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基因NAT1和bHLH110在提高水稻高温抗性中应用
本发明公开了一种基因NAT1和bHLH110在提高水稻高温抗性中应用,通过基因编辑技术获得高温抗性提高水稻材料。水稻基因NAT1的碱基序列如SEQ ID NO.1所示,基因bHLH110的碱基序列如SEQ ID NO.4...
刘建祥芦海平刘学欢
基于TCGA和GEO数据挖掘分析NAT1在结肠癌中的表达及预后意义
2022年
目的探讨结肠癌癌组织中N-乙酰化转移酶1(NAT1)的表达及其对结肠癌患者预后的影响。方法通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析NAT1 mRNA在33种肿瘤中的表达情况,并用人类蛋白质图谱(HPA)数据库的免疫组化结果验证NAT1蛋白在结肠癌中的表达。通过肿瘤基因图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库获得NAT1在结肠癌中的表达数据及相关临床特征参数,分析NAT1 mRNA表达水平与结肠癌患者的临床特征和总生存期(OS)的关系,并构建预后模型。采用基因集富集分析(GSEA)预测NAT1相关的基因通路。采用CIBERSORT分析NAT1与免疫浸润的关系。结果TIMER数据库分析结果显示,在13种肿瘤组织中NAT1 mRNA表达水平低于正常对照组织。TCGA数据库结果提示,结肠癌组织中NAT1 mRNA表达水平均明显低于正常对照组织或癌旁正常组织,差异均有统计学意义(均P<0.01),并在GSE44076、GSE44861和GSE73360中得到验证。HPA数据库的免疫组化结果提示,NAT1蛋白在结肠癌组织中呈低表达。TCGA数据库分析结果提示,NAT1 mRNA表达水平与结肠癌患者的N分期、M分期和stage分期均有关(均P<0.01)。NAT1高表达组患者OS均好于低表达组(均P<0.05)。单因素Cox分析表明,NAT1 mRNA表达水平是影响结肠癌患者OS的危险因素(P<0.05),并和其他危险因素构建列线图,同时使用校准曲线和ROC评估了预后模型的特异性和敏感性。选取本院确诊的35例结肠癌患者肿瘤组织作为肿瘤组,选取其癌旁正常组织作为对照组。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测NAT1表达水平,结果与数据库结果一致(P<0.05)。GSEA结果提示NAT1高表达样本上调抗坏血酸和醛糖酸盐代谢、戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化、淀粉和蔗糖代谢、卟啉和叶绿素代谢途径、视黄醇代谢、药物代谢相关酶等基因集,而下调糖胺聚糖生物合成途径、Hedgehog信号通路、基底细胞癌、ECM受体作用通路、神�
陈俊杰郭浩然施波陈国梁邰清亮侍新宇姚慧慧米秀伟王索孙金兵周迪远顾闻何宋兵
关键词:结肠肿瘤预后
基于生信数据库探析NAT1基因在结肠癌中的表达及临床意义
2021年
[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响。[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信息数据库(Oncomine、TCGA、CPTAC等)中有关NAT1的相关数据,对其进行生物信息学分析,对NAT1在结肠癌中的临床作用进行荟萃分析。[结果]443项有关NAT1的不同类型研究结果纳入Oncomine数据库,NAT1表达在肿瘤与其对照组织中有统计学差异的结果有37项,其中NAT1高表达的有12项,低表达的有25项。涉及到结肠癌的研究共有15项,且在结肠癌组织中均为低表达。涉及到NAT1在结肠癌和正常组织中的mRNA表达的样本共有565例。Oncomine数据库中9项研究数据集的二次分析结果表明NAT1在结肠癌中的表达低于正常组织(P <0.05)。TCGA数据库和CPTAC数据库提示NAT1在结肠癌中的mRNA和蛋白水平均呈现低表达(P <0.05)。另外,免疫组织化学显示NAT1在结肠癌组织中表达较弱或呈阴性,而在正常组织中表达较强或中等。NAT1表达和年龄、种族、性别、体重、肿瘤分期无关,而与肿瘤的组织病理分型可能存在一定相关性(P <0.05)。不仅如此,生存分析发现高表达NAT1的患者预后较好(P <0.05)。[结论]NAT1的mRNA和蛋白水平在结肠癌组织中呈现低表达,和结肠癌不良预后相关。
李丹余涛曾智吴杰兰昱宋伟
关键词:结肠癌生物信息学分析
Nat1基因作为筛选标记在卵菌遗传转化中的应用
本发明公开了Nat1基因作为筛选标记在卵菌遗传转化中的应用。本发明发现了一种可作为卵菌转化筛选标记的抗生素—诺尔丝菌素。本发明通过将可引起卵菌对诺尔丝菌素抗性的编码基因Nat1作为筛选标记,用于大豆疫霉转化时转化子的筛选...
王群青谭新伟邹珅珅
文献传递
MicroRNA-6744-5p promotes anoikis in breast cancer and directly targets NAT1 enzyme被引量:3
2020年
Objective:Anoikis is apoptosis that is induced when cells detach from the extracellular matrix and neighboring cells.As anoikis serves as a regulatory barrier,cancer cells often acquire resistance towards anoikis during tumorigenesis to become metastatic.MicroRNAs(miRNAs)are short strand RNA molecules that regulate genes post-transcriptionally by binding to mRNAs and reducing the expression of its target genes.This study aimed to elucidate the role of a novel miRNA,miR-6744-5 p,in regulating anoikis in breast cancer and identify its target gene.Methods:An anoikis resistant variant of the luminal A type breast cancer MCF-7 cell line(MCF-7-AR)was generated by selecting and amplifying surviving cells after repeated exposure to growth in suspension.Mi RNA microarray analysis identified a list of dysregulated miRNAs from which miR-6744-5 p was chosen for overexpression and knockdown studies in MCF-7.Additionally,the miRNA was also overexpressed in a triple-negative breast cancer cell line,MDA-MB-231,to evaluate its ability to impair the metastatic potential of breast cancer cells.Results:This study showed that overexpression and knockdown of miR-6744-5 p in MCF-7 increased and decreased anoikis sensitivity,respectively.Similarly,overexpression of miR-6744-5 p in MDA-MB-231 increased anoikis and also decreased tumor cell invasion in vitro and in vivo.Furthermore,NAT1 enzyme was identified and validated as the direct target of miR-6744-5 p.Conclusions:This study has proven the ability of miR-6744-5 p to increase anoikis sensitivity in both luminal A and triple negative breast cancer cell lines,highlighting its therapeutic potential in treating breast cancer.
Sharan MalagobadanChai San HoNoor Hasima Nagoor
关键词:ANOIKISMETASTASISNAT1
NAT1调控NF--κB/IL--1B信号通路促进Luminal型乳腺癌骨转移的机制研究
背景与目的:  乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,全球每年新发病例约100万例,死亡40万例;中国每年新发病例约27万例,死亡7万例,已成为威胁女性健康的第一杀手。肿瘤一旦发生转移,现有的治疗方法则很难控制疾病进展,转移...
赵铖龙
关键词:乳腺癌骨转移核因子ΚB白细胞介素1B
检测NAT1基因分型的引物和方法
本发明公开了一种检测与5‑氨基水杨酸(5‑aminosalicylic acid,5‑ASA)等药物代谢有关的NAT1(N‑acetyltransferase 1,NAT1)基因突变分型的引物和方法,其包括扩增检测核苷酸...
牛林梅裘振亚王淑一
文献传递
NAT1表观遗传修饰参与乳腺癌及他莫昔芬耐药的研究进展
越来越多研究显示表观遗传修饰是乳腺癌他莫昔芬(tamoxifen,TAM)耐药的研究新方向。NAT1不仅是参与TAM代谢的Ⅱ相代谢酶,而且可能是雌激素受体α(estrogen receptorα,ERα)阳性乳腺癌患者的...
孙红王果彭艳李泰霖曾樱蔡加琴朱院山
关键词:NAT1乳腺癌表观遗传修饰DNA甲基化
文献传递
纳豆牙孢杆菌NAT1发酵条件优化及对肉鸡免疫功能和生产性能的影响
肉鸡饲料中抗生素的添加,主要目的是防病促生长。而抗生素的添加引起了很多负面问题,最严重的当属耐药性的产生,耐药性导致大量细菌性疾病无法治愈,因为需要使用抗菌功能更强的抗生素,而我们对抗生素的研究速度远远跟不上细菌变异的速...
吕娟
关键词:纳豆芽孢杆菌肉鸡
纳豆芽孢杆菌NAT1发酵条件优化及对肉鸡免疫功能和生产性能的影响
肉鸡饲料中抗生素的添加,主要目的是防病促生长。而抗生素的添加引起了很多负面问题,最严重的当属耐药性的产生,耐药性导致大量细菌性疾病无法治愈,因为需要使用抗菌功能更强的抗生素,而我们对抗生素的研究速度远远跟不上细菌变异的速...
吕娟
关键词:肉鸡饲料纳豆芽孢杆菌发酵条件
文献传递

相关作者

季宇彬
作品数:1,189被引量:4,270H指数:31
供职机构:国家教育部
研究主题:细胞凋亡 抗肿瘤 抗肿瘤作用 甲苯二异氰酸酯 羊栖菜多糖
高世勇
作品数:227被引量:984H指数:21
供职机构:哈尔滨商业大学
研究主题:龙葵碱 细胞凋亡 羊栖菜多糖 荷瘤小鼠 抗肿瘤作用
马强
作品数:4被引量:3H指数:2
供职机构:国家教育部
研究主题:NAT1 N-乙酰基转移酶 活性 乙酰基转移酶 SGC-7901
苏怡君
作品数:6被引量:21H指数:3
供职机构:哈尔滨商业大学生命科学与环境科学研究中心
研究主题:HEPG2细胞 龙葵碱 NAT1 活性 HEPG2人肝癌细胞
汲晨锋
作品数:273被引量:1,075H指数:21
供职机构:哈尔滨商业大学
研究主题:多糖 羊栖菜多糖 高效毛细管电泳 芦笋多糖 抗肿瘤作用