欧淑琼
- 作品数:5 被引量:15H指数:2
- 供职机构:湖南农业大学园艺园林学院茶学教育部重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金长沙市科技计划项目湖南省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学化学工程更多>>
- 茶树WRKY转录因子的鉴定与分析被引量:2
- 2017年
- 本研究以三个不同品种的茶树叶片转录组数据为材料,通过PAFM、SMART数据库对茶树WRKY转录因子进行严格搜索与鉴定,得到45个茶树WRKY转录因子,利用生物信息学的方法分析了茶树WRKY蛋白的一级结构性质、分类、系统发生学和保守结构域等特征。结果表明,茶树基因组至少存在45个以上的WRKY转录因子,氨基酸数在44~613之间,部分WRKY不稳定,约占11%;根据WRKY结构域的数量及锌指结构特征可将其分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ三大类,GroupⅡ可分成多个亚类,有部分成员的七肽保守域和锌指结构域发生了突变;三级结构显示,茶树WRKY蛋白保守结构域含5个β折叠。采用比较转录组学的方法研究了茶树WRKY转录因子的表达模式,结果表明,不同茶树品种间存在较多的差异WRKY基因,有的呈显著上调表达趋势,有的下调表达;该研究是茶树WRKY基因进化及功能研究的理论基础,对进一步揭示不同茶树品种间差异性状的形成机理和转录调控机制具有重要意义。
- 罗勇陈丝欧淑琼石玉兰郑楚楚刘仲华王坤波王坤波
- 关键词:茶树WRKY转录因子生物信息学
- 茶树CsMYB-like基因的克隆及表达分析被引量:2
- 2021年
- MYB是一类重要的转录因子,广泛参与植物生长发育、次生代谢调控和非生物胁迫响应等生物学过程。本研究从茶树中成功克隆了一条CsMYB-like转录因子,CDS序列全长为1113 bp,编码370个氨基酸。生物信息学分析表明其与蓝果树(Nyssa sinensis)、葡萄(Vitis vinifera)等MYB-like氨基酸序列有较高的相似性。亚细胞定位分析表明CsMYB-like基因编码的蛋白主要定位于细胞核。实时荧光定量PCR结果表明,CsMYB-like基因在不同的茶树品种中表达量不同,并且在不同浓度的纳米硒肥处理下表达有差异,在稀释100、200和300倍处理下,该基因的相对表达量分别降低了71.7%、90.3%和51.3%,而400倍处理对该基因的表达无显著影响,表明一定浓度的纳米硒肥能显著抑制CsMYB-like基因的表达。
- 宋小凤唐倩罗勇欧淑琼李勤李勤王坤波
- 关键词:茶树亚细胞定位
- 茶树花中多酚浸提工艺的优化研究被引量:6
- 2020年
- 茶树花含有丰富的多酚、多糖、黄酮、茶皂素等功能成分,具有多种生物学功能,如抗氧化、清除自由基和调节血脂血糖等,被国家卫生部批准为新资源食品,然而目前对茶树花资源的研究还很有限。为了利用茶树花中的茶多酚,通过单因素试验与正交试验,研究时间、温度、乙醇浓度和料液比等因素对茶多酚浸提率的影响,确定茶多酚最佳浸提条件为:浸提时间30 min、温度80℃、乙醇浓度40%、料液比1∶30,该条件下茶树花中多酚的浸提率可达15.03%。
- 欧淑琼唐倩李媛戴家鑫王坤波
- 关键词:茶树花茶多酚浸提正交试验
- 基于RNA-Seq的茶树CsMYB生物信息学分析被引量:5
- 2017年
- 作为植物中最大的转录因子家族之一,MYB参与多种生物学过程,本研究基于RNA-Seq技术,对获得的一条茶树MYB Unigene,将其命名为CsMYB。采用生物信息学的分析方法,对CsMYB基因片段氨基酸序列同其它植物间相应片段进行同源性和系统进化分析,并进行该基因编码蛋白的理化性质和结构功能预测,结果表明:CsMYB基因编码的蛋白含315个氨基酸,是一种亲水性蛋白,定位于其它细胞器,该蛋白不存在信号肽,是一种非分泌蛋白;其编码的氨基酸序列与葡萄的同源关系较近,与豆科植物的同源关系较远;功能结构分析表明其20~127位氨基酸之间含2个保守的HTH-MYB类型结构域,归属于R2R3-MYB家族;二三级结构分析表明CsMYB主要由无规则卷曲和α-螺旋组成,空间结构主要是螺旋和转角。分析茶树基因组MYB基因的表达模式,发现不同茶树品种间大部分差异MYB基因表达呈显著上调趋势,少部分下调表达。
- 罗勇欧淑琼陈丝石玉兰郑楚楚刘仲华王坤波黄建安
- 关键词:转录组转录因子生物信息学
- 茶树分子遗传图谱的研究进展
- 2017年
- 简要概述了茶树分子遗传图谱构建方法和国内外茶树分子遗传图谱研究进展,并由此提出构建高密度茶树分子遗传图谱的措施,为茶树分子遗传图谱的构建提供参考。
- 石玉兰郑楚楚陈丝欧淑琼彭靖王坤波
- 关键词:茶树分子标记