耿红 作品数:8 被引量:170 H指数:5 供职机构: 南京农业大学园艺学院 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 作物遗传与种质创新国家重点实验室开放课题 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
辣椒属5个栽培种部分种质亲缘关系的RAPD分析 被引量:45 2006年 采用31个10bp随机RAPD引物对辣椒属(Capsicum)5个栽培种31份材料进行PCR扩增,共扩增出276条带,其中多态性带244条,占88.41%。C.annuum多态性位点比例(PPB)和Shannon多样性指数(I)分别为32.97%和0.1599,表明其遗传多态性较低。31份材料两两不同种质间Jaccard相似系数在0.349~0.952之间,平均为0.729。聚类分析结果显示:C.annuum与其它4个栽培种的亲缘关系由近至远分别是C.chinense、C.frutescens、C.pubescens和cbaccatum。对C.annuum24份不同类型材料聚类分析的结果与形态分类不能完全对应,说明我国现行主要基于果实形态的变种分类体系不能准确反映Cannuum种质的遗传差异。本研究还发现中国云南西双版纳C.frutescens种质与美洲C.frutescens种质具有较大的扩增片段差异,为进一步考证我国云南西双版纳地区也是辣椒起源地之一提供了新的证据。 陈学军 陈劲枫 耿红 娄群峰关键词:辣椒属 RAPD 聚类分析 黄瓜全雌性基因连锁的AFLP和SCAR分子标记 黄瓜是重要的蔬菜作物,性型表现多样.黄瓜全雌性品系在简化杂交制种、提高产量等方面均具有重要的作用.与全雌性连锁的分子标记辅助育种将加速全雌品系的获得.本研究以来源于全雌EC1和弱雌CC3杂交的F<,2>性型分离群体为材料... 陈劲枫 娄群峰 陈龙正 耿红 罗向东关键词:黄瓜 分子标记 基因连锁 辅助育种 文献传递 黄瓜全雌性基因连锁的AFLP和SCAR分子标记 被引量:67 2005年 本研究以全雌品种‘戴多星’自交系和弱雌品种‘北京截头’自交系为双亲杂交获得F1,然后得到F2性型分离群体,利用分离群体分组分析法(BulkedSegregantAnalysis,BSA)构建全雌和弱雌两个基因池,筛选了64对AFLP选择性引物EcoRINN+MseINNN组合,发现EcoRITG+MseICAC引物组合在全雌基因池中扩增出一条分子量为234bp的特异带。经F2代单株验证,该特异条带能在全雌单株中稳定出现。以MAPMAKER(Version3.0)软件分析,该标记与全雌性位点的连锁距离在6.7cM。命名该连锁标记为TG/CAC234。将该特异条带回收、克隆、测序,设计特异SCAR引物,再对F2代单株基因组DNA进行扩增,仅在全雌单株中扩增出1条分子量为166bp的特异带,表明已成功地将与黄瓜全雌性连锁的AFLP标记转化为操作简便、表现稳定的SCAR标记,该标记命名为SA166。 娄群峰 陈劲枫 Molly Jahn 陈龙正 耿红 罗向东关键词:黄瓜 全雌性 分子标记 AFLP SCAR 辣椒种质遗传多样性的RAPD和ISSR及其表型数据分析 被引量:62 2007年 用RAPDI、SSR分子标记及28个表型性状数据对辣椒属5个栽培种的13份材料进行了分析,结果表明:23条RAPD引物共扩增出209条带,平均每个引物扩增出9.09条,多态性位点比率为83.73%;16条ISSR引物共扩增出94条带,平均每个引物扩增出5.88条,多态性位点比率为79.79%.与RAPD相比,ISSR标记检测到的有效等位基因数(Ne)及Shannon多样性指数(I)、遗传离散度(Ht)和遗传分化系数(Gst)等遗传多样性参数都较大,多态性位点比例在亲缘关系较近的一年生辣椒(Capsicum annuum)种内较高,说明ISSR有更高的多态性检测效率,并且适合亲缘关系较近的种群间遗传多样性分析.基于RAPDI、SSR的聚类与基于表型数据的聚类之间存在极显著正相关,且都能将C.annuum与其它栽培种区分开来. 陈学军 程志芳 陈劲枫 娄群峰 耿红关键词:辣椒 表型性状 RAPD ISSR 黄瓜育成品种“春玉”RAPD指纹图谱分析 被引量:5 2005年 从300条随机引物中筛选出能稳定扩增的26个引物,对黄瓜育成品种"春玉"等21个实验材料进行扩增,在扩增出的173条谱带中,多态性带有80条,比例为46.24%。"春玉"在用引物E13扩增时有特异缺失条带,大小为400bp,可作为特征性指纹图谱,为其产权保护提供分子依据。利用各材料的DNA指纹可将不同参试材料鉴别出来。同时利用MEGA软件进行UPGMA聚类分析,将参试材料在相似系数0.706处分为4个组群。 耿红 娄群峰 余纪柱 陈劲枫关键词:黄瓜 RAPD DNA指纹 甜瓜属人工异源四倍体早期基因组变化的初步研究 被引量:5 2005年 利用AFLP技术对甜瓜属人工异源四倍体(Cucum is×hytivusChen and K irkbride,2n=38)不同自交世代及二倍体亲本DNA进行分析,结果表明多倍体基因组在形成早期发生了广泛的变化,变化位点所占比例高达22.2%。基因组序列变化始于F1代,最高变化率出现在S2代。基因组变化主要表现为部分亲本片段丢失、新片段产生以及后代对亲本某些位点的跳跃式继承。还观察到部分双亲差异性条带呈现出偏父性遗传的特点。 陈龙正 娄群峰 Joseph N.Wolukau 陈劲枫 耿红 罗向东关键词:甜瓜属 AFLP分析 黄瓜全雌性基因连锁的AFLP和SCAR分子标记 黄瓜是重要的蔬菜作物,性型表现多样。黄瓜全雌性品系在简化杂交制种、提高产量等方面均具有重要的作用。与全雌性连锁的分子标记辅助育种将加速全雌品系的获得。本研究以来源于全雌EC1和弱雌CC3杂交的F2性型分离群体为材料,利用... 陈劲枫 娄群峰 陈龙正 耿红 罗向东关键词:黄瓜 全雌性 分子标记 AFLP SCAR 文献传递 黄瓜(Cucumis sativus L.)品种DNA指纹图谱的构建与分析 本文基于RAPD和AFLP技术,开展了设施专用黄瓜新品种‘春玉’和‘沪2’的指纹图谱构建与分析研究,筛选出‘春玉’的RAPD和AFLP特异性条带及‘沪2’AFLP特异带,为新品种专利保护提供了分子证据。同时,采用RAPD... 耿红关键词:黄瓜 指纹图谱 RAPD ISSR AFLP 文献传递