋磁细菌的铁元素含量(干重)范围在0.40%—6.91%之间,平均为2.19%。通过16S rRNA基因文库的构建与测序得到了47个趋磁细菌序列,分属13个OTU。系统发育分析结果表明,它们都属于α-变形菌纲,其中9个OTU与已知最相似序列的相似性低于97%,有5个OTU与已知最相似序列的相似性低于93%,可能代表了趋磁细菌的9个新种、5个新属,说明该区域潜在的微生物新种质资源十分可观。
- 徐丛张文燕陈一然张蕊董逸杜海舰潘红苗肖天
- 关键词：潮间带趋磁细菌多样性磁小体RRNA基因
- 胶州湾大肠菌群丰度变化及对环境污染的指示被引量：1
- 2011年
- 采用MPN计数法对胶州湾大肠菌群丰度进行7年(84个月)连续监测,结果表明,大肠菌群丰度的周年变化明显,全年最高丰度与最低丰度相差约2.2倍。胶州湾大肠菌群丰度自2005—2009年明显下降,降幅达67%,说明胶州湾环境质量有所好转。研究还发现大肠菌群丰度变化具有明显的区域特征,河口区最高,湾内区最低,差异近11倍。大肠菌群丰度与环境因子的相关性分析表明,大肠菌群丰度变化与胶州湾海水中总氮、溶解有机碳、叶绿素a浓度,海水盐度及青岛市废水排放量均显著相关。
- 董逸刘敏武洪庆张翠霞张文燕于莹丰美萍徐剑虹肖天
- 关键词：大肠菌群丰度环境污染
- 趋磁细菌的地域分布特征被引量：16
- 2010年
- 通过对来自目前GenBank中趋磁细菌的16S rDNA序列分析,并进行系统进化树的构建,比较不同区域趋磁细菌的差异.目前,GenBank中共有239条趋磁细菌16S rDNA序列,相似性分析后有137条不同的序列(海洋55条,淡水82条),分属于变形菌门和硝化螺菌门.全长序列的系统进化分析显示,全球趋磁细菌的分布具有一定的区域性,海洋与淡水趋磁细菌区分明显.不同地域的趋磁细菌的系统进化分析显示,近海与大洋的趋磁细菌有明显的差别;而同为海洋或淡水的环境中,如巴西和美国近海、德国和中国的淡水湖泊,趋磁细菌相似性较高,即相同生境中的趋磁细菌相似性较高,表明趋磁细菌的类型与生境条件有很大关联性.基于16S rDNA序列分析,推测趋磁细菌起源可能是多源的,环境条件可能作为重要的进化压力在趋磁细菌长期演化过程中扮演重要角色.
- 张文燕张圣妲肖天潘永信潘永信
- 关键词：趋磁细菌RDNA序列分析系统发育
- Magnetospira sp. QH-2 MamK蛋白的结构和系统进化分析
- 2016年
- Magnetospira sp.QH-2是一株分离自黄海潮间带的海洋趋磁螺菌,该菌磁小体排列不整齐,并且磁小体链内某些区域排列疏松,推测与其磁小体岛上的mam K编码的Mam K蛋白相关。mam K开放阅读框大小为1086 bp,编码361个氨基酸,Mam K蛋白属于NBD_sugar-kinase_HSP70_actin超家族,为非跨膜蛋白;此外,还利用生物信息学工具预测Mam K蛋白二级和三级结构。系统进化分析显示Mam K蛋白的系统进化和16S r RNA基因的系统进化有一定差异,推测磁小体岛的获得可能与菌种的进化是独立的两个过程;淡水与海水中的趋磁螺菌虽然形态相似,但系统进化地位有一定差异,可能是两者不同生境下适应性演化的结果。
- 滕兆洁张文燕刘佳董逸陈一然潘红苗杜海舰王明玲徐丛肖天
- 关键词：系统进化RRNA基因
