北京工业大学生命科学与生物工程学院
- 作品数：1,762 被引量：5,413H指数：26
- 相关作者：王存新曾衍钧陈慰祖戴乾圜李浒更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所军事医学科学院放射与辐射医学研究所中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金北京市科技新星计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学理学文化科学更多>>
- 基于时-频-空间域的运动想象脑电信号特征提取方法研究被引量：8
- 2014年
- 脑机接口(BCI)是在人或动物脑与外部设备间建立的直接连接通路,信号分析功能模块是其核心部分,其中特征提取算法的效果如何是脑电图(EEG)信号分析算法的关键。EEG信号本身信噪比低,传统的EEG特征提取方法存在着缺少空间信息,需要的特征量个数较多,分类正确率低等不足。针对以上问题,本文提出了一种基于小波和独立分量分析(ICA)的时间-频率-空间EEG特征的提取方法,分别用离散小波变换(DWT)和ICA提取时频域特征和空域特征。并用支持向量机(SVM)和遗传算法(GA)相结合的方法对提取的特征进行分类。实验对比结果表明,所提出的方法有效地克服了传统的时频特征提取方法空间信息描述不足等问题,对于2003年BCI竞赛数据datasetⅢ分析,最高分类正确率为90.71%。
- 王月茹李昕李红红邵成成应立娟吴水才
- 关键词：脑电图特征提取独立分量分析小波变换支持向量机
- HIV-1整合酶与芳香二酮酸类抑制剂相互作用的分子模拟研究被引量：2
- 2009年
- 用分子对接方法研究了一系列芳香二酮酸类抑制剂与HIV-1整合酶的识别及相互作用.结果表明,抑制剂结合到整合酶Asp64～Leu68,Thr115～Phe121,Gln148～Lys159和Mg2+所构成的口袋区,抑制机理与5CITEP相似.采用分子动力学模拟和MM/PBSA方法计算了芳香二酮酸类抑制剂与整合酶之间的结合自由能,计算结果与实验值相吻合,平均绝对偏差为3.6kJ/mol,体系范德华相互作用和溶剂化效应的非极性项是利于形成复合物的主要因素.相关性分析结果表明,结合自由能值与疏水相互作用有较强的线性相关(R=0.61),基于此,用多元线性回归方法给出了一个能较强预测芳香二酮酸类抑制剂与HIV-1整合酶的结合自由能预测模型,为后续基于抑制剂结构的抗HIV-1药物分子设计提供指导.
- 胡建平张小轶唐典勇常珊
- 关键词：整合酶分子设计
- 过亚硝酸根对DNA氧化损伤及其抑制作用研究
- 过亚硝酸根具有强细胞毒性,能够修饰DNA碱基、造成DNA单链断裂。本实验模拟生理条件（pH=7.4）,以脱氧鸟苷（dG）为研究对象,采用HPLC-EC检测ONOO-对dG的氧化损伤产物8-羟基脱氧鸟苷（8-OHdG）。实...
- 李芸罗云敬王云海钟儒刚
- 关键词：槲皮素
- 文献传递
- HIV-1整合酶与抑制剂LCA的结合模式及抗药性研究被引量：5
- 2007年
- Ⅰ型人体免疫缺陷病毒(HIV-1)整合酶(integrase,IN)是病毒生命周期中一个重要的酶,也是研究抗HIV新药的一个重要靶点.运用多构象分子对接和分子动力学(molecular dynamics,MD)模拟,研究了野生型整合酶核心区及G140S点突变的突变态整合酶核心区与抑制剂L-菊苣酸(L-chicoric acid,LCA)的结合模式,并基于该结合模式探讨了G140S突变态整合酶对抑制剂LCA的抗药性.结果表明:LCA结合到G140S突变态整合酶核心区中的位置与结合到野生型整合酶核心区的位置不同,结合位置的差异导致LCA抑制作用的部分丧失;IN功能Loop区的柔性以及Mg2+离子与三个关键残基D64,D116和E152之间的相互作用有助于IN发挥生物学功能;G140S突变态整合酶核心区中的E152与LCA的排斥作用、K159与LCA结合能力的变弱以及Y143指向IN的口袋区是产生抗药性的重要原因.这些模拟结果与实验结果吻合,可为基于IN的抗HIV药物分子设计提供一些有用信息.
- 胡建平常珊陈慰祖王存新
- 关键词：分子对接药物分子设计
- 基于小波分析和灰度纹理特征的乳腺X线图像微钙化点区域的提取被引量：11
- 2015年
- 目的乳腺癌的早期发现对患者意义重大。为帮助医生进行乳腺癌的早期检查和诊断,本文提出利用小波分析与图像纹理特征提取相结合的方法来提取乳腺X线图像微钙化点区域,在提高检查准确性的同时避免漏检误检。方法首先利用灰度共生矩阵所提取的能量、熵、对比度、相关性以及小波分解后得到的各层高频系数的方差、能量作为图像的特征向量,然后利用支持向量机进行训练建立最优分类模型。最后利用建立的最优分类模型实现乳腺X线图像微钙化点区域的提取并利用检出率和误检率对结果进行评估。结果使用临床数据进行验证,结果表明利用小波分析与图像纹理特征提取相结合的方法能有效提取乳腺图像中的微钙化点区域。结论基于小波分析和灰度纹理特征的乳腺X线图像微钙化点区域的提取方法比单一的图像纹理特征提取或小波分析等方法,提取的效果更好。另外,该方法设计简单,更易于实现乳腺癌的自动化诊断。
- 彭庆涛吴水才高宏建曹红光
- 关键词：灰度共生矩阵小波支持向量机
- 全二维气质技术解析馥郁香型白酒风味与质量品评关系被引量：7
- 2019年
- 采用液液萃取的前处理方法结合全二维气相色谱-四极杆质谱技术,建立了白酒挥发性香气成分的分析方法,以Rtx-WAX色谱柱(30 m×0.25 mm×0.25μm)为一维色谱柱、BPX-5(2.5 m×0.1 mm×0.1μm)为二维色谱柱组成柱系统进行分离,调制周期4.2 s,四极杆质谱扫描范围为35~320 u条件下,研究了馥郁香型白酒中的挥发性香气成分在全二维色谱中的分离规律,发现了化合物规律性分布特征。应用该方法在馥郁香型白酒基酒中共定性辨识出308种挥发性香气成分,主要包括酯类物质102种,醇类物质42种,酸类物质33种,醛类物质26种,酮类物质19种,其他物质86种。同时,运用此方法对市场上不同品评等级的馥郁香型白酒成品酒进行分析,对分析结果建立模型,并将色谱分析结果结合主成分分析的方法预测感官评级。结果显示,运用主成分分析法能够观测到市场上不同等级馥郁香型白酒的分类趋势,且结果与感官品评结果一致,该方法能够为工厂在白酒生产过程中等级评定环节提供理论指导。
- 常宇桐罗云敬钱承敬杨永坛史晓梅
- 关键词：液液萃取风味物质
- 医学图像非刚体配准技术研究进展
- 医学图像配准对提高临床诊断治疗水平、病情监测以及放射治疗和手术导航等具有重要的研究意义。医学图像配准技术主要包括刚体与非刚体两种类型，基于刚体的图像配准算法发展迅速已广泛应用于临床，非刚体图像配准技术尚在发展阶段。本文在...
- 王倩杨春兰吴水才
- 关键词：非刚体医学图像配准
- 一种心血管血流参数监护模块的研制
- 本文研制的心血管血流参数监护模块,利用容积血流脉搏波可以无创、连续、实时地获得心排出量、心脏指数、外周阻力等重要的心血管血流参数,解决了临床血流参数的实时、连续监护的难题。本模块由血氧探头获得光电容积脉搏波,经信号调理电...
- 王燕张松杨益民罗志昌
- 关键词：血流参数
- 文献传递
- 脉搏波在动脉内传播的非线性动力学模型
- 从血液流动的Navier-Stokes方程出发，通过理论推导建立脉搏波在动脉内传播的非线性动力学方程，该模型全面考虑了主动脉的大变形、脉动流、血液粘度、管壁形状这些非线性参数的影响。并经桡动脉处采集脉搏波、判波和求平均血...
- 张小军李晓阳张松
- 关键词：脉搏波非线性动力学心输出量NAVIER-STOKES方程脉动流
- 文献传递
- 原胶原分子间的交联结构拉伸力学特性的量子化学计算模拟被引量：1
- 2006年
- 目的了解成骨过程胶原分子组装结构的力学特性;方法采用量子化学计算软件模拟骨I型胶原中的赖氨酸残基-羟赖氨酸残基醛缩交联结构的拉伸力-位移关系。结果模拟结果显示:拉伸力-位移曲线为非线性;初始能量优化后,连接结构分子体系两α碳原子间的起始距离(两端无约束)为10.05?,伸长率达到约130%后,有一个较明显的转折,之后曲线斜率明显高于其前半段;断裂时长度为16.05?;断裂时力值达到最大,为5622pN;断裂发生在羟赖氨酸残基α碳原子和β碳原子间的单键;结论该研究结果为I型胶原分子二元交联结构(bivalentcross-link)的拉伸力学特性提供了一种理论预测,有待实验确证。
- 钟红刚马晓慧袁小龙王存新
- 关键词：量子化学计算
