张洪波 作品数:44 被引量:114 H指数:7 供职机构: 西安交通大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 陕西省科技攻关计划 教育部“新世纪优秀人才支持计划” 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 政治法律 文化科学 更多>>
宁夏回族群体12个Y染色体短串联重复序列基因座多态性研究 被引量:4 2007年 目的获得12个Y染色体短串联重复序列(Y chromosome short tandem repeat,Y-STR)位点(DYSl9、DYS389I、DYS389II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS385a、DYS385b、DYS437、DYS438、DYS439)在宁夏回族群体的多态性分布。方法应用PowerPlex Y荧光标记复合扩增试剂盒,对宁夏回族群体150名无关健康男性个体基因组DNA进行复合扩增,用ABl377测序仪对扩增产物进行检测,统计12个Y-STRs位点群体遗传学参数。结果12个基因座共检测出75个等位基因,频率分布在0.0067~0.7067之间,基因多样性(gene diversity,GD)分布在0.4446~0.8877之间。在150名无关个体中,共有148种不同的单倍型,其中只有两种单倍型分别为两名个体共有,12个Y-STRs位点联合构成的单倍型多样性为0.9864。结论12个Y-STRs基因座在宁夏回族群体具有较强的个体识别能力,可应用于群体遗传学及法医学研究。 朱永生 霍正浩 余兵 张洪波 王玉炯 赵巍 焦海燕 党洁 李生斌关键词:遗传多态性 回族 用于检测SCZ相关基因多态性的引物及试剂盒 本发明公开了一种用于检测SCZ相关基因多态性的引物及试剂盒,本发明基于VRK2基因rs3732136多态性位点与SCZ的相关性,设计了用于扩增包含VRK2基因多态性位点的特异引物对,并提供了包含该引物对的检测试剂盒,可用... 张宝 李生斌 魏曙光 赖江华 张洪波 余兵 冯祖飞 朱永生 王云鹏文献传递 应用PCR-SSOP技术研究中国汉族、维吾尔族HLA-A基因座基因多态性(英文) 被引量:12 2002年 人类白细胞抗原 (HumanLeukocyteAntigen ,HLA)基因复合物位于 6p2 1.3,有 2 2 0多个不同的功能基因 ,是人类基因组最复杂的遗传多态系统。HLA等位基因的变异在医学、法医学、人类学等领域具有重要的意义。自从 196 4年以来 ,HLA分型一直采用经典的微量淋巴细胞毒实验 ,但该方法是血清学水平的分型 ,不能识别很多特异性的等位基因 ,而且高质量的抗体也不易获得。从 2 0世纪 90年代起 ,在国家自然科学基金的资助下 ,首先开展HLAⅡ类位点基因分型研究及大规模群体多态性调查 ,所获得的中国主要民族基因数据已应用于多个领域。相比之下 ,HLAⅠ类基因数量更丰富 ,包含了A、B、C、E、F、G和假基因H、J、K、L等 10个位点 ;基因分子结构更复杂 ,更具多态性。因此 ,HLAⅠ类DNA分型比HLAⅡ类分型有许多困难。直至目前中国人群HLA A基因座基因多态性和分布频率的研究尚未充分进行。而任何DNA标记用于遗传分析、法医鉴定等领域之前 ,必须先进行群体调查 ,建立不同民族基因数据库 ,这是不可逾越的基础工作。鉴于此 ,采用灵敏而非同位素污染的PCR SSOP基因分型技术 ,对 16 5个汉族和 16 2个维吾尔族个体的HLA A基因座多态性进行调查。结果在汉族群体中发现 2 2种等位基因 ,频率最高的是HLA A 110 1(19.7% ) 。 闫春霞 宋艳萍 赖淑苹 赖江华 张洪波 赵君海 李生斌关键词:PCR-SSCP 汉族 维吾尔族 基因多态性 中国西北地区汉族、维吾尔族HLA-A基因频率的分布差异 被引量:6 2008年 目的:分析中国西北地区汉族、维吾尔族HLA-A基因频率分布并比较其差异性。方法:采用PCR-SSOP基因分型方法,对西北地区165例汉族和162例维吾尔族无关个体进行HLA-A基因分型。结果:在汉族群体中检出13个HLA-A基因,频率分布在0.0060~0.2909之间,频率最高的是HLA-A*02(0.2909),其次为A*11(0.197)、A*24(0.173),A*33、A*01和A*30的基因频率在0.0500~0.1000之间。在维吾尔族中检出15个HLA-A基因,频率分布在0.0061~0.2191之间,频率最高的是A*24(0.2191),其次为A*02(0.179)、A*33(0.102),A*01、A*11、A*28和A*29的基因频率在0.0500~0.1000之间。HLA-A*23及A*25仅在维吾尔族群体中检出。两群体基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。结论:西北地区汉族及维吾尔族群体HLA-A基因具有较丰富的多态性,该资料显示出种族、民族及地域的差异。 宋艳萍 张梅 赖淑苹 赖江华 张洪波关键词:基因频率 中国甘肃裕固族X-STR遗传多态性及其应用研究 被引量:5 2008年 为研究中国甘肃裕固族人群X染色体STR基因座的遗传多态性及其在群体遗传学中的应用,采用PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染显带技术,检测120名(女55,男65)裕固族无关个体9个X-STR基因座(DXS7130、DXS7132、DXS6804、DXS7423、DXS7424、DXS6789、DXS6799、DXS8378和HPRTB)的等位基因频率及基因型分布,以及存在连锁的X-STR基因座的单体型多态性;同时,利用X-STR构建系统发生树和进行聚类分析,分析裕固族与我国其他民族的群体遗传关系。结果发现,DXS7130、DXS7132、DXS6804、DXS7423、DXS7424、DXS6789、DXS6799、DXS8378和HPRTB基因座分别检出8、6、6、5、6、7、6、4、6个等位基因和16、14、13、6、13、20、11、6、12种基因型,9个X-STR基因座女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。由DXS7130和DXS8378基因座组成的单体型共检出15种,由DXS6789、DXS6799、DXS7424和DXS6804基因座组成的单体型共检出55种,单体型多样性分别为0.8212和0.9947。群体遗传多态性指标显示上述9个X-STR基因座均具有较高多态性,在法医学个体识别、亲权鉴定及群体遗传学研究中有重要应用价值。对裕固族与我国其他民族群体遗传关系的研究结果显示,裕固族与蒙古族及同处西北的汉族、藏族关系较近,而与回族、维族关系较远,提示裕固族是一个在起源上与蒙古族、汉族以及藏族关系密切的民族群体。 陈艳炯 陈峰 辛娜 张洪波 郑海波 余兵 李生斌 陈腾关键词:X染色体 短串联重复序列 单体型 遗传多态性 聚类分析 中华民族群体基因组多态性与个体识别应用研究 李生斌 赖江华 陈腾 郑海波 余兵 张洪波 韩卫 高雅 刘明俊 朱波峰 刘新社 “中华民族群体基因组多态性与个体识别应用研究”属于医学领域中的法医学专业。项目的实施综合应用了遗传学、基因组学、生物信息学等学科的理论、方法和技术,较为系统地从分子学水平上揭示了中华民族遗传结构与变化规律,使人们对中华民...关键词:关键词:中华民族 基因组 多态性 鉴别猕猴桃品种的DNA条带及基于其的快速鉴定方法 本发明公开了鉴别猕猴桃品种的DNA条带及基于其的快速鉴定方法,可以采用分子鉴定法,或者形态与分子鉴定相结合的鉴定方法。形态鉴定是通过对待测猕猴桃的大小,首尾形态,表皮毛以及横纵切面形态进行鉴定;分子鉴定是以待检测的猕猴桃... 解巧利 严飞 王云鹏 朱永生 赖江华 魏曙光 张洪波 张宝文献传递 一种X染色体STR基因位点分型的荧光检测方法 本发明公开了一种X染色体STR基因位点分型的荧光检测方法,包括等位基因分型标准物的制备:分别以包含3个X染色体STR基因位点DXS7132、DXS6799和DXS6804的不同基因型的质粒为模板,以5’端标记有荧光分子的... 赖江华 沈靓 李生斌 张洪波 余兵 刘清波文献传递 西安汉族、西藏珞巴族DXS6799和HPRTB位点的遗传多态性 2005年 目的调查X染色体STR位点DXS6799、HPRTB在西安汉族、西藏珞巴族的遗传多态性。方法应用PCR和聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术进行基因分型。结果西安汉族DXS6799检出6个等位基因,基因频率在0.0160~0.4840之间,女性和男性的个体识别率分别为0.8516、0.6157;HPRTB位点检出8个等位基因,等位基因频率在0.011~0.290之间,女性和男性的个体识别率分别为0.7974、0.7039。西藏珞巴族DXS6799检出5个等位基因,基因频率为0.0222~0.6074之间,女性和男性的个体识别率分别为0.7684、0.5805;HPRTB位点检出5个等位基因,等位基因频率在0.0420~0.3866之间,女性和男性的个体识别率分别为0.8661、0.7029。西安汉族、西藏珞巴族女性的基因型分布均符合Hardyweinberg平衡。结论DXS6799和HPRTB有较高的个体识别率和非父排除率,在个体识别和亲权鉴定中有应用价值。 余兵 张洪波 秦群霞 康龙丽 李生斌关键词:短串联重复 遗传多态性 西安汉族X染色体上6个STR位点的遗传多态性 被引量:23 2005年 目的调查西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423的基因及基因型频率分布。方法应用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术检测结果。结果在120例女性无关个体中,DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423分别检出5、6、11、10、8和4个等位基因;分别检出10、17、29、32、22和7种基因型;此6个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。结论此6个X染色体STR位点均有较高的个体识别率,在个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义。 余兵 秦群霞 闫金成 张洪波 李生斌关键词:X染色体 短串联重复序列 遗传多态性 汉族