余仕问
- 作品数：9 被引量：26H指数：3
- 供职机构：曲靖师范学院化学化工学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：理学文化科学生物学更多>>
- 过渡金属硫化物阳离子气相动力学理论研究
- 过渡金属硫化物在工业催化和生物上的重要性引起了广泛的研究兴趣[51]。在工业上，过渡金属氧化物在很多方面被用做多用途的催化剂，但对有些反应其活性太高得不到预期的产品。相反，过渡金属硫化物作为催化剂反应活性低、不容易中毒显...
- 余仕问
- 关键词：过渡金属硫化物密度泛函理论催化剂
- 文献传递
- 过渡金属硫化物阳离子(MS_n^+,M=Sc,Ti,n=1,2,3)的理论研究
- 2008年
- 用密度泛函理论研究了气相中过渡金属硫化物阳离子(MSn+,M=Sc,Ti,n=1,2,3).获得了各种离子的几何结构、电子结构、光谱性质及热力学数据,确定了其基态结构,并和已有实验数据作了对比.根据我们的理论计算,ScS+,TiS+的基态分别为1Σ+,2Δ.其主要电子组态分别为1σ222σ1π4,12σ2σ21π41δ.MS2+的各种离子基态结构是三元环型结构,ScS2+,TiS2+的基态分别为1A′,2A′.MS3+的可能结构有直线型结构、三角锥型结构和以M+为中心的平面结构.经过反复计算,优化各种结构并对每一结构做振动频率分析,得到ScS3+,TiS3+基态分别为:3A″,2A″.
- 余仕问姚立峰谢小光
- 关键词：密度泛函理论B3LYP电子结构
- DNA碱基甲基化对碱基间相互作用和DNA构象以及DNA-蛋白质结合的影响
- 2012年
- 比较了采用量子化学从头算方法(ab initio)计算的非甲基化-甲基化DNA碱基间的氢键和堆积作用.结果表明,碱基甲基化损伤减弱了碱基间的氢键作用能,但使堆积作用能增大.应用自然键轨道(NBO)理论,分析了采用M062x/6-31+G(d,p)算法优化的C5-甲基胞嘧啶(C5-MeC)和O6-甲基鸟嘌呤(O6-MeG)与非甲基化碱基间的氢键结构.NBO分析揭示,甲基插入O6-G,改变了授受体作用方式,产生的空间障碍使cis-O6MeG…C的N1(G)…HN4(C)的距离增大,nN1(G)的电荷迁移能力减小,导致cis-O6MeG…C的氢键作用能小于anti-O6MeG…C.采用分子动力学方法 (MD)模拟了IBRCA基因启动子区富CpG序列中12mer的寡聚体,分析了CpG甲基化(mCpG)对DNA双链体构象的影响.结果表明,不同位点的mCpG,对DNA双链体平面内的碱基对结构基本没有影响,但CpG段的堆积结构参数以及DNA大小沟的宽度和深度发生了不同程度的改变.还进一步分析了mCpG对K50型同源域转录因子PITX2与DNA相互作用的影响.得到的结论与文献基本一致.
- 杨思娅姚立峰余仕问林雪飞
- 关键词：DNANBOCPG分子动力学
- 休克尔分子轨道(HMO)法的应用被引量：2
- 2008年
- 休克尔分子轨道(HMO)法作为一种重要的半经验方法,广泛应用于计算平面离域共轭分子中的π电子结构.这部分内容是结构化学的一个教学难点和重点,很多教材对此讲解的不够深入,学生很难理解掌握,因此本研究在详尽阐述休克尔分子轨道理论要点的基础上,以丁二烯为例讨论如何应用HMO法进行快捷处理.
- 郭洪孙成科林雪飞余仕问
- 关键词：休克尔分子轨道共轭分子离域Π键丁二烯
- 气相中Mo^+与CS_2反应的理论研究
- 2011年
- 用密度泛函理论中B3LYP方法详细研究了Mo+(6S,4d5,4G,4d5)与CS2的反应机理.为了得到更为准确的活化能和反应的能量,在B3LYP优化好的结构的基础上,用耦合族理论(CCSD(T))计算了各个驻点的单点能.计算结果显示,活化C-S键的反应机理为是插入-消出机理.反应Mo+(6S)+CS2(1Σ)→MoS+(4Σ-)+CS(1Σ)在反应过程中经过六重态-四重态势能面交叉,我们确定势能面交叉点(CP).所有的计算结果都和已有的理论和实验值进行了比较.
- 余仕问陈广侯能邦姚立峰
- 关键词：钼离子二硫化碳密度泛函理论
- O^6-鸟嘌呤和O^4-胸腺嘧啶甲基化与DNA碱基异常氢键作用的理论研究被引量：7
- 2011年
- 用密度泛函B3LYP方法在6-311+G**基组水平上对顺(cis-)、反式(anti-)O6-甲基鸟嘌呤(O6-MeG)和O4-甲基胸腺嘧啶(O4-MeT)与DNA碱基(腺嘌呤A、鸟嘌呤G)的非Watson-Crick氢键二聚体进行了优化.在MP2/cc-pVXZ(X=D,T)//B3LYP/6-311+G**水平上,采用完全基组外推方法校正了氢键二聚体的相互作用能,并用完全均衡校正法(CP)校正了基组重叠误差(BSSE).此外,在B3LYP/6-311+G**水平上计算了各氢键碱基对的全电子波函数,并用分子中的原子理论(AIM)和电子密度拓扑方法分析了碱基间的弱相互作用.计算结果显示,甲基化使碱基对间的氢键作用模式发生了明显的扭转和不同程度的位移,碱基间的电子密度分布和氢键作用能明显减小,甲基化对O6-MeG和O4-MeT与DNA碱基间的氢键作用是去稳定化的,这种影响主要来自于大体积的甲基的空间效应和给电子效应,且对顺式的影响明显大于反式.计算结果与文献给出的实验结论基本一致.
- 林雪飞孙成科杨思娅余仕问姚立峰陈益山
- 关键词：甲基化氢键AIM
- C_6H_5X·Y-(X,Y=F,Cl,Br,I)中氢键和卤键的理论研究被引量：1
- 2012年
- 通过MP2/aug-cc-pVDZ理论方法计算研究了C6H5X.Y-(X,Y=F,Cl,Br,I)体系中的氢键和卤键.计算表明所有的卤代苯都能与卤素离子形成氢键相互作用,氢键强度顺序为:C6H5FCl->Br->I-.C6H5Cl,C6H5Br,C6H5I能与卤素离子形成卤键相互作用,卤键强度顺序为:C6H5ClCl->Br->I-.分析结果可以发现体系中的卤键强度差异要大于氢键,说明在此体系中卤键具有比氢键更大的选择性.
- 陈益山姚立峰余仕问
- 关键词：氢键
- DNA甲基化-非甲基化碱基间堆积作用的理论研究被引量：4
- 2010年
- 运用二级Mфller-Plesset(MP2)理论方法和cc-pVDZ基组优化了6-甲基鸟嘌呤(O6-MethylG),4-甲基胸腺嘧啶(O4-MethylT)以及5-甲基胞嘧啶(C5-MethylC)与DNA碱基鸟嘌呤(G),腺嘌呤(A),胞嘧啶(C),胸腺嘧啶(T)之间的堆积构型.在MP2/aug-cc-pVXZ//MP2/cc-pVDZ(X=D,T)水平上,采用完全基组外推方法校正了堆积碱基对间的相互作用能,并用完全均衡校正法(CP)校正了基组重叠误差(BSSE).MP2计算结果表明,DNA碱基甲基化使得嘧啶-嘧啶、嘧啶-嘌呤堆积碱基间的平行旋转角发生明显改变,并使堆积碱基间的相互作用能增大.在MP2/cc-pVDZ计算级别上得到了各堆积碱基对的全电子波函数,并用分子中的原子理论(AIM)分析了堆积碱基对间的弱相互作用.AIM分析结果显示,甲基化增强了堆积碱基间的π-π作用,且甲基氢与相邻碱基间形成H2CH…X(X=O,N,CH3,NH2)等类型的氢键.甲基化损伤使碱基间重叠程度增大、π-π作用增强以及堆积碱基间形成多个氢键,是堆积作用能增加的主要原因.
- 陈益山余仕问杨思娅
- 关键词：甲基化碱基对相互作用能
