上海海洋大学海洋科学学院大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 发文基金：国家自然科学基金教育部重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学更多>>
- 长期低氧胁迫下斑马鱼的卵巢转录组特征分析被引量：1
- 2021年
- 为探明低氧胁迫对雌性性腺发育的影响,本研究针对常氧与长期低氧胁迫下的斑马鱼卵巢组织进行转录组测序,研究长期低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼卵巢组织的转录组和基因表达谱差异。低氧与常氧卵巢差异表达显著的基因总数为675个,其中381个基因在低氧卵巢中显著下调,294个基因在低氧卵巢中表达量显著上调。对差异表达显著的基因进行GO聚类,主要富集在胰岛素样生长因子结合、细胞因子活性、细胞黏附分子结合等7个GO项目上。对低氧与常氧斑马鱼卵巢进行组织切片观察后发现,与常氧斑马鱼的卵巢相比,长期低氧胁迫后的斑马鱼卵巢的卵母细胞数目更少且发育较慢。由此推测:长期低氧胁迫可影响卵巢发育,从而影响卵母细胞的发育成熟。本研究结果为深入了解低氧环境对斑马鱼生长发育的影响提供了基础。
- 吴煜国林枫江守文贾若南蒋聪伍许强华
- 关键词：低氧胁迫斑马鱼卵巢转录组差异表达基因
- 独角雪冰鱼与其他三种南极鱼鳃组织的转录组差异分析
- 2021年
- 为探究血红蛋白缺失对免疫功能造成的影响,针对一种缺乏血红蛋白和功能性血红细胞的南极独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)和3种具有血红蛋白和血红细胞的南极鱼物种(伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)、博氏南冰■(Pagothenia borchgrevinki)和革首南极鱼(Notothenia coriiceps))的鳃组织进行转录组测序比较研究。结果表明:在参与比较的7498个基因中,2796个基因在南极冰鱼鳃中呈显著变化,其中,1584个基因在南极冰鱼鳃组织中的表达量显著降低,1212个基因表达量显著上升。差异基因的KEGG Pathway富集分析显示,33条与免疫和低氧相关的通路(如HIF-1信号通路)在南极冰鱼鳃中得到了富集。差异基因的GO富集分析也揭示出南极冰鱼在与免疫功能和红细胞发生相关的多个生物过程GO通路中(如免疫系统发育、稳态过程和造血或淋巴器官发育等)发生了富集。值得一提的是,在南极冰鱼鳃中表达量下降的基因(如gata1a,tfr1a,kmt2a,slc4a1a,myb,alas2,epor,slc25a37和metap2a等)中许多都与免疫功能和红细胞发生相关,这与南极冰鱼血红细胞发生受抑制相一致。可见,独角雪冰鱼与其他三种南极鱼鳃组织在免疫方面基因的表达差异显著,为揭示南极鱼类免疫机制的进化提供了参考资料。
- 王小彤李文豪林枫江守文翟万营吴智超许强华
- 关键词：免疫
