张民
- 作品数：24 被引量：20H指数：2
- 供职机构：复旦大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家杰出青年科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 一个编码XAP2同源蛋白的人视网膜cDNA的克隆
- 1999年
- 用同源筛选法从人视网膜ｃＤＮＡ分子库中克隆到一个与ＸＡＰ２ｃＤＮＡ有高度同源的ｃＤＮＡ序列，长１３８６ｂｐ，其第１７—１１７１ｎｔ为一个完整的开放阅读框（ＯＲＦ），编码３８４个氨基酸，其Ｃ端较ＸＡＰ２长５５个氨基酸；３ＵＴＲ长２１８ｂｐ，１３５５—１３６０ｎｔ为加尾信号序列ＡＡＴＡＡＡ，１３７７—１３８６ｎｔ为ＰｏｌｙＡ序列。由该ｃＤＮＡＯＲＦ推导的蛋白质被命名为ＡＩＰＨ，它在ＧｅｎＢａｎｋ的登录号为：ＡＦ０３８４３７。它与ＸＡＰ２的氨基酸一致率为４２％，相似率为６１．７％。计算机分析结果显示：推导的ＡＩＰＨ蛋白与乙肝病毒Ｘ蛋白（ＨＢＸ）有三个较高同源的区域。其中两个对应于ＨＢＸ的反式转录激活功能结构域。ＡＩＰＨｃＤＮＡ与人体１６种组织ｍＲＮＡ的Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交结果显示：这个来源于视网膜的转录本也可在骨骼肌和心脏中见到，杂交带长度约１．９Ｋｂ；此外在骨骼肌和心脏及其它１４种组织中还可见到另一个长约５．
- 王小柯余龙傅强张民屠强胡培蓉赵寿元
- 关键词：HBXCDNA克隆视网膜
- 人类细胞因子信号传导抑制因子基因humSOCS-2的分离与克隆
- 1999年
- 采用国际GenBankEST数据库同源筛选的策略 ,筛选到 1个与小鼠细胞因子信号传导抑制因子基因mmSOCS 2高度同源的EST( gb/AA1 1 5 2 39) ,在人胎盘cDNA分子库中PCR获得与之序列一致的cDNA片段 ,以该片段为探针在人胎盘cDNA分子库中步移获得一长1 0 1 1bp的cDNA片段 ,包含一个长 5 94bp的开放阅读框 ,编码了 1 98个氨基酸残基 ,经NCBI数据库检索是一个全新的基因 .同源比较发现其与mmSOCS 2的氨基酸同源性高达 93% ,其SH2 结构域及SOCS盒与相关基因的类似结构也具有较高的同源性 ,从而将其命名为hum SOCS 2基因 ,国际GenBank登记号为gb/AF0 2 0 5 90 .表达谱分析表明该基因在前列腺组织中表达量最高 ,但另 1
- 张民余龙屠强胡培蓉张琪毕安定姜春玲赵寿元
- 关键词：细胞因子信号传导克隆
- 人类C_2H_2型锌指蛋白基因ZNF199全长cDNA的分离与克隆
- 1998年
- 胡培蓉余龙张民王小柯屠强赵寿元
- 关键词：锌指蛋白基因CDNA克隆
- 人类神经元蛋白 P17.3 全长 cDNA 的克隆及表达特征分析
- 1998年
- 从人胎脑ｃＤＮＡ文库分离到一个长５９５ｂｐ的ｃＤＮＡ，它含一个编码１５３个氨基酸的完整开放阅读框，５ＵＴＲ长１８ｂｐ，３ＵＴＲ长１１８ｂｐ；在３ＵＴＲ中，含有非典型的加尾信号序列“ＡＡＴＴＡＡＡ”和长１５ｂｐ的ｐｏｌｙＡ序列。由阅读框推导的编码蛋白质的分子量为１７．３ＫＤ，等电点为４．８９。由于它与小鼠神经元蛋白ＮＰ１５．６呈高度同源，尤其是二者的推导氨基酸序列一致性高达８１．２％，故将这一新ｃＤＮＡ序列推导的蛋白命名为神经元蛋白Ｐ１７．３。用ＰＣＧＥＮＥ软件包的ＧＧＢＳＭ程序推导该蛋白质的二级结构，发现该蛋白中３２．６％的氨基酸参与组成α螺旋结构，１５．０％的氨基酸参与组成β折叠片；用位点检测分析软件的ＰＥＳＴＦＩＮＤ程序分析，发现它的第４８～６８位氨基酸残基区为快速衰变蛋白特征性的“ＰＥＳＴ”结构域。
- 崔映宇余龙龚若沫张民范玉新傅强岳鹏赵寿元
- 关键词：人胎脑CDNA克隆
- 在胚胎性横纹肌肉瘤中呈下调表达的新基因HUMCyr61的分离与克隆被引量：1
- 1998年
- 毕安定余龙张民孙喜元范玉新赵寿元
- 关键词：胚胎性横纹肌肉瘤基因表达
- 人类肽-甲硫氨酸亚砜还原酶的cDNA克隆、组织表达谱特征及染色体定位被引量：1
- 2000年
- 蛋白质结构中某些氨基酸的氧化和还原是生物体内对蛋白功能的一种调控方式．甲硫氨酸（Ｍｅｔ）被氧化则变为甲硫氨酸亚砜（Ｍｅｔ（Ｏ）），它可导致所在蛋白质的生物学活性降低或丧失，但肽－甲硫氨酸亚砚还原酶（Ｐｅｐｔｉｄｅ ｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ ｓｕｌｆｏｘｉｄｅ ｒｅｄｕｃｔａｓｅ， ｍｓｒＡ）则可使甲硫氨酸亚砜还原为甲硫氨酸，使其所在蛋白质重新恢复活性．为了研究人体中Ｍｅｔ氧化还原的机制，以牛ｍｓｒＡ ｃＤＮＡ序列为信息探针，筛选人ＥＳＴ数据库，依据若干同源ＥＳＴ的信息从人ｃＤＮＡ分子库中克隆到一个长１２５５ｈｐ的人ＭＳＲＡ ｃＤＮＡ．该ＣＤＮＡ包含一个长７０５ ｂｐ的可读框，它编码了 ２３５个氨基酸残基．同源性比较表明，该基因与牛和大肠杆菌的ｍｓｒＡ基因的氨基酸一致性分别为８８％和６１％．表达谱分析发现，该基因在人体大多数组织中均有一条长约１．６ｋｂ的转录本，并在肾中呈高表达．应用辐射杂种细胞株定位系统（ｒａｄｉａｔｉｏｎ ｈｙｂｒｉｄ ｍａｐｐｉｎｇ ｐａｎｅｌ， ＲＨ ｍａｐｐｉｎｇ）将该基因精确定位在人染色体８ｐ２２～２３区带的ＤＳＳ５１８和Ｄ８５５５０位标之间。
- 胡培蓉余龙张民郑利华蓝斐傅强赵寿元
- 关键词：CDNA克隆染色体定位
- 人类STK全长cDNA克隆及其表达谱分析被引量：1
- 1999年
- 从人类的睾丸组织cDNA文库中分离出 1条新的全长cDNA ,在其 12 2 5bp序列中含有一个长 10 3 2bp ,编码 3 4 4个氨基酸的开放阅读框 .基于它与丝 /苏氨酸蛋白激酶家族中其他成员存在较高的同源度 ,尤其是与小鼠MMSTK1的同源度高达 80 % ,推论该基因的蛋白产物可能也是一个丝 /苏氨酸蛋白激酶 ,故将其暂命名为HUMSTK1(人类STK1) .它的mRNA在胎儿胸腺中呈高表达 ,在睾丸、小肠和结肠中低表达 ,而在人体其他组织中不表达 .
- 张琪戴方彦张民胡培蓉傅强余龙范玉新赵寿元
- 关键词：蛋白激酶CDNASTK克隆
- 人类β-1,4-半乳糖苷转移酶Ⅲ基因的分离与克隆
- 1999年
- 以人、牛、鼠、鸡、蜗牛的β-1,4-半乳糖苷转移酶催化区的编码核苷酸序列为探针,在NCBI GenBank EST数据库中进行同源搜寻,获得若干有高度同源的EST.在拼接序列的两端设计引物,以从人胎盘cDNA文库中PCR扩增获得的片段为探针,在人胎盘cDNA分子库中步移获得一个长1,907bp的cDNA片段,包含一个长1,179bp的开放阅读框(ORF,open reading frame),编码393个氨基酸残基。该基因与已知的人类β1,4-GalTI的氨基酸同源性为43.8%,在蛋白质催化区的同源性更高达60.9%。表达谱分析发现该基因在人体16种组织中均有不同程度的表达,转录本大小约为2.4kb.通过该cDNA人/啮齿类杂种细胞株DNA Southern杂交将该基因定位在1号染色体。
- 张民王小柯胡培蓉屠强毕安定余龙赵寿元
- 关键词：半乳糖苷基因分离基因克隆
- 用PCR快速筛选递次截短的DNA克隆
- 1998年
- 目的为了建立一种快速、简便而准确地筛选递次截短的ＤＮＡ克隆的技术，加速对基因全长ｃＤＮＡ或ＤＮＡ大片段的测序和鉴定。方法在载体多克隆位点两侧设计引物，直接ＰＣＲ扩增插入片段，以此为基础选择系列缺失亚克隆，并与常规酶切法作比较。结果根据ＰＣＲ产物大小排序，准确地鉴定出系列缺失亚克隆，并可将ＰＣＲ产物直接用于ＰＣＲ循环测序，比酶切法分辨率高，操作步骤简化，筛选时间短。结果所建立的ＰＣＲ快速筛选法不仅是一种行之有效的鉴定方法，而且可以显著地节省时间和实验材料。该方法也可适用于其它各种质粒载体。
- 胡培蓉余龙张民范玉新王小柯赵寿元
- 关键词：DNA克隆聚合酶链反应
- 用Bubble PCR法对一个新的锌指基因进行外显子划界
- 1997年
- 介绍了一种确定基因外显子一内含子交界点的快速、准确的方法，应用该方法对本室克隆的一个新的锌指基因ZNF191进行了外显子划界。将含有ZNF191全长CDNA的基因组DNA经限制酶酶切后与退火的Bubblelinker连接，以该连接产物为模板，用依据cDNA序列设计的引物和Bubblelinker上的特异引物进行PCR扩增，继以相同的扩增条件对扩增产物进行测序，从而确定了外显子－内含子的交界点。结果确认出ZNF191基因由4个外显子和3个内含子组成，这一结论为后来完成的ZNF191基因的全长测序结果所证实。
- 张民余龙胡培蓉施少林邢郡赵寿元
- 关键词：BUBBLEPCR锌指基因克隆技术
