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张名: 作品数：43 被引量：52H指数：3; 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所更多>>; 发文基金：云南省科技计划项目国家科技重大专项云南省科技创新强省计划项目更多>>; 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>

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2016年云南省埃可病毒7型分离株K1641/YN/CHN/2016全基因组序列分析: 2022年; 目的对2016年云南省埃可病毒7型(echovirus 7,E-7)的分离株K1641/YN/CHN/2016(简称K1641)进行全基因组序列测定并分析其分子变异和遗传进化特性。方法利用KMB17细胞分离病毒,提取病毒RNA,进行RT-PCR,并测序拼接获得全基因组序列。利用Mega 5、Geneious Basic 5.4.1和SimPlot 3.5.1等软件分析全基因组序列。结果获得的K1641株全基因组序列长度为7 428 bp,编码含2 193个氨基酸的多聚蛋白。K1641全基因组核苷酸和氨基酸同源性与中国分离株40/Longyou/ZJ最为同源,分别为95.9%和98.9%;而与其他中国E-7流行株VP1的核苷酸和氨基酸同源性分别为95.1%~99.7%和82.5%~99.3%;与原型株VP1的核苷酸和氨基酸同源性为78.4%和93.1%。K1641与其他E-7毒株的各区段核苷酸一致性和氨基酸同源性分别为73.5%~97.3%和85.3%~100.0%,K1641与40/Longyou/ZJ的各区段核苷酸一致性和氨基酸同源性均超过90.0%,并且,氨基酸的同源性要高于核苷酸一致性。基于E-7全长VP1序列的种系进化分析,可分为8个簇,本次分离株K1641与2013中国分离株40/Longyou/ZJ关系较近,属于进化树上的一个分支。进行相似性分析,在位置350~600,与E-6/RO-24-9-79(LS451294)显示出99%的高相似性;其他位置与中国分离株40/Longyou/ZJ有较高(>92%)的相似性。结论 K1641分离株为E-7,与E-6/RO-24-9-79株可能存在重组事件发生,对E-7遗传特性研究具有参考意义。; 张名许丹菡冯昌增郭伟王晓辉何陆涛马绍辉; 关键词：全基因组种系发生

乙型脑炎Vero细胞灭活疫苗毒株的遗传稳定性被引量：2: 2014年; 目的研究流行性乙型脑炎Vero细胞灭活疫苗毒种（P3毒株）在生产过程中的遗传稳定性,为疫苗的安全性和免疫原性评价提供依据.方法检测P3毒株鼠脑传代一代毒株、主种子、工作种子、疫苗及疫苗续传5代后病毒E蛋白基因核苷酸及氨基酸序列,并与GenBank中乙脑病毒P3株（AF036919）进行比对分析,同时比较主种子、工作种子、疫苗及疫苗续传5代后毒株的病毒滴度、抗原含量及效价.结果以上5代次病毒的E蛋白基因核苷酸及蛋白质序列完全相同,同源性均为100％,与GenBank中乙脑病毒P3株（AF036919）比较显示：核苷酸序列中第E9、E10、E324、E330、E1223、E1338基因位点存在差异,同源性为99.73％,其中只有E1223突变引起相应氨基酸aE408突变（L→S）,同源性为99.80％,但该位点为非毒力相关位点,而其他位点均为沉默突变.4个代次疫苗毒株病毒滴度均≥8.0 lgLD50/ml,且各代次抗原含量及效价较为相似.结论在生产乙型脑炎灭活疫苗（P3株）过程中建立的以Vero细胞为基质的乙脑毒种库具有良好的遗传稳定性.; 张海燕曹晗王俊荣张名梁疆莉马艳顾琴杨卉娟孙明波

不同材质细胞培养容器培养甲型肝炎病毒的比较被引量：2: 2015年; 目的比较中性玻璃转瓶和聚苯乙烯细胞工厂两种材质的培养容器培养人二倍体细胞和甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)的差异。方法采用相同的培养条件,在中性玻璃转瓶和聚苯乙烯细胞工厂中分别培养人胚肺二倍体细胞KMB17,并接种HAV H2株,倒置光学显微镜下观察细胞的形态变化;细胞接种病毒后第0、7、14、18、22、26、30天时取样,ELISA法测定病毒的感染性滴度,分析病毒的增殖动力学。结果两种材质的容器培养的KMB17细胞的生长状态和形态无明显差异;HAV H2株增殖动力学相似;单位体积病毒收获液中的病毒产量无显著差异;聚苯乙烯细胞工厂培养的HAV的单位培养容积产量是中性玻璃转瓶的7.28倍。结论聚苯乙烯细胞工厂和中性玻璃转瓶培养的人二倍体细胞和HAV均能良好生长,细胞工厂可替代转瓶成为新的疫苗规模化生产的细胞培养技术。; 邵聪文杨晓蕾梁海孝曹洁张名杨建波冯昌增郑惠文陈梦娇俞建昆杨净思; 关键词：甲型肝炎病毒人二倍体细胞转瓶细胞工厂

2022年云南省柯萨奇B组5型病毒全基因组分析: 2024年; 目的分析2022年云南省4株柯萨奇B组5型病毒(CVB5)分离株的全基因组特征。方法设计CVB5全基因组扩增及测序引物,分段扩增CVB5分离株的全基因组,采用“引物移步法”测序,并进行序列拼接和组装。采用MEGA 7.0、Simplot 3.5.1和DNAStar 7.1等软件对CVB5毒株的全基因组序列进行遗传特征分析。结果基于VP1和全基因组系统进化分析发现,4株CVB5分离株均为C基因型。与原型株相比,4株毒株VP1区均发生多处氨基酸变异。P1、P2、P3系统进化分析和simplot重组分析显示,CVB5分离株可能与多种肠道病毒B群毒株发生重组。结论2022年云南省昆明地区手足口病(HFMD)患者临床样本中分离到的4株CVB5均属于C基因型。; 楚昭阳陈俊薇冯昌增刘煜菡张名李丽马绍辉; 关键词：全基因组

一种柯萨奇病毒B组5型毒株及应用: 本发明提供一种柯萨奇病毒B组5型毒株及其应用。该毒株命名为柯萨奇病毒B组5型KM299‑L05株，于2024年2月1日保藏于中国典型培养物保藏中心，保藏编号为CCTCC NO：V202411，保藏地址为中国.武汉.武汉大...; 马绍辉张名刘煜菡冯昌增陈俊薇王晓辉杨昭庆和占龙叶尤松孙浩

一株柯萨奇病毒A组4型云南株的全基因组分析: 2024年; 目的了解中国云南2022年分离到的一株柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)病毒株的全基因组序列特征,探讨CVA4系统发育特征。方法对CVA4分离株194R3/YN/CHN/2022进行全基因组序列扩增测序,并应用Mega 7.0、Geneious 9.1.4及Simplot 3.5.1等软件拼接比对,构建CVA4分离株系统进化树,分析其全基因组序列特征。结果194R3/YN/CHN/2022分离株为CVA4,属于C2基因亚型,与我国近年的优势基因亚型一致。重组分析显示,在P2、P3非结构编码区,CVA4病毒分离株可能与EVA114原型株V13-0285、CVA16原型株G-10、CVA14原型株G-14发生过重组。结论云南分离的194R3/YN/CHN/2022属于CVA4中国流行的C2基因亚型,但发生了一定变异。; 陈俊薇冯昌增楚昭阳刘煜菡张名李丽马绍辉; 关键词：全基因组序列系统进化分析

一株2013年云南省Ⅲ型疫苗相关脊髓灰质炎病毒全基因组分析被引量：3: 2019年; 目的分析一株疫苗相关脊髓灰质炎病毒(vaccine-related poliovirus,VRPV)云南分离株R1351/YN/CHN/2013的全基因组序列和遗传特性。方法采用RD细胞分离获得病毒,提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增全基因组序列并测序。利用BioEdit 7.09、MEGA7.0、SimPlot3.5.1等软件对全基因序列进行分析。结果 R1351/YN/CHN/2013全基因序列由7 430个核苷酸构成,编码含2 206个氨基酸残基的多聚蛋白,5′UTR和3′UTR核苷酸长分别为742 nt和70 nt;与Sabin3疫苗株全基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为99.7%和99.6%;在5′UTR的减毒位点(nt472)发生回复突变,在VP3减毒位点(nt2034)未发生改变;与Sabin3疫苗株的VP1序列比对,共发生3个碱基突变,变异率为0.33%。进化分析显示73株Ⅲ型脊髓灰质炎病毒株分为A、B和C三个分支,R1351/YN/CHN/2013属于C分支,Sabin1/2疫苗株独立形成两个分支。重组分析表明R1351/YN/CHN/2013基因组各区域并未与Sabin1/2疫苗株及其他肠道病毒发生重组。结论 R1351/YN/CHN/2013为Ⅲ型VRPV,并且在减毒位点nt472处发生了回复突变。; 刘红波张捷赵义林张海浩张名黄小琴孙浩杨昭庆马绍辉; 关键词：进化分析

云南省3株柯萨奇A组16型病毒全基因组序列分析被引量：3: 2022年; 目的分析柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分离株全基因组特征。方法使用人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma,RD)、非洲绿猴肾细胞(Vero)和人胚肺二倍体细胞(human embryonic lung diploid fibroblasts,KMB17)从2019年云南手足口病患者粪便标本中分离CV-A16毒株。采用RT-PCR扩增其全基因组,测序并通过生物信息学方法对其全基因序列、系统进化和基因重组进行分析。结果共分离到3株CV-A16毒株,均为Vero细胞分离株。VP1系统进化分析表明,K106/YN/CHN/2019和K39/YN/CHN/2019属于B1基因亚型的B1b分支,K23/YN/CHN/2019属于B1基因亚型的B1a分支。在全基因组核苷酸序列上,K106/YN/CHN/2019和K39/YN/CHN/2019与中国CV-A16分离株相似性高,K23/YN/CHN/2019与国外CV-A16分离株相似性较高,其中,与澳大利亚分离株C138/CHW/AUS/2016之间的核苷酸相似性为97.6%。基于P1、P2和P3的系统进化、全基因组同源性和重组分析结果显示CV-A16在5'-UTR及P2、P3区可能与肠道病毒A组多个其他血清型病毒发生过型间重组事件。结论2019年从云南省手足口病患者粪便标本中分离到3株CV-A16,均为中国大陆流行基因型,为CV-A16的分子流行病学研究提供了理论基础。; 冯昌增刘昕蓓张名许丹菡徐炽何云龙马绍辉; 关键词：柯萨奇病毒A组16型全基因组序列

RD、KMB-17及Vero细胞对肠道病毒分离培养敏感性的比较: 2024年; 目的比较人横纹肌肉瘤细胞RD、人胚肺二倍体细胞KMB-17和非洲绿猴肾细胞Vero对肠道病毒(enterovirus,EV)分离培养的敏感性,以期为后续EV各基因型毒株的分离提供实验依据。方法收集2019年昆明市某医院确诊手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)患者粪便样本60份,分别采用RD、KMB-17和Vero细胞分离培养EV,并对阳性样本进行RT-PCR检测、测序及NCBI BLAST比对,鉴定EV基因型。结果共分离获得112株EV,分别属于11种基因型。其中RD细胞分离出26株Echo-11,6株Echo-6和Echo-30,2株CV-A4和CV-A10,1株CV-A6、CV-A16和Echo-18;KMB-17细胞分离出42株Echo-11,3株Echo-6和2株Echo-30;Vero细胞分离出6株CV-B1,5株CV-B3,4株Echo-11,3株CV-A16和1株CV-B2。结论RD细胞对大部分EV均敏感,KMB-17和Vero细胞分别对Echo和CV-B最敏感。; 刘煜菡张名许丹菡郭伟冯昌增徐丽兰马绍辉; 关键词：肠道病毒细胞敏感性 VERO细胞 RD细胞

一种CV-A6病毒毒种及其人用灭活疫苗: 本发明公开一种CV‑A6病毒毒种及其人用灭活疫苗；毒种的分类命名为柯萨奇病毒A组6型，保藏编号为CGMCC No.16217，所制成的人用CV‑A6灭活疫苗的组成为：CV‑A6灭活纯化抗原100μg/ml，氢氧化铝1mg...; 马绍辉刘红波张名张捷赵义林张海浩杨昭庆黄小琴; 文献传递

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