赵冬 作品数:35 被引量:203 H指数:6 供职机构: 石家庄市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 河北省自然科学基金 石家庄市科学技术研究与发展计划 河北省医学科学研究重点课题 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 轻工技术与工程 更多>>
2009-2016年石家庄市甲型H1N1流感病毒血凝素基因特征分析 被引量:4 2018年 目的分析石家庄市2009-2016年甲型H1N1流感病毒分离株血凝素蛋白(HA)的基因特征,了解其变异情况。方法选取石家庄市2009-2016年甲型H1N1流感病毒分离株71株,PCR扩增HA基因并测序;利用生物信息学软件对分离株的HA基因进行进化和变异分析,并与北半球疫苗株A/California/07/2009进行对比;采用MEGA(5.05)软件NJ法构建进化树,进行系统进化分析。结果石家庄市71株分离株与疫苗株A/California/07/2009的HA基因核苷酸同源性为96.86%~99.57%,氨基酸同源性为96.77%~99.11%,株间核苷酸同源性为96.30%-100.00%,氨基酸同源性为96.95%-100.00%;进化树分为2支,部分2013年分离株及2014年和2016年分离株与疫苗株发生偏离;与A/California/07/2009相比,分离株HA蛋白有7处抗原位点和4个受体结合位点发生变异,NetNGlyc1.0预测8个糖基化位点均未发生缺失,2016年的4个分离株在162位新增一个糖基化位点。结论石家庄市甲型H1N1流感病毒分离株HA基因与疫苗株同源性逐年降低,氨基酸变异逐年增多,虽显示低致病性特征,但仍需继续对其加强监测。 赵冬 史艳 刘维华 李秀娟 田会方 高伟利关键词:甲型H1N1流感病毒 血凝素 基因特征 基于全自动毛细管电泳技术建立的单核细胞增生李斯特氏菌MLVA分型方法 被引量:1 2015年 目的建立针对食品来源的单核细胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes,Lm)分离株的多位点串联重复序列分型(Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis,MLVA)方法,为暴发确认和溯源检测提供实验室支持。方法对2005—2014年间分离自食品的91株Lm进行14个可变数目串联重复序列(Variable Number of Tandem Repeats,VNTR)位点的检测,评估最优检测位点组合并分析检测结果。结果通过采用软件分析,由LMV1、LMV2、LMV7、Lm10、Lm11、Lm23、LM-TR6、TR3和Lm15等9个VNTR位点组成的位点组合为最优MLVA检测位点,可以将91株Lm分离株分为70个型别,分型能力达到0.987 1。结论本研究建立的基于全自动毛细管电泳的由9个检测位点组成的Lm的MLVA分型方法,具有操作简便、快速、结果客观、操作标准化、易于在不同实验室间比较的优势,可作为一线检测方法用于李斯特菌病的暴发确认和溯源检测。 李秀娟 崔玲玲 赵冬 潘琢 高伟利关键词:单核细胞增生李斯特氏菌 毛细管电泳 食品和环境阪崎肠杆菌分离株的多位点序列分型研究 被引量:6 2010年 目的:阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii)是肠杆菌科肠杆菌属一种革兰阴性菌,是一种条件致病菌,可通过污染婴幼儿配方食品导致严重的婴儿(特别是新生儿)的脑膜炎、坏死性小肠结肠炎和菌血症。对其进行分型研究对阪崎肠杆菌所致疾病的流行病学调查、跟踪和阻断传播途径具有重要的意义。方法:本研究选择7个管家基因atpD、fusA、glnS、gltB、gyrB、infB和pps作为目的基因,对分离自石家庄市售配方米粉、奶粉、婴幼儿食品和环境中分离到的19株阪崎肠杆菌和1株标准株ATCC51329进行了MLST分型检测。结果:20株阪崎肠杆菌可分为12个序列型,分辨率达0.9263,发现9个新ST型。结论:MLST作为阪崎肠杆菌的分型方法,结果准确,分辨率高,对研究该菌的进化趋势和溯源具有重要意义。 赵冬 李秀娟 田会方 徐保红关键词:阪崎肠杆菌 多位点序列分型 石家庄地区H3N2亚型流感病毒神经氨酸酶基因变异分析 被引量:4 2014年 目的了解2006年-2013年石家庄地区H3N2亚型流感病毒神经氨酸酶(NA)基因特征及进化变异情况。方法随机选择2006年-2013年流感监测中分离到的H3N2亚型毒株83株,提取流感病毒RNA,逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增NA基因后进行核苷酸序列测定。测序结果与WHO全球流感疫苗株序列进行同源对比,并采用MEGA 5.05构建进化树。结果石家庄地区2006年-2013年H3N2亚型流感病毒NA区核苷酸长度均为1407 bp,编码469个氨基酸,核苷酸的同源性为96.5%-100.0%。与疫苗株相比,酶活性位点与二硫键位点均比较保守,而糖基化位点、抗原决定簇位点均发生了不同程度的变异。结论石家庄地区2006年-2013年毒株NA发生了较大的变异,除2012年-2013年外,其余年份的疫苗株均滞后于石家庄地区流行株。 赵冬 李秀娟 史艳 徐保红关键词:流感病毒 H3N2亚型 神经氨酸酶 胶体金标记技术检测麻疹抗体方法的建立 2013年 目的利用原核基因表达的麻疹H蛋白,结合胶体金微粒,制备检测麻疹IgG抗体的胶体金层析试纸条。方法利用抗IgG抗体结合IgG抗体-麻疹H蛋白-金微粒的原理,优化条件,确定最佳标记蛋白pH值及蛋白量等,制备胶体金试纸条,并进行样本检测。结果根据自身表达蛋白的特点及浓度,标记的金微粒pH值为9.0,蛋白量为24μg/ml。79份样品中,阳性符合率为94.2%,阳性检出率组间比较差异无统计学意义。结论该试纸条测定麻疹IgG抗体表现了良好的符合率,可以考虑用于条件比较差的县区麻疹IgG的监测,简便快速,有良好的经济效益。 刘维华 张双宅 徐保红 赵冬 张弘关键词:麻疹 胶体金技术 基因克隆表达 石家庄市2006年-2008年食源性疾病监测中沙门菌的耐药性分析 被引量:4 2010年 目的:了解石家庄市2006年-2008年食源性疾病监测中检出的沙门菌的耐药水平。方法:采用WHO推荐的K-B法(纸片扩散法)测定沙门菌的耐药性。结果:15株沙门菌至少对3种抗生素耐药,有4株菌对五种抗生素耐药,有1株菌对17种抗生素耐药,有1株菌的耐药种类达到21种。结论:该地区沙门菌的耐药性较高,应限制抗生素在食源性动物饲养过程中的应用,保障食品安全。 李丽婕 李秀娟 赵冬关键词:食源性疾病 沙门菌 耐药性 嗜肺军团菌SBT、PFGE、AFLP分子分型方法的比较 被引量:4 2014年 比较SBT、PFGE、AFLP三种分子分型方法在嗜肺军团菌分型研究中的分辨力,探讨SBT方法在嗜肺军团菌分型中的可应用性。收集石家庄市6所医院冷却塔水中分离的32株嗜肺军团菌,对其中的24株血清I型嗜肺军团菌进行SBT分型研究,并与PFGE和AFLP分型结果进行了比较。24株LP1型嗜肺军团菌共分为4个ST型,分辨系数为0.239 1。PFGE方法将32株菌株共分为15个PFGE型,分辨系数为0.925 4。AFLP方法将32株菌株分为23个AFLP型,分辨系数为0.973 7。通过比对EWGLI网站SBT数据库,ST1021型和ST345型为本地区独特型别且属于同一克隆系;ST1型为优势型别并在我国长期流行;由于缺失neuA而未分型的嗜肺军团菌株与其他23株菌分属于不同的克隆系。SBT方法的分型能力不及PFGE方法和AFLP方法。但SBT分型方法能够通过全球比对数据库得到更多的关于菌株遗传进化和流行分布的资料,在研究菌株分子流行病学及进化方面优于PFGE和AFLP方法。 郭玉梅 周吉坤 张慧贤 秦丽云 赵冬 剧慧栋关键词:嗜肺军团菌 分子分型 SBT PFGE AFLP 石家庄市市售奶粉阪崎肠杆菌污染状况及阪崎肠杆菌基因型研究 李秀娟 徐保红 钟炜 白萍 高伟利 赵冬 田会方 李丽婕 宋红梅 通过对比分析奶粉中阪崎肠杆菌的不同检测方法,对石家庄市市售的配方奶粉和婴幼儿食品的阪崎肠杆菌污染情况进行了调查研究,以及采用生物分型、药敏分型、脉冲场电泳分型、多位点序列分型及16SrDNA序列分型分型方法对阪崎肠杆菌进...关键词: 自动化工作站在脊髓灰质炎抗体水平监测中的应用 2010年 采用微量中和试验检测脊髓灰质炎(脊灰)抗体,需多梯度稀释血清和转板加样,工作量大。现以检测脊灰I型抗体为例,设计高效、节省的全自动工作站程序模式,完成检测任务。1材料与方法1.1仪器全自动工作站(Tecan Freedom EVO-100,瑞士TECAN公司), 刘维华 张双宅 张国平 张弘 赵冬关键词:脊髓灰质炎 中和抗体 钢铁厂冷却塔水嗜肺军团菌分离株分子流行病学研究 被引量:1 2017年 目的调查某钢铁企业冷却塔水嗜肺军团菌的污染状况及分子流行病学特征,为预防控制军团菌病的传播提供科学依据。方法 2011年3月—2012年9月,对石家庄市某钢铁厂车间冷却塔水进行监测,分离培养嗜肺军团菌,对得到的菌株进行血清分型、毒力基因检测(lvh、rtxA)和多位点序列分型研究。结果 182份冷却塔水中有67份检出嗜肺军团菌,检出率为36.8%;共分离培养得到菌株84株,包括7种血清型,其中LP1型占63.1%(53/84)、LP6型占19.0%(16/84)。lvh和rtxA基因检测阳性的分别有79株和83株,二者均为阳性的有78株。多位点序列分型可分为32个型,SBT1型占36.9%(31/84),为主要优势型别,有21个型别为首次发现。结论钢铁企业冷却水存在嗜肺军团菌污染,携带有毒力基因,血清型和SBT型呈多样性分布。 赵冬 柏佳宁 王蕾 李丽婕 李丽萍 高伟利 吕国平 徐保红关键词:嗜肺军团菌 毒力基因 多位点序列分型