孙燕
- 作品数：10 被引量：102H指数：5
- 供职机构：上海市儿童医院更多>>
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- 上海单中心急性胃肠炎患儿感染诺如病毒的基因特征分析被引量：5
- 2020年
- 目的了解上海地区急性胃肠炎患儿感染诺如病毒(norovirus,NoV)的基因特征情况。方法收集2018年10月至2019年9月上海市儿童医院门急诊急性胃肠炎患儿的粪便标本709份,采用实时荧光RT-PCR方法对NoV进行初筛,使用普通RT-PCR方法,分别用VP1、RdRp区和跨RdRp-VP1区引物对部分NoV阳性标本进行分型鉴定。应用SPSS20.0统计学软件进行数据处理,并使用生物信息学软件对NoV基因序列进行同源性、系统进化及重组性分析。结果经实时荧光RT-PCR检测,709份粪便标本中NoV阳性的标本为265份,阳性率为37.4%(265/709)。基于NoV RdRp和VP1区的测序分析,NoV阳性标本中共检出7种不同的基因型,分别为GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.P12-GⅡ.3、GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012、GⅡ.P7-GⅡ.6、GⅡ.P8-GⅡ.8、GⅡ.P21-GⅡ.13和GⅡ.P17-GⅡ.17型,其中以GⅡ.P16-GⅡ.2型所占比例最高,为30.6%(34/111),其次为GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012型(27.0%,30/111)和GⅡ.P12-GⅡ.3型(24.3%,27/111)。本研究发现2株新的NoV重组株GⅡ.P21-GⅡ.13,其重组位点位于ORF1/ORF2的交接区。NoV在每个月份皆有流行,但每个月份的主导基因型不尽相同。男女患儿的NoV阳性检出率差异无统计学意义(P=0.329),而不同年龄组患儿的NoV阳性检出率差异有统计学意义(P=0.011),以>11~12岁和>2~3岁年龄组所占比例最高。结论2018年10月至2019年9月,上海地区以GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012和GⅡ.P12-GⅡ.3 NoV重组株流行为主,并发现2株新的NoV重组株GⅡ.P21-GⅡ.13散在流行。跨ORF1/ORF2的基因序列测定,有助于更好地了解NoV的基因分型和重组情况。
- 于方圆孟磊俊潘芬马展王春孙燕周颖张泓
- 关键词：诺如病毒急性胃肠炎基因型儿童
- 儿童患者中分离的铜绿假单胞菌耐药性分析被引量：2
- 2009年
- 目的了解儿童患者临床分离的铜绿假单胞菌的耐药情况。方法用纸片扩散法对12种抗菌药物进行药物敏感试验。用WHONET5.3软件分析耐药情况。结果本研究获得的590株铜绿假单胞菌主要分离自下呼吸道标本365株(69.1%)。铜绿假单胞菌对环丙沙星的耐药率最低为0.7%;除阿米卡星(2.1%)、庆大霉素(4.9%)、头孢吡肟(5.2%)外,铜绿假单胞菌对其他所测抗菌药物的耐药率都在20%以上,且增高明显(P<0.01)。ICU分离到铜绿假单胞菌的耐药情况要比其他病区严重。多重耐药铜绿假单胞菌的检出率由13.3%增加到26.9%。结论儿童临床分离的铜绿假单胞菌对抗菌药物的耐药有增高趋势,多重耐药铜绿假单胞菌增加。应合理使用抗生素,控制和降低细菌耐药性的产生。
- 李万华张泓孔菁王春孙燕
- 关键词：儿童铜绿假单胞菌多重耐药
- 儿童肠道感染病原菌分布及耐药性分析被引量：11
- 2014年
- 目的了解儿童腹泻的肠道病原菌分布、流行病学特征及耐药情况,指导临床合理应用抗菌药物。方法收集上海市儿童医院2008—2013年门诊和住院腹泻患儿的粪便标本中分离到的肠道病原菌;采用纸片扩散法对沙门菌属及志贺菌属进行6种抗菌药物的药敏试验。结果 5年期间共收集到肠道病原菌545株,其中沙门菌属为67.2%,其次为志贺菌属20.7%,金葡菌4.6%,空肠弯曲菌3.7%,气单胞菌属2.4%,致病性大肠埃希菌0.9%。患儿以男性稍多(56.3%),婴幼儿期(2岁以下)患儿占72.7%;夏、秋季为好发季节(72.9%)。志贺菌属对氨苄西林及甲氧苄啶-磺胺甲(口恶)唑耐药率均高于沙门菌属(P<0.05);福氏志贺菌对舒巴坦-氨苄西林、头孢曲松、环丙沙星、氯霉素的耐药率均显著高于宋内志贺菌(P<0.001)。68.3%的志贺菌属存在多重耐药现象,明显高于沙门菌的44.7%(P<0.001)。结论该院儿童腹泻的肠道感染病原菌种类多样,以沙门菌属和志贺菌属为主,具有性别、年龄、季节与地区分布的流行特征,耐药情况较为严重,不同菌属、菌种之间差异较大,应加强对病原菌及其耐药性监测,为控制儿童腹泻提供参考。
- 潘芬孔菁王春许学斌秦惠宏孙燕张泓
- 关键词：腹泻肠道病原菌耐药性多重耐药
- 巢式多重聚合酶链反应快速诊断儿童脑膜炎/脑炎
- 2023年
- 目的探讨巢式多重聚合酶链反应(PCR)在儿童脑膜炎/脑炎诊断中的价值。方法采用回顾性病例对照研究。收集2017年5月—2020年5月上海市儿童医院82例确诊或疑似中枢神经系统感染患儿的脑脊液样本。收集患儿临床资料,了解患儿抗菌药物使用情况。采用巢式多重PCR检测病原体,并同步进行细菌培养、脑脊液常规和生化检测。结果82例脑脊液样本中,有31例检出病原体,其中20例检出病毒、11例检出细菌。细菌组脑脊液样本白细胞计数、蛋白、乳酸脱氢酶和患者抗菌药物使用天数、住院天数均显著高于病毒组(P<0.05);葡萄糖水平低于病毒组(P<0.05);阿昔洛韦使用例数少于病毒组(P<0.05)。巢式多重PCR与培养法判断细菌性脑膜炎/脑炎的一致性较好(Kappa=0.659,P<0.001),与实验室指标判断病毒性脑膜炎/脑炎的一致性亦较好(Kappa=0.737,P<0.001)。结论巢式多重PCR可以作为辅助诊断中枢神经系统感染患儿脑脊液样本病原体感染的新方法,可提高儿童脑膜炎/脑炎的诊断效率。
- 石迎迎潘芬孙燕王春蒋婕于方圆张天栋秦惠宏张泓
- 关键词：儿童脑膜炎脑炎
- 儿童感染葡萄球菌的耐药性及红霉素和克林霉素的耐药表型
- 目的:了解儿童感染的葡萄球菌对抗生素的耐药情况及对红霉素和克林霉素的耐药表型。方法:用 Kirby-Bauer法测定葡萄球菌对13种抗生素的敏感试验,用红霉素和克林霉素双纸片协同法(D-试验)测定其耐药表型。结果:在23...
- 李万华张泓孔菁王春孙燕
- 文献传递
- 葡萄球菌属对抗菌药物的耐药性分析被引量：4
- 2006年
- 目的了解葡萄球菌属临床分离株的耐药性及对大环内酯类、林可霉素类及链阳霉素类(MLS)的耐药表型。方法用Kirby—Bauer法测定葡萄球菌属对14种抗菌药的敏感性,进行D试验测定MLS耐药表型。结果在230株葡萄球菌属中,耐甲氧西林金葡菌(MRSA)和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRSCN)分别为9．9％和79．8％。对青霉素都呈现高度耐药。未发现万古霉素及替考拉宁耐药菌株,126株葡萄球菌属对红霉素耐药,54．8％(23／42)株金葡菌为结构型耐药;在凝固酶阴性葡萄球菌中(CNS),44．0％(37／84)为结构型耐药,41．7％(35／84)为外排型耐药。对红霉素耐药但对克林霉素敏感的葡萄球菌中,17株为诱导型克林霉素耐药。结论应加强对葡萄球菌的耐药性监测,临床微生物实验室应进行D-试验。指导临床合理使用抗生素。
- 李万华张泓孔菁王春孙燕
- 关键词：葡萄球菌耐药性红霉素克林霉素
- 2011-2016年上海市儿童医院临床分离细菌耐药性监测被引量：9
- 2019年
- 目的了解上海市儿童医院临床分离菌种类、分布及对常用抗菌药物的耐药性变化。方法采用纸片扩散法进行药敏试验,按照CLSI 2016年标准判读结果,WHONET 5.6软件进行数据分析。结果 2011-2016年共收集非重复菌株23259株,革兰阳性菌10885株(46.8%),革兰阴性菌12374株(53.2%)。甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌(MRSA)和凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS)分别占各自菌种的35.8%和82.2%,其中MRSA的检出率由2011年27.4%上升至2016年42.9%。MRSA和MRCNS对绝大多数测试药物的耐药率均显著高于MSSA和MSCNS。肠球菌属中,屎肠球菌对所测试抗菌药物的耐药率显著高于粪肠球菌。非脑膜炎肺炎链球菌中青霉素不敏感肺炎链球菌(PNSP)908株,占31.2%。未发现对万古霉素和利奈唑胺耐药的革兰阳性菌株。革兰阴性菌对碳青霉烯类的耐药率显著上升,其中肺炎克雷伯菌对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别由2011年的3.1%和4.8%上升至2016年的28.7%和37.4%;铜绿假单胞菌对上述两药的耐药率分别由2011年的13.8%和16.5%上升至2016年的18.8%和19.4%;鲍曼不动杆菌则分别由38.3%和39.9%上升至68.4%和69.7%。结论监测期间儿童患者分离到的MRSA、碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌、广泛耐药鲍曼不动杆菌检出率仍处于较高水平,对临床抗感染治疗构成严重威胁,需重视儿童临床耐药监测。
- 王春姚剑杰孙燕秦惠宏潘芬石迎迎张泓葛青玮
- 关键词：细菌耐药性监测药物敏感性试验广泛耐药
- 金黄色葡萄球菌致儿童皮肤软组织感染90例病原菌耐药性和分子分型被引量：3
- 2022年
- 目的分析金黄色葡萄球菌(金葡菌)所致儿童皮肤软组织感染的临床特征、耐药性、毒力基因及分子分型,以了解上海交通大学附属儿童医院皮肤软组织感染患儿金葡菌的分子流行病学特征。方法收集2020年全年该院临床皮肤软组织感染患儿90例临床信息以及分离的90株金葡菌,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,应用PCR技术检测金葡菌的杀白细胞毒素pvl等15种毒力基因,并进行多位点序列分型(MLST)、葡萄球菌蛋白A(SPA)分型以及耐甲氧西林金葡菌(MRSA)菌株的葡萄球菌盒式染色体(SCCmec)分型。结果90株金葡菌中44株MRSA对青霉素的耐药率为100%;未发现对利福平、利奈唑胺、万古霉素、米诺环素及替加环素耐药菌株。儿童皮肤软组织感染分离金葡菌中肠毒素基因以sei的检出率最高(66.7%),杀白细胞毒素pvl亦有较高检出率(58.9%),黏附毒素基因icaA及clfA基因和溶血素基因hla的检出率均为100%。ST15-t437-SCCmec IV、ST22-t437-SCCmec IV、ST22-t437-SCCmec V、ST22-t309-SCCmecV是MRSA分离株最常见的流行分型(9.1%);ST22-t309(15.2%)和ST59-t309(15.2%)是MSSA分离株最常见的流行分型。结论儿童皮肤软组织感染MRSA组菌株毒力基因携带率与耐药率均普遍高于甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)组。ST22-t309、ST22-t437、ST59-t309为金葡菌最常见的流行分型。
- 石迎迎潘芬杜青青王春蒋婕于方圆余绍兵孙燕秦惠宏张泓
- 关键词：金黄色葡萄球菌儿童皮肤软组织感染耐药分子分型
- 2005-2014年CHINET流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌耐药性监测被引量：51
- 2016年
- 目的了解2005—2014年国内不同地区临床分离流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌的耐药性变迁。方法收集17所综合性医院和2所儿童医院临床分离的7 983株流感嗜血杆菌和1 713株卡他莫拉菌,采用纸片扩散法或自动化仪器法按统一方案进行药敏试验,依照CLSI 2014版标准判断结果。头孢硝噻吩纸片法测定β内酰胺酶。结果 10年间,流感嗜血杆菌的检出率呈上升趋势：2005年为0.69%,2014年上升至1.57%;10年间,卡他莫拉菌的检出率呈上升趋势：2005年为0.03%,2014年上升至0.41%。7 983株流感嗜血杆菌对甲氧苄啶-磺胺甲唑耐药率最高且上升趋势最明显,由2005年的44.4%上升至2014年的64.6%;对氨苄西林、氨苄西林-舒巴坦和阿奇霉素耐药率呈上升趋势,分别由2005年的20.6%、11.8%和2.2%上升至2014年的41.8%、24.8%和14.2%;对头孢噻肟、环丙沙星和氯霉素耐药率近年有下降趋势;对阿莫西林-克拉维酸和头孢呋辛耐药率虽略有上升趋势,但仍低于25%。儿童分离株对氨苄西林的耐药率和产酶率（36.7%、33.8%）均高于成人分离株（25.7%、22.5%）,对环丙沙星的耐药率（4.7%）低于成人分离株（15.8%）,耐药率差异均有统计学意义（P〈0.05）。β内酰胺酶总检出率为29.9%。383株为β内酰胺酶阴性氨苄西林耐药株（BLNAR）。1 713株卡他莫拉菌对第二和第三代头孢菌素、阿莫西林-克拉维酸、左氧氟沙星和甲氧苄啶-磺胺甲唑均高度敏感（敏感率为80%-100%）,耐药率变化较小,但对阿奇霉素的耐药率较高且呈上升趋势,由2006年的41.2%增至2013年的57.8%。该菌产β内酰胺酶的检出率为93.3%。结论流感嗜血杆菌对头孢菌素类、阿莫西林-克拉维酸、阿奇霉素、氯霉素及环丙沙星耐药率较低,可作为临床的首选用药,而对甲氧苄啶-磺胺甲唑耐药率已上升至60%左右,不适于临床用药。卡他莫拉菌对所测试药物耐药率变化较小。
- 孙燕孔菁张泓王传清王爱敏徐英春张小江卓超苏丹虹胡云建艾效曼孙自镛陈中举谢轶康梅魏莲花吴玲单斌杜艳俞云松林洁徐元宏沈继录韩艳秋郭素芳杨青贾蓓黄文祥倪语星孙景勇张朝霞季萍褚云卓田素飞
- 关键词：流感嗜血杆菌卡他莫拉菌Β内酰胺酶耐药性
- 儿童患者中分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌分子流行病学分析及耐药机制研究被引量：17
- 2016年
- 目的研究儿童患者中分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的流行特征及耐药机制。方法收集2013年1-12月上海市儿童医院临床微生物室分离的12株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌,采用琼脂稀释法检测其对常用抗菌药物的耐药性,乙二胺四乙酸(EDTA)协同试验和3'-氨基苯硼酸(APB)协同试验进行碳青霉烯酶表型分析,PCR扩增及DNA测序进行碳青霉烯酶基因型确证,接合试验检测碳青霉烯酶耐药基因是否位于质粒上,脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)检测菌株间基因相关性。结果 12株CRKP对多黏菌素E均敏感,对头孢菌素类耐药率均为100%,对亚胺培南、美罗培南和厄他培南耐药率分别为91.7%、91.7%和100%。PCR及DNA测序显示12株CRKP中8株产KPC-2,1株产NDM-1,3株未检出碳青霉烯酶。将12株CRKP与大肠埃希菌J53进行接合,获得3株接合子。PFGE分型显示,12株CRKP可分为4个型3个亚型。MLST结果显示,8株blaKPC阳性肺炎克雷伯菌均为ST11型,1株blaNDM-1阳性肺炎克雷伯菌为ST278,3株不产碳青霉烯酶菌分别为ST76、ST37、ST610。结论产KPC-2型碳青霉烯酶是该院分离的肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要机制,产NDM-1阳性的肺炎克雷伯菌已在该院出现。
- 祝俊英王春孙燕胡付品张泓
- 关键词：儿童碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌
