杨旭
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金海洋公益性行业科研专项国家公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 瓦氏马尾藻微卫星分子标记的筛选被引量：1
- 2014年
- 采用锚定PCR技术,构建了瓦氏马尾藻（Sargassum vachellianum）微卫星富集文库.阳性克隆筛选、测序和序列分析结果表明,在筛选的523个白色菌落中,214个克隆（占筛选白色菌落数的41％）含有重复的微卫星序列,其中105个（20.1％）有随机侧翼区,可以进行引物设计,109个缺乏足够的侧翼序列.在获得的微卫星序列中,完全的占50％;不完全的占2.3％;复合的占47.7％.重复次数5以上的微卫星序列主要以二碱基重复为主,除引物中使用的CT、GT和CAC重复单元外,还观察到AC、GA、CG、AT、CTA、TAG和AGT的重复序列.微卫星重复次数主要集中在6～10次之间,占92％,最高为23次.设计的54对微卫星引物中有8对能够在野生瓦氏马尾藻群体中进行多态性扩增.本研究中构建的瓦氏马尾藻富集微卫星文库将为以后开发未知微卫星标记提供帮助.
- 杨旭毕燕会周志刚
- 关键词：微卫星多态性
- 不同地理种群瓦氏马尾藻ITS序列特征及其系统进化分析被引量：3
- 2014年
- 为研究不同地理种群瓦氏马尾藻ITS的序列变异,实验采用PCR扩增和序列测定方法,获得了3个不同地理种群15株瓦氏马尾藻的ITS全长序列,并进行序列分析。结果显示,15个个体共出现4种不同的ITS序列,它们相应的ITS1、5.8S、ITS2长度相同,均为762、158和507 bp,共有3个位点发生碱基变异。结合从GenBank中下载的马尾藻科3个属24种马尾藻的ITS序列,以羊栖菜属的羊栖菜,喇叭藻属的拟小叶喇叭藻和下延喇叭藻作为3个外群,采用邻位相连法构建分子系统进化树,结果显示,瓦氏马尾藻的ITS序列优先聚在一起然后以较高的置信度与南海马尾藻和球囊马尾藻聚为一支,在系统发生上显示出更近的亲缘关系。在选取的马尾藻中瓦氏马尾藻与南海马尾藻遗传距离最近为0.004,与拟小叶喇叭藻遗传距离最远为0.422。
- 毕燕会杨旭周志刚
- 关键词：ITS序列地理种群系统进化
