焦真真
- 作品数：9 被引量：15H指数：2
- 供职机构：中国水产科学研究院珠江水产研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家现代农业产业技术体系建设项目广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 草鱼jam-a分子在胚胎幼鱼期及受GCRV感染PSF细胞的表达分析被引量：1
- 2019年
- 草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus, GCRV)可引发草鱼(Ctenopharyngodon idellus)出血病,导致高死亡率。草鱼吻端成纤维细胞(Grass carp snout fibroblast cells, PSF)是GCRV的敏感细胞系。JAM-A (Junctional adhesion molecule A)为免疫球蛋白超家族成员,是多种病毒的细胞受体。本研究在前期克隆到草鱼3种jam-a基因,命名为gcjam-a1,gcjam-a2和gcjam-a3。在获取ORF序列的基础上,利用qRT-PCR分析了3种gcjam-a在草鱼胚胎及幼鱼不同发育时期及PSF细胞中受GCRV(GD108株)感染前后的表达模式。结果显示,检测的13个胚胎及幼鱼发育时期中,gcjam-a1在未受精卵中高表达,在受精卵至出膜前的胚胎表达水平均较低;从出膜后1~3 d表达量开始上升;出膜6~15 d均呈高水平表达。gcjam-a2与gcjam-a3在草鱼胚胎及幼鱼发育各阶段表达水平较低。在无病毒感染的PSF细胞中,gcjam-a只有少量表达。受GCRV-GD108感染后,病毒S7基因在PSF细胞中的拷贝数随时间呈显著上调趋势,gcjam-a的表达量也有不同程度的上调,mR NA上调水平为gcjam-a1>gcjam-a2>gcjam-a3。本研究证实了3种gcjam-a基因在PSF细胞中的表达均与GCRV-GD108感染相关,其中,gcjam-a1的表达水平受GCRV-GD108感染影响最大,同时,它在孵化出膜后表达上升,推测它可能与病毒的感染更相关。gcjam-a1可作为下一步GCRV与宿主互作研究中的候选分子。
- 田园园焦真真孙成飞董浚键江小燕胡婕叶星
- 关键词：病毒受体
- 草鱼jam-a基因的克隆及表达分析被引量：4
- 2017年
- 该研究从草鱼(Ctenopharyngodon idellus)中克隆到3个jam-a(gcjam-a1,gcjam-a2,gcjam-a3)c DNA序列,并采用qRT-PCR分析其在健康草鱼9种组织中的表达模式以及受草鱼呼肠孤病毒(GCRV-GD108)感染后在草鱼6种组织中的表达变化。结果表明,克隆到的gcjam-a 3个分子编码294~295个氨基酸,均具有2个免疫球蛋白Ig结构域,包含典型的受体结合的D1结构域及与细胞膜结合的D2结构域。3个gcjam-a的D2结构域序列完全一致,而D1结构域序列则稍有差别。在健康草鱼9个组织中,gcjam-a1主要在血和脑中有较高表达,gcjam-a2主要在鳃中有较高表达,而在各个组织未检测到gcjam-a3表达。病毒感染后草鱼6种组织中,gcjam-a1、gcjam-a2、gcjam-a3在鳃中均出现显著上调表达,而在肝脏、脾脏、肠、肾、脑中只有gcjam-a1有不同程度诱导表达上调。该研究表明在健康草鱼组织中,3个gcjam-a中以gcjam-a1的表达量最高,且在受病毒感染后所检测的6种组织中均出现表达上调,推测其可能为GCRV-GD108的主要受体。
- 田园园焦真真董浚键董浚键孙成飞马冬梅
- 关键词：草鱼QRT-PCR呼肠孤病毒病毒受体
- 翘嘴鳜3个不同群体的遗传多样性分析被引量：10
- 2017年
- 本研究采用微卫星分子标记技术分析翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)3个群体,包括广东(GD)与安徽(AH)的养殖群体、湖南(HN)的野生群体的遗传多样性及遗传结构。采用PCR和聚丙烯酰胺凝胶电泳法从源自Gen Bank的30对微卫星引物筛选出10对具有特异性和多态性的引物,用于上述3个群体共162个个体的PCR扩增。使用LED诱导荧光检测系统对扩增产物进行毛细管电泳,Q-ANALYZER软件对电泳结果进行分型,结果显示各微卫星位点均有较高的多态信息含量(PIC=0.445~0.895),各群体的遗传多样性水平较高(期望杂合度He=0.689~0.730)。群体间存在较高的基因流(平均基因流N_m=6.040)。群体遗传分化指数(F_(ST))分析显示,总体遗传分化水平较低(F_(ST)=0.046 7),群体间遗传分化为中低水平(F_(ST)=0.034 5~0.060 4)。AMOVA分析显示群体间遗传变异仅占4.67%,群体内遗传变异占95.33%。群体间UPGMA系统进化分析显示,GD群体与HN群体聚为一支,AH群体单独聚为一支。个体间UPGMA系统进化树显示3个群体个体排列呈镶嵌式,未出现明显的地理群体分支,且STRUCTURE群体结构分析显示各群体均可被分为亚群Ⅰ和亚群Ⅱ(K=2),说明群体间的遗传关系较近。综上所述,所分析的广东、安徽与湖南3个翘嘴鳜群体间的遗传变异程度较低,群体内遗传变异程度较高,各群体均具较高的遗传多样性,因此这3个群体均适合作为品种选育的基础群体。本研究结果为下一步翘嘴鳜优良品种选育方案的确立提供了依据。
- 曾庆凯孙成飞董浚键田园园师红亚焦真真叶星
- 关键词：翘嘴鳜微卫星
- 三种草鱼JAM-A分子的克隆及表达分析
- 本研究从已公布的草鱼转录组及基因组中获取3个草鱼(Ctenopharyngodon idellus)JAM-A(GcJAM-A1,GcJAM-A2,GcJAM-A3)基因序列,从草鱼中克隆到其cDNA序列,qRT-PCR...
- 田园园焦真真叶星董浚健孙成飞
- 关键词：草鱼QRT-PCR呼肠孤病毒病毒受体
- 文献传递
- 草鱼吻端成纤维细胞jam-a基因的表达分析
- 草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)可引发草鱼出血病导致高死亡率。草鱼吻端成纤维细胞(grass carp snout fibroblast cells,PSF)是GCRV的敏感细胞系。JA...
- 田园园焦真真孙成飞董浚健马冬梅叶星
- 关键词：QRT-PCR病毒受体
- 文献传递
- 草鱼成纤维细胞gcngr1基因的表达分析
- 2017年
- Ngr1(nogo-66 receptor)是在哺乳类上发现的一种神经元受体,可调节轴突的可塑性并抑制损伤中枢神经系统(CNS)的再生,最新研究还发现它是哺乳动物呼肠孤病毒(mammalian reovirus)的神经受体。草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)可引发草鱼(Ctenopharyngodon idellus)出血病导致高死亡率,开展GCRV受体相关研究可有助于了解病毒的致病机制。该研究在草鱼吻端成纤维细胞(PSF)中克隆到草鱼ngr1 c DNA序列(下文简称为gcngr1),发现其与哺乳动物呼肠孤病毒神经受体基因Ngr1有相似的结构序列;采用q RT-PCR方法检测该基因在PSF细胞的表达情况,结果显示受草鱼呼肠孤病毒(GCRV-GD108株)感染后gcngr1 m RNA的表达量显著上升,与病毒的增殖趋势基本一致;病毒经病毒抗体孵育后再感染PSF细胞,细胞中病毒的增殖水平下降,gcngr1m RNA的表达量也显著下降。该研究结果提示gcngr1与病毒的感染相关,为进一步分析gcngr1是否为GCRV神经元受体提供依据。
- 焦真真田园园孙成飞董浚键姜鹏叶星
- 关键词：草鱼QRT-PCR
